| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1628158 = | 73 (1.150) | 3 (0.050) | 3/254 | 10.1 | 4.2% | coding (315/1407 nt) | pgd | phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) |
| ? | CP000730 | 1628226 = | 70 (1.200) | coding (247/1407 nt) | pgd | phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CATTGGAAGAATTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACTATCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/1628309‑1628158‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaaactatcaaTCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTT > CP000730/1628226‑1628365 CATTGGAAGAATTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGAAGATACTTTAATTGATGGTGGTAATA > 2:93189/1‑141 ATTGGAAGAATTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATAC > 1:485351/1‑141 TTGGAAGAATTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAAATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACA > 1:30207/1‑141 TGGAAGAATTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAA < 1:366503/141‑1 AAGAATTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACT > 2:74884/1‑141 ATTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACTATCA < 1:250689/141‑1 TTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACTATCAA > 1:453336/1‑141 TTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACTATCAA < 1:541036/141‑1 GATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATT > 1:456623/1‑141 GTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTC > 2:608497/1‑141 ATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATG < 2:456623/141‑1 ACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTA > 1:98755/1‑141 AACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAAT < 1:530085/141‑1 ACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATC < 2:386995/141‑1 ACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATC > 1:278731/1‑141 TATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAG > 1:564091/1‑141 TCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTT > 1:584457/1‑141 ATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTT > 1:585150/1‑141 CATTGGAAGAATTTGTTAATTCTTTAGAAAAACCACGTAAAATTTTATTAATGGTTCAAGCAGGTAAAGCTACGGACGCAACGATTGATAGTTTGTTACCTTTATTAGATGATGGAGATATTTTAATTGATGGTGGTAATACAAACTATCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/1628309‑1628158‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaaactatcaaTCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAATTCTTCCAATGAATACGTTGGATGAATATTTTTCCCTTTTGATTCTTCAACCATTAAATCAGTTTTT > CP000730/1628226‑1628365 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |