| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1744053 | 92 (0.890) | 3 (0.030) | 3/246 | NT | 3.6% | intergenic (‑307/+100) | relA2/apt | GTP pyrophosphokinase/adenine phosphoribosyltransferase |
| ? | CP000730 | = 1744121 | 75 (0.770) | intergenic (‑375/+32) | relA2/apt | GTP pyrophosphokinase/adenine phosphoribosyltransferase | |||||
TATGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATAC > CP000730/1743981‑1744256 | tgtGAAATAAATAAACGATGTTATTATGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATAAATTtgatga < 1:878419/139‑1 (MQ=255)tATGAAATAAATAAACTATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTtgatga < 1:236067/141‑1 (MQ=255)tATGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTtgatga < 1:205128/141‑1 (MQ=255)tATGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTAGAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTGACAACTCATGTTAAGAAAACTTAAACATCTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTtgatga < 1:795741/141‑1 (MQ=255) aTGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAa < 2:1194816‑M2/141‑2 (MQ=255) aTGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAa < 1:861682‑M2/141‑2 (MQ=255) tGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTATTTTTGTTTTTGGTTCTTATACATTTGATGAag < 2:1108760‑M2/141‑3 (MQ=255) tGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAag > 2:277357‑M2/1‑139 (MQ=255) tGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAag < 2:1086393‑M2/141‑3 (MQ=255) tGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCCCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTCATACATTTGATGAag < 2:380879‑M2/141‑3 (MQ=255) agaAATAAATAAACGATTTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAag > 2:1038626‑M2/2‑139 (MQ=255) actaaataaacgATGCTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAaggat > 2:230541‑M2/3‑136 (MQ=255) aataaataAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAaggat > 1:708928‑M2/1‑136 (MQ=255) ataaataaACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAaggatt < 2:923340‑M2/141‑7 (MQ=255) aataaaGGATGTTAGTAAGGTATGATTCTCAATCATCGAACATATTCCGTAAATAAAAAATGCTAACATCTAATGATAAGAAAGCTTAAACAACTCTTTTTATTAAGTCATGGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCa < 2:1000669/141‑1 (MQ=255) ataaaCGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCAt > 1:1103137/1‑141 (MQ=255) aaCGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTg < 1:1180451/141‑1 (MQ=255) aCGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAaggattttttattt < 1:397258‑M2/141‑15 (MQ=255) aCGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGa > 1:936309/1‑141 (MQ=255) aCGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGa > 1:936502/1‑141 (MQ=255) aCGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAATAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGa < 1:1036500/141‑1 (MQ=255) aCGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATAATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTgt > 1:773444/1‑140 (MQ=255) attaAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAatta > 1:968732/1‑141 (MQ=255) ttaAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAACCAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGTTGAAGGATTTCATTTGATAAAattat < 2:503149/141‑1 (MQ=255) ttaAGGTATAATACTCAATCATCTAACAGTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCGCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTACTGAAGGATTTCATTTGATAAAattat > 2:698781/1‑141 (MQ=255) aGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAattatatt < 1:607025/141‑1 (MQ=255) aGGTATAATGCTCAATCAGCTAACATTTTCAGTAAATAAAACACCCTTACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAattatatt < 2:895294/141‑1 (MQ=255) ggTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAattatatta > 1:1070542/1‑141 (MQ=255) taATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTAtattattta < 1:532605/141‑1 (MQ=255) aacgCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTAtattatttat < 2:474817/138‑1 (MQ=255) tGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTAtattatttatta < 1:1108760/141‑1 (MQ=255) gCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTAtattatttattat > 1:182530/1‑141 (MQ=255) gCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTAtattatttattat > 1:302918/1‑141 (MQ=255) gCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTAtattatttattat > 1:709973/1‑141 (MQ=255) gCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTAtattatttattat > 1:580780/1‑141 (MQ=255) cTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTGATTTGATAAAATTAtattatttattatt > 1:832823/1‑141 (MQ=255) tCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATtc < 2:1109897/141‑1 (MQ=255) cAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATtcg < 2:896549/141‑1 (MQ=255) tcatcTAACATTTTCAGTAAATAAAAGATCCTGACTTCTGATGTTAAGAAACCTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATGATATTATTTATTATtcgtcg < 1:749724/141‑1 (MQ=255) acatcTAACATTTTCCGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATtcgtcg < 1:327745/140‑1 (MQ=255) catcTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTcgtcgt > 2:892243/1‑141 (MQ=255) catcTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTcgtcgt > 2:452786/1‑141 (MQ=255) cTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAACATTATATTATTTATTATTCGTCGTATg > 2:91504/1‑141 (MQ=255) cTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATg > 2:142061/1‑141 (MQ=255) tAACATTTTAAATAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATga < 2:463426/141‑1 (MQ=255) aCATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATgaga > 1:346127/1‑141 (MQ=255) aCATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATGATTTATTATTCGTCGTATgagg > 1:449597/1‑140 (MQ=255) aCATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAAATTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGACGTATgaga > 1:917524/1‑141 (MQ=255) ttttCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAaggattttttatttactgaaaatgttagatgattgagcattataccttaaa < 1:1079730‑M2/141‑52 (MQ=255) cAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACt < 1:717341/141‑1 (MQ=255) gTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCa < 2:179954/141‑1 (MQ=255) aaataaaAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAaggattttttatttactgaaaatgttagatgattgagcattataccttaataacatcgt > 2:397258‑M2/1‑82 (MQ=255) ataaaAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAAAAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATCTTATTTATTATTCGTCGTTTGAGATTAAACTCATAAc > 1:703995/1‑141 (MQ=255) aaaTCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTATACTCATAACATCGt < 1:640809/141‑1 (MQ=255) aaaTCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAGACTCATAACATCGt < 1:640856/141‑1 (MQ=255) aaTCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATCCATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTa > 1:549977/1‑141 (MQ=255) tAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCtt < 2:734669/141‑1 (MQ=255) tAACAACTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCtt < 2:1092410/141‑1 (MQ=255) aCATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTa > 2:620989/1‑141 (MQ=255) tctcATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAAtt < 2:1103137/141‑1 (MQ=255) ctcATGTTAAGAAAACTTAACCAACTTTTTTAATTAAGTCATTGTTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTAGAGTATTTATTATTCGTCGTATCAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAAttt > 2:655625/1‑141 (MQ=255) gTTAAGAAAACTTATACCACTTTTTTACTTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCa < 2:789301/141‑1 (MQ=255) aaaCTTAAACAACTTTTTTAATTATTTCATTGGCTATTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATCATTTATTATTCGTCGTATGCGATTAAACTCATAACATCTACATCTTTAATTTTTTCATTATCAt > 2:455129/1‑141 (MQ=255) acttaacgcacTTTTATAAATATTTCATGTGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCAttt < 1:508300/132‑1 (MQ=255) tAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTaaa < 1:1110468/141‑1 (MQ=255) aaaCAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAat > 2:382618/1‑141 (MQ=255) caacTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATAtt < 2:1091482/141‑1 (MQ=255) aacTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATAttt > 2:1074254/1‑141 (MQ=255) aacTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTAATTTGATAAAATTATATTCTTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAAATAATGTCATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATAttt > 2:300662/1‑141 (MQ=255) acTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATttc < 1:142061/141‑1 (MQ=255) acTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATttc < 1:627142/141‑1 (MQ=255) acTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGAAGAAAGAATTCGGTCGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATttc < 1:91504/141‑1 (MQ=255) cTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATACttca < 2:830149/141‑1 (MQ=255) ttaattaaGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATttcaattca < 2:360543/141‑1 (MQ=255) aattaaGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTtcaattcaat < 2:846220/141‑1 (MQ=255) aattaaGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTtcaattcaat < 2:1091629/141‑1 (MQ=255) aattaaGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTtcaattcaat < 2:1183998/141‑1 (MQ=255) taaGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTAATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATCCAATTTAAATATTTCAATTCAATtat > 2:693123/1‑141 (MQ=255) aaGTCATTGTTTCTTATACATTTGATGAATGATTTCATTTTATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATtata < 2:1117180/141‑1 (MQ=255) aaGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGCTTTCATGTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATtata < 1:1116339/141‑1 (MQ=255) aaGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATtata < 1:606377/141‑1 (MQ=255) attCATTGGTTCTTAGGCATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATaa < 2:578737/139‑1 (MQ=255) aGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATAGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATTTCTCGTTTCTATTTTaa < 2:879986/141‑1 (MQ=255) gTCATTGGTTCTTATTCATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTCTTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACGTCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAGTATTTCAATTCAATTATaaa > 1:884781/1‑141 (MQ=255) aTTGGTTCTTATAAATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGc < 1:707137/141‑1 (MQ=255) gTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATa > 1:1024817/1‑141 (MQ=255) ttCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATAc > 1:325950/1‑141 (MQ=255) ttCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATAc < 1:924373/141‑1 (MQ=255) tCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATAcc < 2:967122/141‑1 (MQ=255) aTTTGATGAAGGTTTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTCCTACGa > 1:1173293/1‑141 (MQ=255) aTTTGATGAAGGATTTCATTTGATAACATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTCATTTTTTCAATCCCCTTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCCATTCCTACTCCgt > 1:80866/1‑140 (MQ=255) aTTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGa > 1:895428/1‑141 (MQ=255) aTTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGa > 1:267819/1‑141 (MQ=255) tgatgaAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCCTTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATAc < 2:659498/141‑1 (MQ=255) | TATGAAATAAATAAACGATGTTATTAAGGTATAATGCTCAATCATCTAACATTTTCAGTAAATAAAAAATCCTAACATCTCATGTTAAGAAAACTTAAACAACTTTTTTAATTAAGTCATTGGTTCTTATACATTTGATGAAGGATTTCATTTGATAAAATTATATTATTTATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATAC > CP000730/1743981‑1744256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |