| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 408323 = | 77 (1.210) | 3 (0.050) | 3/260 | 10.2 | 3.8% | coding (1869/2229 nt) | metE | 5‑methyltetrahydropteroyltriglutamate‑‑ homocysteine S‑methyltransferase |
| ? | CP000730 | 408388 = | 78 (1.310) | coding (1804/2229 nt) | metE | 5‑methyltetrahydropteroyltriglutamate‑‑ homocysteine S‑methyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CATCTAAGTCATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGATCTTGAACGACTTTACGTGGTAAAT > CP000730/408250‑408525 | cATCTAAGTCATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATAtt < 2:28261/141‑1 (MQ=255) tAAGTCATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCaga > 2:178513/1‑141 (MQ=255) tAAGTCATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCaga > 1:324147/1‑141 (MQ=255) aaGTCATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCagag > 2:395697/1‑141 (MQ=255) aaGTCATGAATAGCATGAATGATTGGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCagag < 2:10104/141‑1 (MQ=255) gTCATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCg > 2:652943/1‑141 (MQ=255) gTCATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCg < 2:652583/141‑1 (MQ=255) cATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTa > 2:399513/1‑141 (MQ=255) cATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAAAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTa < 2:392121/141‑1 (MQ=255) tGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAAt < 2:504451/141‑1 (MQ=255) tAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTa > 1:285772/1‑141 (MQ=255) tAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTa < 2:178430/141‑1 (MQ=255) atgaatgaTTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGcc < 1:221128/141‑1 (MQ=255) atgaatgaTTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGcc < 1:513216/141‑1 (MQ=255) gaatgaTTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCtt > 2:677633/1‑141 (MQ=255) gaatgaTTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCtt > 2:144706/1‑141 (MQ=255) atgcTTTGACCGAATTTAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCa < 2:506185/141‑1 (MQ=255) atgaTTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCa > 2:140325/1‑141 (MQ=255) atgaTTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCa < 2:440750/141‑1 (MQ=255) atgaTTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCa < 2:598419/141‑1 (MQ=255) aTTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGt < 2:175036/141‑1 (MQ=255) tttGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTa > 2:527395/1‑141 (MQ=255) ttGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTCTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTaa < 2:536822/141‑1 (MQ=255) aTTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGtt < 2:254848/141‑1 (MQ=255) gagaATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGt > 1:439206/1‑141 (MQ=255) agaATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTc > 2:459162/1‑141 (MQ=255) agaATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTc > 2:540604/1‑141 (MQ=255) gaATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCa > 1:92383/1‑141 (MQ=255) gaATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCa > 2:492579/1‑141 (MQ=255) aaTAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCaa > 1:324171/1‑141 (MQ=255) aTAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAAc < 1:105051/141‑1 (MQ=255) aTAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATAAAAAGAACGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAAc > 1:179704/1‑141 (MQ=255) aaCACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACtt < 2:544845/141‑1 (MQ=255) acacATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTg < 1:213369/141‑1 (MQ=255) acacATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTg < 1:517298/141‑1 (MQ=255) cacaTATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTgg < 1:223177/141‑1 (MQ=255) acaTATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGa < 2:51094/141‑1 (MQ=255) tgtgTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACt < 1:641345/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCa < 2:285772/141‑1 (MQ=255) aGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCTTGCAGc > 1:573457/1‑141 (MQ=255) tcatcaCGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCACCTTTAAGCTATTGTTCGAGATATGCAGCGCGTAATTGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCa < 1:575971/141‑1 (MQ=255) atcaCGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAg < 1:80372/141‑1 (MQ=255) gAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCAGGTAATGCAGGTTCGTCCACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAACTGCTa > 1:492289/1‑141 (MQ=255) gAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTa > 2:416304/1‑141 (MQ=255) aaCTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTaa < 2:618219/141‑1 (MQ=255) aaCTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTaa < 2:152195/141‑1 (MQ=255) aaCTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTaa < 2:618188/141‑1 (MQ=255) cTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATa < 2:35117/141‑1 (MQ=255) aaGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATActt > 2:506394/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) cAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGa > 2:224730/1‑141 (MQ=255) tttAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGc < 2:252895/141‑1 (MQ=255) ttAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCt < 1:386467/141‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTaaa < 2:179704/141‑1 (MQ=255) tGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGc < 2:571086/141‑1 (MQ=255) tAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAAt < 1:96131/141‑1 (MQ=255) aaaCAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAAttt < 2:335680/141‑1 (MQ=255) aaCAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTg > 2:741/1‑141 (MQ=255) aCAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGa > 2:178467/1‑141 (MQ=255) aCAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGa > 1:632178/1‑141 (MQ=255) aCAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGa > 1:261104/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) tGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGATCTTGAACGACTTTACGt > 1:78963/1‑141 (MQ=255) gTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGATCTTGAACGACTTTACGTg > 2:443941/1‑141 (MQ=255) gTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGATCTTGAACGACTTTACGTg > 1:95128/1‑141 (MQ=255) gATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGATAATGCAAGAATTTACGTGGTAAAt < 2:482021/141‑1 (MQ=255) | CATCTAAGTCATGAATAGCATGAATGATTTGACCGAATTGAGAATAACACATATGTGTATGGATTTGAGTTTCATCACGAACTGAAGACGTTGCAAGTTTAAATGATAAAACAGCATCTTTAAGATATTGTTCGTGATATTCAGAGCGTAATGGTAAGCCTTCACGTAATGCAGGTTCGTCAACTTGGATAACTTTGATTCCTGCAGCTTCAAGTGCTAATACTTCTTCGTTGATTGCTAAAGCAATTTGATCTTGAACGACTTTACGTGGTAAAT > CP000730/408250‑408525 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |