| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 864131 = | 93 (0.900) | 4 (0.040) | 3/254 | NT | 4.1% | coding (321/459 nt) | USA300HOU_0807 | hypothetical membrane protein |
| ? | CP000730 | 864198 = | 94 (0.930) | coding (388/459 nt) | USA300HOU_0807 | hypothetical membrane protein | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GACATACTTATGTGTGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACGGAGGACAATTTA > CP000730/864058‑864336 | gACATACTTATGTGTGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATGGttatta > 2:619938/1‑141 (MQ=255) aCATACTTATGTGTGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACAGTGCCAATTTTAATTGTtattat < 2:74102/141‑1 (MQ=255) tccacgtATGGGTGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATGAAATCGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATGGCCAATTTTAATTGTTATtata < 2:1110480/135‑1 (MQ=255) tACTTATGTTTGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAgg < 2:121383/141‑1 (MQ=255) ttATGTGAGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAGATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGACCACCGTGCGTACTTAACATTACCACTTTTAATTGGTCTTATAGGTTc > 2:267798/1‑141 (MQ=255) tATGTGTGGTGGTTTATGTTTGCAGTATATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCg < 1:510821/141‑1 (MQ=255) aTGTGTGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCgg > 1:408614/1‑141 (MQ=255) tgtgGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTg < 1:159632/141‑1 (MQ=255) gtggtgGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGc > 2:954501/1‑141 (MQ=255) ggtggtTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCATGCAATAAAAGCTGCACTCGTTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCAt < 1:279423/141‑1 (MQ=255) ggtggtTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCAt < 1:235403/141‑1 (MQ=255) gtggtTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAACCAGTTTTTTTACGTTGATTAATTTATCAACCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCAtt < 1:985311/141‑1 (MQ=255) aTGTTTGCAGTTTAAGTATGAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCATTTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGAtt > 1:779469/1‑141 (MQ=255) tGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGAttt < 1:1123759/141‑1 (MQ=255) tGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTACACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTatat > 1:1124516/1‑141 (MQ=255) tagaaacaacaagcatataaatcgctaatgcaaccgaacctatAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGc > 1:1197976‑M1/44‑141 (MQ=255) cAGTTTATGTATCAAATAGTTTGGTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGc < 2:151122/141‑1 (MQ=255) aGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCACTAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCt < 2:790050/141‑1 (MQ=255) tttATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGACTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCttg < 2:756608/141‑1 (MQ=255) ttaaTGTATCAGATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAAGCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTGAACGGTGCCAATTTTAATTGTTAGTATAGGTTCGGTTGCAGTAGCGATTTATATGCttg < 2:179511/138‑1 (MQ=255) ttATGTATCAAATATTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATCGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCttgt < 1:819304/141‑1 (MQ=255) aacaacaagcatataaatcgctaatgcaaccgaacctatAATCACAATTCAAGCAATAATAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTCGCGATTTATTTGCatgt < 2:800835‑M1/102‑1 (MQ=255) aacaacaagcatataaatcgctaatgcaaccgaacctatAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGGGTACTAAACATTACCAATTTTAATTGTTGTTATAGGTTCGGTTGCATgaccgatttattgccatgt < 2:63638‑M1/102‑9 (MQ=255) tATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTCGCGCTTTATATGCttgtt > 2:442731/1‑141 (MQ=255) acatggcaataaatcggtcatgcaaccgaacctataacaacaattaaaattggtaatgtttagtacccaccgtgtgcagcttttattgcttgaattgtgattATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTgttgtt < 2:63638‑M2/39‑1 (MQ=255) acatgcaaataaatcgcgaatgcaaccgaacctataataacaattaaaattggcaatgttaagtacgcaccgtgtgcagctattattgcttgaattgtgattATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTgttgtt < 2:800835‑M2/39‑1 (MQ=255) aTCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGGAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTc > 2:775057/1‑141 (MQ=255) gcatataaatcgctaatgcaaccgaacctataataacaattaaaattggcaatgttaagtacgcaccgtgtgcagcttttattgcttgaattgtgattATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTa > 1:1197976‑M2/99‑141 (MQ=255) aGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATaaaa > 2:833441/1‑141 (MQ=255) tttggttACGTTGAGTAACTTATCAATTACAATTCAAGCACTAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTGGTTGTTTCTATCAAACg < 2:313962/141‑1 (MQ=255) ttgtttACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGt > 1:787939/1‑141 (MQ=255) ttgtttACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATCTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGt > 1:1076320/1‑141 (MQ=255) tgtttACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTa < 2:409698/141‑1 (MQ=255) gtttACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTaa > 2:442867/1‑141 (MQ=255) gTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTAc < 1:676190/141‑1 (MQ=255) gTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTAc < 1:85904/141‑1 (MQ=255) gTTGATTAACCTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTTTCAAACGTAAAAGTAc < 1:1134099/141‑1 (MQ=255) ttGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACa < 1:899909/141‑1 (MQ=255) ttGATCAATTTATCAACCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACa < 1:245694/141‑1 (MQ=255) tGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACAt < 1:32074/141‑1 (MQ=255) aTTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACAttt > 1:492902/1‑141 (MQ=255) tttATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTGTATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCg > 1:895617/1‑141 (MQ=255) tttATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACTTAAAAGTACATTTAATCg > 2:953319/1‑141 (MQ=255) tttATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACCTTTAAtac > 2:738004/1‑139 (MQ=255) tttATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCg > 2:953294/1‑141 (MQ=255) tttATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCg > 1:256356/1‑141 (MQ=255) ttATCAATCACAGTTCAAGCAATAAAAGCTGCAGACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGCTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACATAAAAGTACATTTAATCGc < 2:668499/141‑1 (MQ=255) tcaatcaCACTTCATGCATTAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTTGCGCTCTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGAAAAAGCACATATAGTCGGTAg > 2:375160/1‑141 (MQ=255) tcaatcaCAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATGGCTAg > 2:929302/1‑141 (MQ=255) tcaatcaCAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTaa > 2:738311/1‑140 (MQ=255) TCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGaaaa < 1:914381‑M1/141‑1 (MQ=255) ctcaATTCAAGCAATAAAAGCTGCACTCGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATTTCTAGAAAAt < 1:877573/139‑1 (MQ=255) cacaATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAAt > 2:930790/1‑141 (MQ=255) cacaATACAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTATGAAGTCCGAGTTGAAGTGTTATTATAGGTTCGGTTGCAATAGCGAATTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAAt > 2:493143/1‑141 (MQ=255) acaATTCATGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAAtt < 1:843108/141‑1 (MQ=255) caATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTg > 1:125296/1‑141 (MQ=255) aaTTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTCTATATCAAACGGAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGa > 1:1116172/1‑141 (MQ=255) aTTCAAGCACTAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTCTCAAACGTCAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATCGAt > 2:804860/1‑141 (MQ=255) aTTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGAt > 1:1082150/1‑141 (MQ=255) cAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGAtttt > 1:696237/1‑141 (MQ=255) aaTAAAAGCTGCACACGGTTCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACaa < 2:1036244/141‑1 (MQ=255) aaTAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACaa < 2:768144/141‑1 (MQ=255) aaTAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACaa < 1:942184/141‑1 (MQ=255) aaTAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTCACTTTAACaa < 2:437022/141‑1 (MQ=255) aaTAAAAGCTGCACACACTCCGTACTTAACTTTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTATATTTAATCGCTAGAAAAGTGATTTTAActa < 2:1146155/141‑3 (MQ=255) tAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATCTTAATGGTTGTTGGAGGGTCGGTTGCATTAGCGGTTGAGATGCTTGTTGTTTCTATCAAAGGGCACAGTACATTTAATCGCTAGAGAATTGATTTTAACAATa > 2:338022/1‑141 (MQ=255) aaaGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATaaa < 1:253976/141‑1 (MQ=255) aaGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATaaaa > 1:221711/1‑141 (MQ=255) aaGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATaaaa < 2:627618/141‑1 (MQ=255) gCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTCTAGGTAAGAATGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTGAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAat > 1:693274/1‑141 (MQ=255) gCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAat < 1:413710/141‑1 (MQ=255) cTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAata > 2:938314/1‑141 (MQ=255) acacaCGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATg < 2:1124516/140‑1 (MQ=255) cacaCGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTACTTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGa < 1:471841/141‑1 (MQ=255) cacaCGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGa > 1:938990/1‑141 (MQ=255) cacaCGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATAGGa > 2:942785/1‑141 (MQ=255) ggTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATGAAAATATGATAtac < 1:639841/141‑1 (MQ=255) gTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATAtact < 1:643773/141‑1 (MQ=255) gCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAGACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATAtactac < 2:947779/141‑1 (MQ=255) gCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTATTCTTACTTTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATAtactac > 1:929020/1‑141 (MQ=255) gCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTGGCATTAGCGATTTATGTGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGATAGAAACTTGATATTCACAATAACAATATGATAgactac > 1:245970/1‑141 (MQ=255) gTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTATCAATAAAAATATGATATACTACtt < 1:873674/141‑1 (MQ=255) gTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTATCAATAAAAATATGATATACTACtt < 1:874063/141‑1 (MQ=255) tACTTAACATGGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACACTACAAATATGATAtacgacaag < 2:897154/141‑4 (MQ=255) aCTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGt < 2:7577/141‑1 (MQ=255) aCTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGt < 1:838277/141‑1 (MQ=255) aCTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGt < 2:859075/141‑1 (MQ=255) aCTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGt < 2:102030/141‑1 (MQ=255) ttGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAAGCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATATAAATATGATATACTACTTGTCGtatata < 1:775057/141‑1 (MQ=255) tGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACGTGTCGTATATaa < 2:939674/141‑1 (MQ=255) ccAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAgg < 2:408614/141‑1 (MQ=255) aaTTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGATGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTCTATAAGGaa > 2:122685/1‑141 (MQ=255) aTTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTCCTTGTCGTATATAAGGAAc > 2:338512/1‑141 (MQ=255) tttAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACgg < 1:403380/141‑1 (MQ=255) tttAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACgg < 1:1075997/141‑1 (MQ=255) aattgtgattAAAGGTTCTGTTGCATTAGCGATTTACATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGAAAAAAAAAAAAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACggagg < 2:663832‑M2/131‑1 (MQ=255) aaTTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACggagg < 1:652613/141‑1 (MQ=255) aTTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATGAAAGAATTATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACggcgga > 1:29419/1‑141 (MQ=255) aTTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACggagga > 1:96149/1‑141 (MQ=255) ttATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATCTATATGCTTGTTGTTTCTATCAATCGTAAAAGATTATTTAATCGCTCGAAAATTGATTTTAGTGATAATAATATGATATACTACTTGTCGTATATaaggaacggaggagacttga > 2:472887‑M2/3‑134 (MQ=255) | GACATACTTATGTGTGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCTATCAAACGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACGGAGGACAATTTA > CP000730/864058‑864336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |