BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	CP000730	512620 =	84 (1.330)	47 (1.090) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	34/178	NT	44.9%	intergenic (+688/‑173)	recR/rrs1	recombination protein RecR/16S ribosomal RNA
*	?	CP000730	1998278 =	NA (NA)	47 (1.090) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	34/178	NT	44.9%	intergenic (‑6/+5)	USA300HOU_t0050/rrf4	tRNA‑Val/5S ribosomal RNA

Only 100 of 162 total aligned reads displayed.

GGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512481‑512759

gggCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTa                                                                                                                                             >  1:250106/1‑140 (MQ=255)

 ggCGTTCAGTACAGATGACATAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaa                                                                                                                                            <  2:481502/140‑1 (MQ=255)

  gCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaa                                                                                                                                           >  1:394557/1‑140 (MQ=255)

  gCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaa                                                                                                                                           >  1:395852/1‑140 (MQ=255)

   cacctgttcccatgccgaacccagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaatttttgttaagaaataaaatggacaagataaaaaa                                                                                                                                          <  1:125705‑M1/4‑1 (MQ=255)

     ttCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAg                                                                                                                                        >  1:340612/1‑140 (MQ=255)

       cAGTACAGATGACAAAGGTGTAATCTGTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGtt                                                                                                                                      >  2:156320/1‑140 (MQ=255)

         gTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATAACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAt                                                                                                                                    >  1:272932/1‑140 (MQ=255)

             catgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaaaaaaaAAAAAATTATTGAc                                                                                                                                <  1:153447‑M1/14‑1 (MQ=255)

             catgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaatttaagttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGAc                                                                                                                                <  1:508979‑M1/14‑1 (MQ=255)

             aGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGAc                                                                                                                                <  1:686066/140‑1 (MQ=255)

              gattataaaGGTGTAATTTTTGCTGACGATAAGCAGTGTGAATGCCTGTATAGTATATATTTGTTGAGGCAAAAGTATCAACGCTATTCAAGAAATAACTTGAATTACTAATGCAAATTAATTTTAAAAAGTTaatccag                                                                                                                               <  2:368142/134‑7 (MQ=255)

              gATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACt                                                                                                                               <  2:262910/140‑1 (MQ=255)

                    aacacagacgttaagcttcttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                         >  1:85492‑M1/120‑140 (MQ=255)

                      aGGTGTAAGTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGTCTGTATAATATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                       <  1:416040/140‑1 (MQ=255)

                       ggTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTta                                                                                                                      >  2:616377/1‑140 (MQ=255)

                        gtgtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaa                                                                                                                     <  2:86564/140‑1 (MQ=255)

                         agaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttgggtaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTCTTGACTTAAATGGtaat                                                                                                                    <  2:453571‑M1/26‑1 (MQ=255)

                            agttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgctccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATaaa                                                                                                                 <  1:466795‑M1/29‑1 (MQ=255)

                            agttaagctccttagcgtcgatgatagtcaaaattactttgcgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatctaattttggttaaaaaataaaatggaaaaaaaaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATaaa                                                                                                                 >  2:225660‑M1/112‑140 (MQ=255)

                                 agctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGta                                                                                                            <  2:656908‑M1/34‑1 (MQ=255)

                                    gtgttgtTAAGCAGTTTGAAAGCATGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaa                                                                                                         <  2:128834/139‑1 (MQ=255)

                                    cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCACCCAAAGCAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAAGGAAAATAAATATTAAAAAGTTATTTAGGTAAATGTTAATAAAGTGTAtaa                                                                                                         >  1:421248/1‑140 (MQ=255)

                                    cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTTATAAAATGTAtaa                                                                                                         >  1:577955/1‑140 (MQ=255)

                                      gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt                                                                                                       >  1:68584/1‑140 (MQ=255)

                                       ttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTTAAAGTTGATAAAATggataaata                                                                                                      <  2:714266‑M1/40‑4 (MQ=255)

                                        tgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaa                                                                                                     <  2:340612/140‑1 (MQ=255)

                                           cgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggaaaagagaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTc                                                                                                  <  2:28543‑M1/44‑1 (MQ=255)

                                            gtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                 >  1:103862‑M1/96‑140 (MQ=255)

                                               gatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagtactttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTAGATAAAATATATAAATAATTCATGt                                                                                              <  1:322400‑M1/48‑1 (MQ=255)

                                               cAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGGATAATTAATTCTTGt                                                                                              >  2:74651/1‑140 (MQ=255)

                                                atggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAACAGCACATAAAATGTATAATTAATTCTTGTc                                                                                             >  1:719850‑M1/92‑140 (MQ=255)

                                                 tggtagtcgaacttacgctccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagacaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCg                                                                                            >  1:40896‑M1/91‑140 (MQ=255)

                                                  tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCgg                                                                                           >  1:586949/1‑140 (MQ=255)

                                                  tgtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCgg                                                                                           <  2:338867‑M1/51‑1 (MQ=255)

                                                  ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaatcaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTATTGTCgg                                                                                           <  2:233289‑M1/51‑1 (MQ=255)

                                                   ttGAAAGTCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  2:587257/140‑1 (MQ=255)

                                                    tagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa                                                                                         <  2:50223‑M1/53‑1 (MQ=255)

                                                      gtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                       <  1:501111‑M1/55‑1 (MQ=255)

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                                                      aaaGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGATTCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                       <  1:653902/140‑1 (MQ=255)

                                                      aaaGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATTATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                       <  2:705576/140‑1 (MQ=255)

                                                       gcgaacgtacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                      >  2:297951‑M1/85‑140 (MQ=255)

                                                        aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa                                                                                     >  2:553087/1‑140 (MQ=255)

                                                         gCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaaa                                                                                    <  1:250034/140‑1 (MQ=255)

                                                               ataGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                              <  2:624325/140‑1 (MQ=255)

                                                                taGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAAATACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATCATCAATCCTTGTAGGTAAGAAAAATGAAc                                                                             >  1:9682/1‑140 (MQ=255)

                                                                 aGTATTGATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAATTTAAGATATAACTTGAAATACTAACGAAAATAAATGTTAAAAAAGTATTGACTTAAATGTTAATAAAAAGTATAATTAATTCATGTCGGAAAGAAAAATGAACa                                                                            <  2:16460/140‑1 (MQ=255)

                                                                  ttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAt                                                                           >  1:177827‑M1/74‑140 (MQ=255)

                                                                    tcgttaaaggagaacgttgacaggcaggtttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                         >  1:103257‑M1/72‑140 (MQ=255)

                                                                    ccgacagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttagttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                         >  2:191656‑M1/72‑140 (MQ=255)

                                                                     tttatttGTTGAGGCAAACAAAACGACTGATGGGAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAATTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATGAATTCTTGTAGGTAAAAAAAATGAACATTGa                                                                        >  1:172867/1‑140 (MQ=255)

                                                                         tttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTACTTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc                                                                    >  2:465830/1‑140 (MQ=255)

                                                                           tgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                  >  1:546009/1‑140 (MQ=255)

                                                                           agtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTGAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                  >  1:204765‑M1/65‑140 (MQ=255)

                                                                           agtagaacggtgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaagataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                  >  2:318351‑M1/65‑140 (MQ=255)

                                                                             ttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGaa                                                                <  1:119404/140‑1 (MQ=255)

                                                                              agaccgttgcaatgcagtttattaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt                                                               >  2:418495‑M1/62‑140 (MQ=255)

                                                                                 ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAc                                                            >  2:556536/1‑140 (MQ=255)

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                                                                                   aaaaaaaaacaACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAAGTAATGTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGGCaa                                                          <  2:101035/139‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                     aTTACTAAAGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATTTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtata                        <  1:290239/140‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                         ataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGtt                    <  1:123831‑M1/122‑1 (MQ=255)

                                                                                                                           aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGGCTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAGAAACGTAACTATAAGTTAc                  <  1:461368‑M1/124‑1 (MQ=255)

                                                                                                                           aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATCACAATATGTAAACGTTAAATCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAc                  <  1:225027‑M1/124‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                              ctgcacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAATTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa               >  1:487507‑M1/14‑140 (MQ=255)

                                                                                                                              atagacgagaaaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACACTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATCCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa               >  1:706112‑M1/14‑140 (MQ=255)

                                                                                                                               tggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATACGTAAcaaag              <  2:506887‑M1/128‑2 (MQ=255)

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                                                                                                                                   ttaaatTTAAAAATAAATTTACTTAAATGTTAATAAAGTGGATAATAAAGTGTTGTCGGTAAAAAAAATGAAAATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta          <  2:172093/140‑1 (MQ=16)

                                                                                                                                     aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattatt        >  2:521297/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                      gataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATATTTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt       >  1:81761‑M1/6‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                      gataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt       <  2:582699‑M1/135‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                           aaaaaGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAGTATCTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAt  >  1:20444/1‑140 (MQ=255)

GGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512481‑512759

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.