| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 48947 = | 70 (1.100) | 3 (0.050) | 3/258 | 10.2 | 4.5% | intergenic (‑56/+178) | ccrA/cch | cassette chromosome recombinase A/hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 48972 = | 61 (1.030) | intergenic (‑81/+153) | ccrA/cch | cassette chromosome recombinase A/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTGCAAGAGATTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTCACAGTTGTA > CP000730/48834‑49112 | ctgcAAGAGATTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTc > 1:583530/1‑141 (MQ=255) aaGAGATTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCata > 2:97927/1‑141 (MQ=255) agagATTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCatat < 2:135811/141‑1 (MQ=255) agagATTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATAGTTATGGGTGAATGGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCatat > 1:306765/1‑141 (MQ=255) gagaTTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATAtt > 2:150969/1‑141 (MQ=255) gagaTTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATAtt > 2:491980/1‑141 (MQ=255) gagaTTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCATATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATAGATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATAtt > 2:390948/1‑141 (MQ=255) gttgttTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCAt > 1:497087/1‑141 (MQ=255) gttgttTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCAt > 1:157583/1‑141 (MQ=255) ttgttTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCAtt < 1:295900/141‑1 (MQ=255) ttgttTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCAtt < 2:28023/141‑1 (MQ=255) cATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCGCCTCCGTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCAtttgtttg < 1:99124/141‑1 (MQ=255) aTCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTttga > 1:418544/1‑141 (MQ=255) tCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTttgat < 2:128203/141‑1 (MQ=255) tCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTttgat < 2:527721/141‑1 (MQ=255) cGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTttgatt < 1:387078/141‑1 (MQ=255) cGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTttgatt > 1:152784/1‑141 (MQ=255) cGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTttgatt > 1:325971/1‑141 (MQ=255) gTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTttgattg < 2:38783/141‑1 (MQ=255) aCTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTtgattgat > 1:493431/1‑141 (MQ=255) ttGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATttc < 1:557389/141‑1 (MQ=255) gACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATttctt > 2:82451/1‑141 (MQ=255) aCGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATttcttc > 2:172273/1‑141 (MQ=255) aaTAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTa > 2:131156/1‑141 (MQ=255) aGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCa < 1:589488/141‑1 (MQ=255) ccTATGACTTGTTTCATATTTACGCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCaaa < 1:519466/141‑1 (MQ=255) ccTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCaaa < 2:467473/141‑1 (MQ=255) cTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGAGGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAAt > 1:187274/1‑141 (MQ=255) aTGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCg < 1:632399/141‑1 (MQ=255) tttGTTTCATATCGTCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTGCTTCACTTACCAAATCGGCTa < 2:641570/140‑1 (MQ=255) tttCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAatat > 1:353945/1‑141 (MQ=255) atCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGAt < 2:135098/141‑1 (MQ=255) cGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATaa > 1:431258/1‑141 (MQ=255) tgCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAg < 2:395783/140‑1 (MQ=255) cctcctTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCa > 1:227343/1‑141 (MQ=255) ctcctTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCAt < 1:276437/141‑1 (MQ=255) cctTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATcc < 2:583094/141‑1 (MQ=255) ctTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTTGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCa > 1:619455/1‑141 (MQ=255) tttCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCAt > 2:162368/1‑141 (MQ=255) tCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGt > 1:650238/1‑141 (MQ=255) acaGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGttt > 2:88406/1‑141 (MQ=255) aGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGttttt > 1:649544/1‑141 (MQ=255) tGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCa < 1:425152/141‑1 (MQ=255) gATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCAc > 1:66529/1‑141 (MQ=255) taataTATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTc < 1:139661/141‑1 (MQ=255) atatTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGTTTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTAt > 2:165695/1‑141 (MQ=255) tatTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTAtt < 2:255750/141‑1 (MQ=255) atTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTAttt > 2:536989/1‑141 (MQ=255) atTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTAttt > 1:363694/1‑141 (MQ=255) tttATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTg > 1:595534/1‑141 (MQ=255) ttATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGt < 2:607664/141‑1 (MQ=255) tatataAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACg < 2:152784/141‑1 (MQ=255) atataAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGt > 1:67607/1‑141 (MQ=255) aaGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACTTCTat > 2:294554/1‑141 (MQ=255) aaGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGat < 2:303731/141‑1 (MQ=255) gCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGatta < 2:482611/141‑1 (MQ=255) cAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTc > 1:47422/1‑141 (MQ=255) aCATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAg > 2:602503/1‑141 (MQ=255) aCATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAg > 1:267527/1‑141 (MQ=255) aTCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGtt > 1:463877/1‑141 (MQ=255) aTCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGtt > 2:45523/1‑141 (MQ=255) cattgaTGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGAt > 2:565439/5‑141 (MQ=255) aTGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTc > 1:35550/1‑141 (MQ=255) gTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCTTTTCGTTATTTGTTCTACCTTCAATACGACGATTTTTCAGTTTGCTGCTTcac > 2:428205/1‑141 (MQ=255) tGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTCACAg < 2:270049/141‑1 (MQ=255) ggCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTCACAGtt > 2:288774/1‑141 (MQ=255) gCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTCACAGTTg < 1:193085/141‑1 (MQ=255) gCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTCACAGTTg < 2:520998/141‑1 (MQ=255) cGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTCACAGTTGt > 1:551345/1‑141 (MQ=255) gTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTCACAGTTGTa < 2:462648/141‑1 (MQ=255) | CTGCAAGAGATTGTTGTTTCATCGTACTTTGACGTAAATAGCCTATGACTTGTTTCATATCGGCTCCTCCTTTCACAGTGATAATATATATTTATGGATGAATTGATATATAAGCCCAACATCAATGAGATGTTGGGCGTCCATATTAGTCATTTGTTTGATTGATTTCTTCAATTACCAAATCGGCTAATATCTCGATAAGTTCATCCATGTTTTTCACTCCGTTATTTGTTCTATCTTCAATACGTCGATTATTCAGTTTGATGCTTCACAGTTGTA > CP000730/48834‑49112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |