| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP000730 | 819,056 | Δ596 bp | [ytxJ] | [ytxJ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP000730 | 819056 | 819651 | 596 | 93 [0] | [0] 94 | [ytxJ] | [ytxJ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 819055 | 0 (0.000) | 93 (1.040) | 68/276 | 0.3 | 100% | coding (2/321 nt) | ytxJ | hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 819652 = | 0 (0.000) | intergenic (+278/‑147) | ytxJ/glxK | hypothetical protein/glycerate kinase | |||||
TTAGTACTTTTTTACAAACATATGTATAATATATTCGAGTATTTTTATTGAAAATATTTTGGAAAACGACGAATCCAATAAGAAAATTTAAACATGATTTGTAAGTTAGTTTAATAGGAAATATATGCTAAACCAAAAGAAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGTAAGGTGG > CP000730/819512‑819790 | aaagttaaaaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagta > 1:349700‑M2/141‑141 (MQ=255)aaagttaaaaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagta > 2:269042‑M2/141‑141 (MQ=255)aaagttaaaaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagta > 2:828201‑M2/141‑141 (MQ=255) aagttaaaaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAg > 1:202636‑M2/140‑141 (MQ=255) aagttaaaaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAg > 2:941011‑M2/140‑141 (MQ=255) agttaaaaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGc > 2:883612‑M2/139‑141 (MQ=255) gttaaaaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCa > 1:807852‑M2/138‑141 (MQ=255) gttaaaaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCa < 1:235183‑M2/4‑1 (MQ=255) aaattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTg < 1:463403‑M2/9‑1 (MQ=255) aattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtatacaaatgtcacgaagatgatatttaaatgtgctaattatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGt > 1:529936‑M2/132‑141 (MQ=255) aattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGt < 1:873562‑M2/10‑1 (MQ=255) aattttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGt < 2:757574‑M2/10‑1 (MQ=255) tttgaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTAt < 2:857425‑M2/13‑1 (MQ=255) gaatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagagttgaatagagtAGCATATTGTTATTTa > 2:141116‑M2/126‑141 (MQ=255) aatttatggttaacatgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTAc < 1:767807‑M2/17‑1 (MQ=255) 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1:660892‑M2/30‑1 (MQ=255) atgtcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATtaata < 2:943751‑M2/31‑1 (MQ=255) tcaacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAAtc > 2:748882‑M2/108‑141 (MQ=255) caacttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAAtca > 2:739341‑M2/107‑141 (MQ=255) acttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAAtcatg < 2:87701‑M2/37‑1 (MQ=255) cttactatgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAAtcatgt < 2:489093‑M2/38‑1 (MQ=255) 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1:961314‑M2/43‑1 (MQ=255) tatgtgtataatggaaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATcatgtcatgt < 2:730598‑M2/43‑1 (MQ=255) atgtgtataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGtt < 2:175812‑M2/44‑1 (MQ=255) ataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGt < 2:949792‑M2/50‑1 (MQ=255) ataatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGt < 2:788294‑M2/50‑1 (MQ=255) aatggtaaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTc > 2:520611‑M2/90‑141 (MQ=255) 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1:55724‑M2/86‑141 (MQ=255) taaacattgatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGcatg < 2:819945‑M2/57‑2 (MQ=255) ttgatattaactatatgtataaaaatggcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCa < 1:131441‑M2/63‑1 (MQ=255) gatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACg < 1:563666‑M2/65‑1 (MQ=255) gatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACg < 2:538335‑M2/65‑1 (MQ=255) gatattaactatatgtataaaaatgtcacgcagatgctatttaaatgtgataaatatttttagaggtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACg > 2:127553‑M2/77‑141 (MQ=255) 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1:781680‑M2/19‑141 (MQ=255) tagaggggaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATAAATAAAAAACGTATCACAACAaata > 2:153050‑M2/17‑141 (MQ=255) gtgaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATaaa > 1:784219‑M2/12‑141 (MQ=255) gaatagagtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCGCATATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGAATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGt > 2:435283‑M2/10‑141 (MQ=255) agagtagCATATTGTTATTTACTGGAGTAATTAATAATCAGGTCATGTTAAATGTTCGCAAATGATCACGAGATAAAATCTATAATTTAAGATCAATCTTTTATGCATAAAAAACATAACACAACAAATAATAAAGTaacg > 2:631992/6‑139 (MQ=255) agtAGCATATTGTTATTTACTGGAATAATTAATAATCATGTCATGTTAAATGTTCACTTATAATCACGAGATAAAATCTAAAATTTAAGATTAATCTTTTATGCATAAAAAACGTATCACAACAAATAATAAAGTAAggtg < 1:697950‑M2/138‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |