New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 1954777 | 64 (0.790) | 7 (0.090) | 6/254 | 11.7 | 10.9% | intergenic (‑39/+26) | epiB/epiA | lantibiotic epidermin biosynthesis protein EpiB/lantibiotic epidermin EpiA |
? | CP000730 | = 1954783 | 56 (0.750) | intergenic (‑45/+20) | epiB/epiA | lantibiotic epidermin biosynthesis protein EpiB/lantibiotic epidermin EpiA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACTTGCACG > CP000730/1954646‑1954923 | ttGTGCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGc < 2:509110/141‑1 (MQ=255) tGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTACTCATACAAATCCTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGct < 1:869491/141‑1 (MQ=255) tGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGct < 1:13363/141‑1 (MQ=255) gTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGctc < 2:865647/141‑1 (MQ=255) ttCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGctct > 1:257101/1‑141 (MQ=255) ttCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGctct < 2:337611/141‑1 (MQ=255) gTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTAttt > 1:663180/1‑141 (MQ=255) aTTTAAAAATAAATTTAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGc > 2:283405/1‑141 (MQ=255) ttAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTg < 1:586299/141‑1 (MQ=255) aaaaaTAAATTGAAAAATTCAACTGATAATCAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTa > 2:782267/1‑141 (MQ=255) aaaaaTAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTa < 2:17016/141‑1 (MQ=255) aaaaaTAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTa < 1:214115/141‑1 (MQ=255) aaataaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAAt > 1:420701/1‑141 (MQ=255) aaataaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAAt > 2:185775/1‑141 (MQ=255) ataaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCt < 1:348371/141‑1 (MQ=255) aaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACTGTTCTTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCTCCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTa < 1:651011/141‑1 (MQ=255) aatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTaa > 2:570063/1‑141 (MQ=255) tGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAAcag > 2:808320/1‑141 (MQ=255) aTTCAACTGATAATCAAGGTGTTCTAATCATACATATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCCCATATTTGAATAGACAAATAGAGCACTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTACCAGCAGAAg < 2:82006/141‑1 (MQ=38) ttCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGc < 1:424970/141‑1 (MQ=255) tCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCt < 1:730874/141‑1 (MQ=255) cAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTa < 2:624708/141‑1 (MQ=255) aaCTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTAt < 2:327395/141‑1 (MQ=255) cTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTa > 1:527795/1‑141 (MQ=255) cTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTa < 1:823703/141‑1 (MQ=255) aaaGGTGTTCTCATCATAAAAATACTTTACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTAcc > 2:439694/1‑141 (MQ=255) tCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAg > 1:273863/1‑141 (MQ=255) tCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAg > 1:802051/1‑141 (MQ=255) aaTCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGcac > 2:262951/1‑141 (MQ=255) aaTCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGcac > 2:70213/1‑141 (MQ=255) aTCATACAAATACTTGACTGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGcaca < 2:395533/141‑1 (MQ=255) tACTTAACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTa < 1:76513/141‑1 (MQ=255) cTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGCAcc > 2:518466/1‑140 (MQ=255) cGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAAc < 1:162642/141‑1 (MQ=255) ttCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAGACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTAt < 2:18504/141‑1 (MQ=255) ttCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACAAATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTAt < 1:808320/141‑1 (MQ=255) tAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACt < 1:130998/141‑1 (MQ=255) aaaTAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACtt < 1:445125/141‑1 (MQ=255) aTAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGt < 2:216437/141‑1 (MQ=255) aTAGGGTTCATTTGGAAGCACCTCACATATTTGAAGAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACATCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAGCTATGACTTGt < 2:175463/141‑1 (MQ=25) gtTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATAc < 2:505238/141‑1 (MQ=255) tttGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCg < 2:445117/141‑1 (MQ=255) gTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCa > 1:804345/1‑141 (MQ=255) tAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCAc < 1:29785/141‑1 (MQ=255) aaGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCAcc > 2:379276/1‑141 (MQ=255) gCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACctg > 2:164438/1‑141 (MQ=255) cACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACctgc < 1:381757/141‑1 (MQ=255) cACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACctgc < 2:753681/141‑1 (MQ=255) aCCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACctgct < 1:12795/141‑1 (MQ=255) aCCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACctgct < 2:732529/141‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGa < 2:527795/141‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGa < 1:847957/141‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATCAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGa < 1:731919/141‑1 (MQ=255) aaTAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGtt > 2:85542/1‑141 (MQ=255) aTAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTa < 2:849870/141‑1 (MQ=255) aGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTAtt < 2:156804/141‑1 (MQ=255) cAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGtt < 2:531261/141‑1 (MQ=255) aaTATAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTg < 1:656349/141‑1 (MQ=255) aaTAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTg > 2:198104/1‑141 (MQ=255) ccTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACt > 1:756673/1‑141 (MQ=255) ccTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACt > 1:574664/1‑141 (MQ=255) tCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACTTGCa > 2:846275/1‑141 (MQ=255) aGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACTTGCACg > 1:50439/1‑141 (MQ=255) | TTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACTTGCACG > CP000730/1954646‑1954923 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |