New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 1628158 = | 73 (1.150) | 3 (0.050) | 3/254 | 10.1 | 4.2% | coding (315/1407 nt) | pgd | phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) |
? | CP000730 | 1628226 = | 70 (1.200) | coding (247/1407 nt) | pgd | phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCAACTTTGTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAA > CP000730/1628018‑1628298 | gCAACTTTGTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCt < 1:460016/141‑1 (MQ=255) gCAACTTTGTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTAGTACGTCTGATAGTATCt > 1:549676/1‑141 (MQ=255) aaCTTTGTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTg < 2:299831/141‑1 (MQ=255) aCTTTGTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGa < 1:127052/141‑1 (MQ=255) tGTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACAACCAGAACCGGCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTGTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGt > 1:237438/1‑141 (MQ=255) gTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGtt > 1:484888/1‑141 (MQ=255) gTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGtt > 2:530085/1‑141 (MQ=255) ttATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGttt < 1:413625/141‑1 (MQ=255) ataAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGt > 2:651666/1‑141 (MQ=255) ataAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGt < 1:58044/141‑1 (MQ=255) ttcttGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTaccacc > 1:597321/1‑141 (MQ=255) tcttGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTAccacca > 2:313804/1‑141 (MQ=255) tcttGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTAccacca > 2:203061/1‑141 (MQ=255) ttGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCCGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATc < 2:163385/141‑1 (MQ=255) gTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCaa > 1:176054/1‑141 (MQ=255) cACCCGGCATTAATGCCGGACCAGTTAACGCTCCAGTTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTCCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATGGTATATTGATAGTTTGTGTTACATCCTTCaactc > 2:473306/1‑138 (MQ=255) ttAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATAtctc > 2:151277/1‑141 (MQ=255) taTGACGGACCATTTAACGCTCCATTTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAATGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTTAAATATCTCca < 2:429966/140‑1 (MQ=255) tGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCcatc > 1:489656/1‑141 (MQ=255) gACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCcatca < 1:71275/141‑1 (MQ=255) ggACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCt < 2:616875/141‑1 (MQ=255) aCGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTa < 1:219030/141‑1 (MQ=255) cGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTaa > 1:44941/1‑141 (MQ=255) ccAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAGAATATCTCCATCATCTACTAAAGGCAACaaa > 1:640085/1‑141 (MQ=255) aTTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTa < 1:304019/141‑1 (MQ=255) tttCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTAt < 1:651666/141‑1 (MQ=255) tCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCa > 1:13637/1‑141 (MQ=255) tCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCa > 1:239061/1‑141 (MQ=255) caccacCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCaa > 1:515815/1‑141 (MQ=255) accaccAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAAt > 1:401438/1‑141 (MQ=255) accaccAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAAt > 2:274328/1‑141 (MQ=255) accaccAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAAt > 1:580905/1‑141 (MQ=255) accaGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGt > 2:84605/1‑141 (MQ=255) caGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTGGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATAGCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTg < 1:73576/141‑1 (MQ=255) aGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGc > 2:621065/1‑141 (MQ=255) cGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCg < 1:583569/141‑1 (MQ=255) cGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCg < 1:377197/141‑1 (MQ=255) cGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCg < 2:420309/141‑1 (MQ=255) cGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTATATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATTAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCg > 1:244686/1‑141 (MQ=255) cccATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGCTAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTa > 2:343274/1‑141 (MQ=255) ccATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAg > 2:136105/1‑141 (MQ=255) cATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGc < 1:10025/141‑1 (MQ=255) cATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGc < 1:497533/141‑1 (MQ=255) tACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCtt < 2:84817/141‑1 (MQ=255) aTAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATCTCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCt > 1:217383/1‑141 (MQ=255) gTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACAATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTg > 1:455613/1‑141 (MQ=255) gATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAAc > 1:622385/1‑141 (MQ=255) gATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAAc > 1:106949/1‑141 (MQ=255) gATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAAc > 1:53350/1‑141 (MQ=255) gCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGTTAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCAtt < 1:57237/141‑1 (MQ=255) gCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCAtt < 2:91457/141‑1 (MQ=255) aCTTTGTGCTAATGCTNTATTACGTCTGANAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTCCCTGCTTGAACCATtaa > 1:585336/1‑141 (MQ=255) gtgCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATaaaa < 1:67890/141‑1 (MQ=255) tAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGATAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAAtttt > 2:394085/1‑141 (MQ=255) aaTGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTCCCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAAATATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTa < 2:484888/141‑1 (MQ=255) tGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACg < 1:576958/141‑1 (MQ=255) ttattaCGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGt > 2:343093/1‑141 (MQ=255) ttattaCGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGt > 2:224255/1‑141 (MQ=255) attaCGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGttt < 2:358707/141‑1 (MQ=255) ttaCGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGtttt < 1:204367/141‑1 (MQ=255) aCGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTc < 2:450052/141‑1 (MQ=255) gTCTGATAGTATCTAGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTa < 2:470315/141‑1 (MQ=255) cTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTACGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTGTCTaaa > 2:414906/1‑141 (MQ=255) tGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAg < 1:151277/141‑1 (MQ=255) gATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGa > 1:315170/1‑141 (MQ=255) gATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGa > 2:672187/1‑141 (MQ=255) aTAGTATGTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGaa > 1:540616/1‑141 (MQ=255) aTAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGaa > 2:231278/1‑141 (MQ=255) tATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTaa < 1:251179/141‑1 (MQ=255) aTCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCCTTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAAc < 1:492652/141‑1 (MQ=255) aTCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTTGTTTTTCTAAAGAATTAAc < 2:240919/141‑1 (MQ=255) aTCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAAc < 2:479997/141‑1 (MQ=255) tCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACa < 1:88189/141‑1 (MQ=255) ttGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACaaa > 1:541036/1‑141 (MQ=255) ttGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACaaa < 1:453336/141‑1 (MQ=255) | GCAACTTTGTTATAAGCTTCTTCTTGTCCACCCGGCATTAATGACGGACCAGTTAACGCTCCAATTTCACCACCAGAAACGCCCATACCAATAAAGTTGATTGCACTTTGTGCTAATGCTTTATTACGTCTGATAGTATCTTGATAGTTTGTATTACCACCATCAATTAAAATATCTCCATCATCTAATAAAGGTAACAAACTATCAATCGTTGCGTCCGTAGCTTTACCTGCTTGAACCATTAATAAAATTTTACGTGGTTTTTCTAAAGAATTAACAAA > CP000730/1628018‑1628298 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |