| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1649047 | 64 (0.710) | 3 (0.040) | 3/252 | 15.3 | 4.9% | intergenic (+39/+326) | yqhL/gcvPB | possible rhodanese domain sulfurtransferase/glycine dehydrogenase (decarboxylating) subunit 2 |
| ? | CP000730 | = 1649070 | 59 (0.720) | intergenic (+62/+303) | yqhL/gcvPB | possible rhodanese domain sulfurtransferase/glycine dehydrogenase (decarboxylating) subunit 2 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGATTGCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/1648896‑1649047‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaaatctgagtATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCATTTTTTATAGCCGCCTTTTAACATATAGATATCTGTATATCCATTCT < CP000730/1649070‑1648932 GGATTGCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAAT < 1:12137/141‑1GGATTGCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAAT < 1:747321/141‑1GGATTGCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAAT < 1:348285/141‑1 GATTGCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATA > 1:167749/1‑141 ATTGCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAA < 1:649675/141‑1 GCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATCTCTATATGTTAAAAGGCGGCGATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAAT > 2:241990/1‑141 GCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAAT > 1:659561/1‑141 CTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATC > 1:185216/1‑141 CTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATC < 1:44139/141‑1 AGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTG > 1:960737/1‑141 TATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGT > 1:340994/1‑141 TATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGT > 1:833121/1‑141 aATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGAAAAAAAAAAATATAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATA < 2:399413/140‑1 ACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCA < 1:322819/94‑1 ACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCA > 2:322819/1‑94 TAAAATCTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCATTTTTTATAGCCGCCTTTTAACATATAGATATCTGTA < 2:756116/141‑1 AAAATNTGAGTATTGTTATTCATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCANTNTNTATAGCCGCCTTTTAACATATAGATATCTGTAT < 1:328070/141‑1 AAATCTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCATTTT < 2:792424/106‑1 AAATCTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCATTTT > 1:792424/1‑106 ATCTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCATTTTTTATAGCCGCCTTTTAACATATAGATATCTGTATATC > 1:569145/1‑141 ATCTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACCATTTTATAGCCTTTATTTTTCCAGTCCATTTTTTATAGCCGCCTTTTAACATATAGATATCTGTATATC > 1:335310/1‑141 CTGAGTATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCATTTTTTATAGCCGCCTTTTAACATATAGATATCTGTATATCCA < 2:735372/141‑1 GTATTGTTATTGATGNTCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCATTTTTTATAGCCGACTTTTAACTTTTAGATATCTTTATATCGATTCT > 2:328070/1‑141 GGATTGCTAGCTATAGAGCCGCTCGTATTTTGAAAAAGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/1648896‑1649047‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaaatctgagtATTGTTATTGATGATCAATTAACACTCAGATTTTATTAAATCGTATATTAAATTTACAAAAACTATTTTTTAGACTTTATTTTTCCAGTCCATTTTTTATAGCCGCCTTTTAACATATAGATATCTGTATATCCATTCT < CP000730/1649070‑1648932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |