New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 1649047 | 64 (0.710) | 3 (0.040) | 3/252 | 15.3 | 4.9% | intergenic (+39/+326) | yqhL/gcvPB | possible rhodanese domain sulfurtransferase/glycine dehydrogenase (decarboxylating) subunit 2 |
? | CP000730 | = 1649070 | 59 (0.720) | intergenic (+62/+303) | yqhL/gcvPB | possible rhodanese domain sulfurtransferase/glycine dehydrogenase (decarboxylating) subunit 2 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTAAAAAATGAAAA > CP000730/1648932‑1649209 | aGAATCGATATAAAGATATCTAAAAGTTAAAAGTCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGANCATCAATAACAATAc < 2:328070/141‑1 (MQ=255) tGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAg > 2:735372/1‑141 (MQ=255) gATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGAt < 1:569145/141‑1 (MQ=255) gATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGGCTATAAAATGGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGAt < 1:335310/141‑1 (MQ=255) ataCAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATANANANTGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATGAATAACAATACTCANAtttt > 1:328070/1‑141 (MQ=255) taCAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTa > 2:756116/1‑141 (MQ=255) atCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATACCAATACTCAGATTTTAAtttttt > 1:736650/1‑141 (MQ=255) tataTGTTAAAAGGCGGATATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAATATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAAc < 1:410157/141‑1 (MQ=255) atatGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACa < 2:823719/141‑1 (MQ=255) tAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTATTGTTTTAACAAAGTCt > 1:779527/1‑141 (MQ=255) aaaGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGt > 1:699944/1‑141 (MQ=255) aGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTa > 1:708860/1‑141 (MQ=255) gcggcTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACt > 2:351255/1‑141 (MQ=255) cggcTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTTATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACta > 2:57541/1‑141 (MQ=255) cTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTatat > 1:451596/1‑141 (MQ=255) ataAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATAttt < 1:86570/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGGTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTtct < 2:628632/141‑1 (MQ=255) aaaaaTGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTtctc > 1:872518/1‑141 (MQ=255) aaaaTGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGAttt > 2:792424/1‑106 (MQ=255) aaaaTGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGAttt < 1:792424/106‑1 (MQ=255) tGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCt > 1:311085/1‑141 (MQ=255) tGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCt < 1:211087/141‑1 (MQ=255) tGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCt < 2:325703/141‑1 (MQ=255) ggACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCtt > 1:933191/1‑141 (MQ=255) aCTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCa < 1:256802/141‑1 (MQ=255) aCTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATAATCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCa > 1:269289/1‑141 (MQ=255) aaaaTAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATc < 2:97196/141‑1 (MQ=255) aaaGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTaa > 1:635496/1‑141 (MQ=255) aaGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTaaa > 2:933066/1‑141 (MQ=255) aGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAAc < 1:635321/141‑1 (MQ=255) aGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAAc < 1:160959/141‑1 (MQ=255) ttgtAAATAATAGTTTTTGTAAATGTAATATACGATCTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATGCTCATATTGTAATTTGTTAACAAAGTCTGTTACTATATGTCTCTAGCTTCACTGTTCAGTAAACt < 2:194516/138‑1 (MQ=255) tAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCCCTGATCCTTAACCTTAg > 2:866961/1‑141 (MQ=255) aTAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTGGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAg < 2:513436/141‑1 (MQ=255) aTAGTGTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAg < 2:501368/141‑1 (MQ=255) gTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCat > 2:583784/1‑141 (MQ=255) gTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCat > 1:383624/1‑141 (MQ=255) tttttGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCata > 1:563081/1‑141 (MQ=255) ttGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTCAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCataata > 1:620003/1‑141 (MQ=255) tGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCAtaataa < 1:124744/141‑1 (MQ=255) tGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCAtaataa < 1:472693/141‑1 (MQ=255) tAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATaaag < 1:400194/141‑1 (MQ=255) tAAATTTAATATACAATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCCTAATaaag < 1:55423/141‑1 (MQ=255) aTTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATaaagaaa > 2:247497/1‑141 (MQ=255) tataCGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGTTCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAATGTTCAg > 2:945198/1‑141 (MQ=255) tataCGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAg > 1:499944/1‑141 (MQ=255) tataCGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAACAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAg > 2:945109/1‑141 (MQ=255) ctaTTTAAGAAAATCTGAGTGGTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAGGAAATTTCAGCTCa < 2:482309/139‑1 (MQ=255) cGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCa > 1:961576/1‑141 (MQ=255) aTTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCAtt < 1:695823/141‑1 (MQ=255) taaAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAAt > 2:408947/1‑141 (MQ=255) aTCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATGAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGa < 2:899590/141‑1 (MQ=255) cTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGAtt < 1:419181/141‑1 (MQ=255) aGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCaa > 1:478155/1‑141 (MQ=255) gtgtTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAAt > 2:545799/1‑141 (MQ=255) gtTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTCCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTa > 2:126224/1‑141 (MQ=255) ttAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTAc > 1:797491/1‑141 (MQ=255) aaTTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCg < 1:358536/141‑1 (MQ=255) atcaATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTaa < 1:687517/141‑1 (MQ=255) atcaATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTaa < 1:728722/141‑1 (MQ=255) atcaATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTCAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTaa < 2:250608/141‑1 (MQ=255) tcaATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCNATCTaaa > 2:723709/1‑141 (MQ=255) caATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTaaaa > 1:952944/1‑141 (MQ=255) aaTAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTaaagaaaaaaaaaaa < 2:240401/141‑15 (MQ=255) aaCAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTAAAAAATg < 2:786486/141‑1 (MQ=255) cAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTAAAAAATGaa > 1:86921/1‑141 (MQ=255) aTACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTAAAAAATGaaaa > 1:910084/1‑141 (MQ=255) | AGAATGGATATACAGATATCTATATGTTAAAAGGCGGCTATAAAAAATGGACTGGAAAAATAAAGTCTAAAAAATAGTTTTTGTAAATTTAATATACGATTTAATAAAATCTGAGTGTTAATTGATCATCAATAACAATACTCAGATTTTAATTTTTTAACAAAGTCTGTTACTATATTTCTCTAGCTTCACTGATCATTAAACTTAGTTTCAGCATAATAAAGAAAGTTCAGCTCATTTTCAATACGATTCAATTACCGCAATCTAAAAAATGAAAA > CP000730/1648932‑1649209 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |