| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1292499 | 88 (0.980) | 3 (0.040) | 3/244 | 15.0 | 3.8% | intergenic (+53/‑333) | infB/rbfA | translation initiation factor IF‑2/ribosome‑binding factor A |
| ? | CP000730 | = 1292522 | 76 (0.960) | intergenic (+76/‑310) | infB/rbfA | translation initiation factor IF‑2/ribosome‑binding factor A | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGTTGCAAAAGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/1292344‑1292499‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatgctccctataaaGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGTCATTGTAG < CP000730/1292522‑1292383 AGTTGCAAAAGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGA < 1:404160/141‑1 GTTGCAAAAGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGAT > 2:6476/1‑141 GCAAAAGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 2:132786/1‑141 GCAAAAGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 2:132879/1‑141 AAAGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTC > 2:942915/1‑141 AAAGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGATATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTC > 1:18125/1‑141 AGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCC > 2:598611/1‑141 AGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCC > 2:682271/1‑141 AGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCC < 2:341786/141‑1 TATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATA < 1:20972/141‑1 TATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATA < 1:154575/141‑1 TGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA > 1:89219/1‑141 TGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA > 2:267118/1‑141 TGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA > 2:872183/1‑141 CCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGA < 2:95032/141‑1 TTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGC < 2:624882/141‑1 TAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCA < 2:464630/141‑1 CTCCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAG > 2:896022/1‑141 CCCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGT > 1:898518/1‑141 CCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAA < 1:861356/101‑1 CCTATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAA > 2:861356/1‑101 TATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGTCAT < 2:486951/141‑1 TATAAAGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGTCAT < 1:153657/141‑1 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATACCATCGCCTTCTTTAAGGTCATTGTAG < 2:86329/141‑1 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGTCATTGTAG < 1:288867/141‑1 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGTCATTGTAG < 2:60308/141‑1 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGTCATTGTAG > 2:777617/1‑141 AGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGTCATTGTAG < 1:108892/141‑1 AGTTGCAAAAGGTTATGAATGTGGTATTACAATTGAAAACTACAATGACCTTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/1292344‑1292499‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatgctccctataaaGTAGACACTTAAAAAGTGCAATATTTATAGGGAGCATATCAATCTTAACTATACTTTTAGCTTGTAATTTATTTAATTAACGCTTAATTTCAACCATTTCAAATGCTTCGATAACATCGCCTTCTTTAAGGTCATTGTAG < CP000730/1292522‑1292383 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |