New junction evidence | |||||||||||
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? | CP000730 | = 1996883 | 161 (0.940) | noncoding (1/76 nt) | USA300HOU_t0035 | tRNA‑Asp | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
ATGCTTAAAAACAATATTGACTTTTACAGAACGTTCATATATGATAAATATTGTGTTTAGGAGGAATACCCAAGTCCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGGGCTTAACGGCTCGCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCGCCATCAATATTTATATTAAATTCTATATATAATGAAGGTAAGTGCTCAAATTTTGAGTATTTACCTTTTTTATTTGTCTTTGAATGGCTCGTAATTTTTGATAATAGAAATGATAAGGCATTGAGATTGGAAGGGCATTTGGCTTGTG > CP000730/503487‑503783 | aTGCTTAAAAACAATATTGACTTTTACAGAACGTTCATATATGATAAATATTGTGTTTAGGAGGAATACCCAAGTCCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGGGCTTAACGGCTCGCGGGGGTTCGAATCTCTCTTCCTCCg > 1:32207/1‑149 (MQ=255) tGCTTAAAAACAATATTGACTTTTACAGAACGTTCATATCTGATAAACATTGTGGTTAGGAGGAATACCCAAGGCCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGGGCTGAACGGCTCGCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCGc < 1:321122/149‑1 (MQ=21) tGCTTAAAAACAATATTGACTTTTACAGAACGTTCATATATGATAAATATTGTGTTTAGGAGGAATACCCAAGTCCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGGGCTTAACGGCTCGCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCGc < 2:1583774/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |