| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 68659 = | 160 (0.930) | 8 (0.050) | 8/260 | 10.6 | 5.5% | coding (775/852 nt) | USA300HOU_0065 | transposase |
| ? | CP000730 | = 68655 | 133 (0.880) | coding (771/852 nt) | USA300HOU_0065 | transposase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/68824‑68659‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attattattattattattGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATACTT < CP000730/68655‑68508 tttggcTCAATTTCCGTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGA < 2:1292901/143‑1ttgaggTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGA < 2:803180/143‑1ctacgttcttttgtCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTATGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGA < 1:462951/135‑1cTTACTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGA < 2:1422273/148‑1TTTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGA < 1:1487078/149‑1TTTAGTTCAATTACCTATATAAACAAAAGCGCCTATAATCCTAGGGCAATGAACCCTTAAAACGGGATCTTAATAAACACACCAAGTTTTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGA < 2:224062/149‑1TTTAGTTCAAGTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGA < 2:496179/149‑1 TTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGAT > 1:611006/1‑149 TAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGCACCATTTGAACTTGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATT < 1:396576/149‑1 GTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTAT > 1:17164/1‑149 GTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTAT > 1:961929/1‑149 GTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTAT < 1:934036/149‑1 GTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGCCGCCGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTAT < 1:560640/149‑1 GTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAAACGTCGGCCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTAT > 1:411454/1‑149 GTTCAATTACCTTGATAAAGAAAAGGGCCTATAATCGTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTACTTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGC‑ATTCGGTTAT > 2:228532/1‑149 TCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTA > 1:799527/1‑149 AATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTGTTAAAAACATCATGTTCTAGGCTATTAATTCTTTGTCTTTTACAGGGGTTAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATT > 2:701436/1‑149 AATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATT > 1:300194/1‑149 ATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TTA‑ATTCGATTATTATTA > 2:280229/1‑149 ATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTt > 2:1327404/1‑148 ATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTA > 2:1327368/1‑149 ATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTA > 2:30760/1‑149 TTACCTTTATAAACAAAAGCGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATACGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATCCGATTATTATTAT > 2:540810/1‑149 TTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTAT < 1:1353399/149‑1 TTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTAT < 1:739306/149‑1 TACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATT < 1:351369/149‑1 TACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATT < 1:1441653/149‑1 CCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAAGACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTCTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTTTTATTATTAT > 1:1042564/1‑149 CCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTTTTAGTATgaa > 2:351369/1‑146 CCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTAT > 1:1472965/1‑149 CCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑AGTCGATTctcatagttct > 2:249671/1‑138 TTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTA > 1:1282214/1‑149 TTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTAT < 1:1271362/149‑1 AAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTCT‑‑TTG‑ATACGATTATTATTATTgtaaatatt > 2:1181508/1‑140 CAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTT > 1:1632138/1‑149 TAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGTAGTCATAGTGGTTTATTATTATTATTATTGTTTTTTATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATG > 1:821858/1‑149 AAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGCAAAAGTAGTCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATT > 1:749656/1‑149 ACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAG < 2:7557/149‑1 AACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTCATTAGAGTGA < 2:1488628/149‑1 AAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGGTAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTATTGTACTTTTTGACAATTTCTATTACCATGTTATTATATTGATTAAGCTC > 2:31613/1‑149 AAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGTCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCA < 2:611006/149‑1 TAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTT > 2:798621/1‑149 tgTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTTATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTC < 1:734442/147‑1 ATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTC < 1:1523730/149‑1 ATTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTC < 2:1374179/149‑1 TTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATCACTATGACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCC < 1:1327404/149‑1 TTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCC < 1:30760/149‑1 TTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCC < 1:280229/149‑1 TTATTATTATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCCAAAATCTCGACTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCC < 1:1327368/149‑1 TATTATTATTATTATTGTTTTTTACGTACTTTTCCACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTGAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCC < 2:1662634/149‑1 TTATTATGATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCG < 1:1634284/149‑1 tTTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCTAAAATATCTATTACAATGTTATTAGAGTGATTAAGCCCATTATTTATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTCCGGG < 2:214522/148‑1 tTTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCTGGTCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGG < 2:1659446/148‑1 ATTATTTTTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTCCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTGCGGG < 2:294804/149‑1 ATTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGG < 1:877189/149‑1 TTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTACGCGCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTGTCTATCTGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGA < 2:494710/149‑1 TTATTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCCATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGA < 1:1447123/149‑1 TTATCATTGTTTCTAAACTACTTTTCGACAATATCTATCACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGA < 1:58081/149‑1 TTATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACAT < 1:1663594/149‑1 TTATTGTTTTTAATGTACTTTGCGACAAGATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACAT < 1:736129/149‑1 TATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTACCTTTCGGGACAga > 2:342308/1‑147 TATTGTTTTTAATGTAATTTCCGACAATATCAATTCCAATGTGAGTAGATTGAGTAAACTGACTAGTGATGTAAAGAGTTTCGGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCATTTCGGGACATA > 2:764947/1‑149 ATTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTAGGGACATAC > 2:247678/1‑149 TTGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGTGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCGTTCGGGACATACT > 2:1436080/1‑149 TGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATACTT > 1:496452/1‑149 TTTAGTTCAATTACCTTTATAAACAAAAGAGCCTATAATCCTAGGGCACTGAACCCTTAAAACGGGAACTTAATAAAAACACCATGTTCTAGGCTATTAATTCTCTGTATTTTACAGGGGATAAGTAGCCTAGTTTTTGT‑‑TGA‑ATTCGATTATTATTATTATTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/68824‑68659‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attattattattattattGTTTTTAATGTACTTTTCGACAATATCTATTACAATGTGATTAGAGTGATTAAGCTCATTATTGATGTAAAAAGTTTCAGACTTTAGCGAGGAATGGAAACTTTCTATCGGGGCGTTATCGGCAGGTGTTCCCTTTCGGGACATACTT < CP000730/68655‑68508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |