| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | CP000730 | 819,056 | Δ596 bp | [ytxJ] | [ytxJ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | CP000730 | 819056 | 819651 | 596 | 93 [0] | [0] 94 | [ytxJ] | [ytxJ] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 819055 | 0 (0.000) | 93 (1.040) | 68/276 | 0.3 | 100% | coding (2/321 nt) | ytxJ | hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 819652 = | 0 (0.000) | intergenic (+278/‑147) | ytxJ/glxK | hypothetical protein/glycerate kinase | |||||
AAAGTTAAAAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/818916‑819055‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGTAAGGTGG > CP000730/819652‑819790 AAAGTTAAAAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTA > 1:349700/1‑141AAAGTTAAAAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGTA > 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GTAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGTAAGGTGG < 1:941011/141‑1 AAAGTTAAAAATTTTGAATTTATGGTTAACATGTCAACTTACTATGTGTATAATGGTAAACATTGATATTAACTATATGTATAAAAATGTCACGCAGATGCTATTTAAATGTGATAAATATTTTTAGAGGTGAATAGAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/818916‑819055‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGTAAGGTGG > CP000730/819652‑819790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |