| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2674542 | 69 (1.100) | 6 (0.100) | 3/238 | NT | 8.2% | intergenic (‑21/+247) | ptsG/ilvB2 | PTS family glucose/glucoside (glc) porter component IIABC/pyruvate oxidase |
| ? | CP000730 | = 2674577 | 71 (1.220) | intergenic (‑56/+212) | ptsG/ilvB2 | PTS family glucose/glucoside (glc) porter component IIABC/pyruvate oxidase | |||||
AAATACCAGCTGCTGGTAAAATCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTATCATCAAT > CP000730/2674404‑2674681 | aaaTACCAGCTGCTGGTAAAATCGCAACAGGTAACATTAATGCTTAAACGATACGTTGCAACAGCCACAACAATTTCTTAAACAGATAAACTTCAACCCTTTCAATTTCCGCTTCAATGTACAAAAACAGCTGCCATaaa > 2:286030/1‑140 (MQ=16) aGCTGCTGGTAAAATCGGAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAacaaacaa < 2:284116/140‑1 (MQ=255) gctgctGGTAAAATCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAg > 1:515634/1‑140 (MQ=255) ctgcagGGAAAATCGCAACAGGTAACATTAATGCTCTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCATTTTCCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGa < 2:237264/140‑1 (MQ=25) ggTAAAATCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACTATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCAGGAACAAACAAGAATAtt > 2:634596/1‑140 (MQ=255) ggTAAAATCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTAtt > 2:146882/1‑140 (MQ=255) aaaaTCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGGCCAAACAATTTCTTAACCATATAAACATCACCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAACAAGCAGCCATGCACAGACAAAACAACtctc > 1:356525/1‑140 (MQ=37) aTCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCCGGCTTGAACAAACACGACTATTCTCATa > 2:542889/1‑140 (MQ=255) tCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCACAGATACACTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAACAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAg > 1:281951/1‑140 (MQ=255) ggaacaTTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAACCATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAgcaaacaaccgcactatgagaatagtcttgt < 1:128618‑M1/138‑32 (MQ=255) gTAACAGTAATTCTTTACCGATAAGTTCCAATTTTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAgcaaacaaccgcactatgagaatagtcttgt < 1:55333‑M1/140‑32 (MQ=255) taTTAATTCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGc < 2:326488/139‑1 (MQ=255) cactAATGCTTGACCGAGACGTTTCAATTGTCCAAACAATTACTTCAACATATAATCATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACCATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGc < 2:618830/137‑1 (MQ=255) cATTAATTCTTTACCGATACGTTCCACTTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATACACATCCCCTATCTCAATTTCCGCCTCCGTGTACATAAAAAGCTGGCATGAACAAGTAAGACTATTCTCCTAGTGCTTTTGTTTGc < 2:76799/140‑1 (MQ=255) aTTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCCTAGTGCGGTTGTTTGCt < 2:424036‑M2/140‑2 (MQ=255) tcaatgCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCCTGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAATACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCtc > 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aaaCATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATCCATAGCtattat > 2:97866/1‑140 (MQ=255) aaCATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATtata > 1:81675/1‑140 (MQ=255) aCATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATAc > 2:298174/1‑140 (MQ=255) cATCCCCTATCTCAATTTCAGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTGCCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGATCTTATACa > 1:322338/1‑140 (MQ=255) ccccTATCTCAGTGTCCGCTTCAATGTACAAAAATAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACatat < 1:490426/140‑1 (MQ=255) ccccTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACatat > 2:261991/1‑140 (MQ=255) 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1:320741‑M2/140‑96 (MQ=255) aGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCtcatgcctgctttttttgtacatggaagcggaaattgagataggggatgtttatatgtttaagaaattgtttggacaattgcaacgtatcggtaaag < 1:145124‑M2/140‑98 (MQ=255) ggCATGAgcaaacaaccgcactatgagaatagtcttgtttgttcatgcctgctttttttgtacatggaagcggaaattgagataggggatgtttatatgtttaagaaattgtttggacaattgcaacgtatcggtaaagc > 1:471530‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAATAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTatc > 2:406908/1‑140 (MQ=255) ggCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTatc > 1:319970/1‑140 (MQ=255) ggCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTatc < 2:81675/140‑1 (MQ=255) ggCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTatc > 1:33322/1‑140 (MQ=255) gCATGAgcaaacaaccgcactatgagaatagtcttgtttgttcatgcctgctttttttgtacatggaagcggaaattgagataggggatgtttatatgtttaagaaattgtttggacaattgcaacgtatcggtaaagca > 2:327345‑M1/1‑6 (MQ=255) tGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTAtcatca > 2:721799/1‑140 (MQ=255) ggagcaaacaaccgcactatgagaatagtcttgtttgttcatgcctgctttttttgtacatggaagcggaaattgagataggggatgtttatatgtttaagaaattgtttggacaattgcaacgtatcggtaaagcatta < 2:270216‑M1/139‑138 (MQ=255) gAgcaaacaaccgcactatgagaatagtattgtttgttcatgcctgctttttttgtacagggaagcggaaattgagataggggatgtttatatgtttaagaaattgtttggacaattgcaacgtatcggtaaagcattga > 2:492505‑M1/1‑2 (MQ=255) gAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTATCATCaa < 1:382307/140‑1 (MQ=255) agcaaacaaccgcactaggagaatagtcttgtttgttcatgcctgctttttttgtacatggaagcggaaattgagataggggatgtttatatgtttaagaaattgtttggacaattgcaacgtatcggtaaagcattaat < 2:424036‑M1/140‑140 (MQ=255) | AAATACCAGCTGCTGGTAAAATCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTATCATCAAT > CP000730/2674404‑2674681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |