| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2674542 | 69 (1.100) | 6 (0.100) | 3/238 | NT | 8.2% | intergenic (‑21/+247) | ptsG/ilvB2 | PTS family glucose/glucoside (glc) porter component IIABC/pyruvate oxidase |
| ? | CP000730 | = 2674577 | 71 (1.220) | intergenic (‑56/+212) | ptsG/ilvB2 | PTS family glucose/glucoside (glc) porter component IIABC/pyruvate oxidase | |||||
CATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTATCATCAATTCAGTACGATCATTTGTGATAAATAAACAAAACGG > CP000730/2674438‑2674716 | taTTAATTCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGc < 2:326488/139‑1 (MQ=255)cactAATGCTTGACCGAGACGTTTCAATTGTCCAAACAATTACTTCAACATATAATCATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACCATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGc < 2:618830/137‑1 (MQ=255)cATTAATTCTTTACCGATACGTTCCACTTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATACACATCCCCTATCTCAATTTCCGCCTCCGTGTACATAAAAAGCTGGCATGAACAAGTAAGACTATTCTCCTAGTGCTTTTGTTTGc < 2:76799/140‑1 (MQ=255) aTTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCCTAGTGCGGTTGTTTGCt < 2:424036‑M2/140‑2 (MQ=255) tcaatgCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCCTGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAATACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCtc > 2:492505‑M2/3‑138 (MQ=255) tAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCtcc < 2:270216‑M2/140‑4 (MQ=255) tGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCtcatgc > 2:327345‑M2/1‑134 (MQ=255) gCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCtcatgcc > 1:471530‑M2/1‑133 (MQ=255) cGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTa < 1:687979/140‑1 (MQ=255) aCGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAg > 2:492804/1‑140 (MQ=255) cGTTGTAATGGGCCAAACAATTTCTTAAACATATTAACATCCCCTATCTTAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGTATGAACATACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGt < 2:12954/140‑1 (MQ=255) ttGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAATATATAAACATCCCCTATCTCAATCTCCGCTTCCCTGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTaa < 2:253740/140‑1 (MQ=255) tGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAac < 1:402536/140‑1 (MQ=255) tGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAac < 1:286030/140‑1 (MQ=255) aaTTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTGCGTGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACg < 1:601372/140‑1 (MQ=255) tCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTAGCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGt < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |