| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 512620 = | 84 (1.290) | 52 (1.160) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA |
35/180 | NT | 47.3% | intergenic (+688/‑173) | recR/rrs1 | recombination protein RecR/16S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | 1998278 = | NA (NA) | intergenic (‑6/+5) | USA300HOU_t0050/rrf4 | tRNA‑Val/5S ribosomal RNA | |||||
CTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATAC > CP000730/1998139‑1998418 | tcgtgtACGAGTCTGGTGCTGTACCAATTGGGGTAGGCCGGCTATATGTAAGAATAAAGGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTTCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTaa < 2:148886/136‑1 (MQ=11) cAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGcc > 1:776998/1‑141 (MQ=255) aaGTCAGTTGCTCTCCCAAGTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCt < 2:584251/141‑1 (MQ=255) gTCAGTTGCTCTACCAGTTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTgg > 1:431632/1‑141 (MQ=255) gTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTgg > 2:642261/1‑141 (MQ=255) tCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGc > 2:101288/1‑141 (MQ=255) cAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGCTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGCTTTAAAACAGCCTGCCa > 2:701765/1‑141 (MQ=255) cAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCa > 2:313254/1‑141 (MQ=255) cAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCa > 1:71037/1‑141 (MQ=255) cAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGACGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCa > 2:716407/1‑141 (MQ=255) tggtctACCTATTGAGCTAGGCCGGCAAGACGTAAGAATAAAGGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCGCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGt < 2:482210/138‑1 (MQ=17) tGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGCTTTAAAACTGCCTGGCAACGt < 1:399933/141‑1 (MQ=255) tGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGt < 2:770561/141‑1 (MQ=255) gCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGtt > 2:755984/1‑141 (MQ=255) ctcgACCAATTTAGCCAGGCCGGTAAAATCTAAGAATAATCGCTTGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTTTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCGCCGATTTAAACCTGCCTGGCAACGTTc < 2:98021/141‑1 (MQ=14) tctACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCt > 1:172463/1‑141 (MQ=255) tctACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCt > 1:39560/1‑141 (MQ=255) tctACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCt > 2:97951/1‑141 (MQ=255) aactgggCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTa < 2:460782/135‑1 (MQ=255) aTTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATTACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAg > 1:729887/1‑141 (MQ=255) aTTGAGCTAGACCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAg > 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aGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGACCGt > 2:736860/1‑141 (MQ=255) gCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGCATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCA‑TGTACGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCGCCGATTTAAAACTGCCTGCCAACGTTCTACTCTAGCgcgtcgtaa > 1:689968/1‑133 (MQ=17) cGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTGTCCTCTAGCGGAACGTAAGt > 1:692861/1‑141 (MQ=255) cGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTGAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGt > 2:85195/1‑141 (MQ=255) ggCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGtt > 1:772896/1‑141 (MQ=255) cAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTCAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTGACGGAACGAAAGTCCg > 2:250058/1‑141 (MQ=14) tatGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACt > 1:693939/1‑141 (MQ=255) tatGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACt < 1:753952/141‑1 (MQ=255) atGTAAGAATGAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTa > 1:560136/1‑141 (MQ=255) atGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTGAAACTGCCTGGCAACGTTTTACTCTGGCGGAACGTAAGTTCGAATa > 2:4441/1‑141 (MQ=255) atGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTa > 1:265213/1‑141 (MQ=255) atGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTa < 1:156189/141‑1 (MQ=255) atGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTa < 1:97951/141‑1 (MQ=255) tGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTAc < 2:256110/141‑1 (MQ=255) aTAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGAc < 2:721140/141‑1 (MQ=255) tAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCGCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACg > 2:439814/1‑141 (MQ=255) aaaTGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGc > 2:686301/1‑141 (MQ=255) aTGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTa > 1:267908/1‑141 (MQ=255) gagaATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGc < 1:517342/141‑1 (MQ=255) aaTGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGCGCTTa > 1:257619/1‑141 (MQ=255) aaTGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTa > 2:38498/1‑141 (MQ=255) tGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTGCCATCGACGCTAAGGGGCTTGAc > 1:92558/1‑141 (MQ=255) 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cT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGgtgt < 1:731415/141‑1 (MQ=255) tgggaaGGCAGACGCCCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGAGTTAAACCTGCCTGGCAACGTTCTGCGCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGtgtg < 2:88521/137‑1 (MQ=14) tGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCCTGGGAACCGGtgtgc > 1:152053/1‑140 (MQ=255) gTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAc > 2:693291/1‑141 (MQ=255) gCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTACCTTCTGTGTTCGCCATGGGAACAGGTGTGAcctcct > 2:206290/1‑141 (MQ=255) cAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCtt < 2:560136/141‑1 (MQ=255) cAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCCACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGACCAGGTCTGCcctcctc > 2:40040/1‑140 (MQ=255) gaggCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCCAGCGGAACGCAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGc < 1:208323/138‑1 (MQ=255) tGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCta > 1:226276/1‑141 (MQ=255) gCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCtat < 2:276001/141‑1 (MQ=255) gCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCtat < 2:663479/141‑1 (MQ=255) ctctCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTGACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCtata > 2:210925/1‑141 (MQ=255) tctcCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAg < 1:234377/141‑1 (MQ=255) ctcCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGGGTGACCTCCTTGCTATAGt > 2:518200/1‑141 (MQ=255) tcCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTc < 2:693939/141‑1 (MQ=255) cccAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCa > 1:705955/1‑141 (MQ=255) ccAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCCTGGCAGCGTGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCAc < 1:767640/141‑1 (MQ=14) aGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCa < 2:581514/141‑1 (MQ=255) gggCTAATTCTCCGATCTAAAACTGCTTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCGTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACa < 2:187562/139‑1 (MQ=255) aaTTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGa < 2:114084/141‑1 (MQ=255) tttttttattaaaaaaCTGCCTGGCAACGTTCTACTCTTGCGGGAGGTAAGTTCGAGTGCCTTCGCCGCTATTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCGGAATGGGAACAGGTGTGACTTTCTTGTTATAGTCACCCGACCTATGaa > 2:330758/13‑141 (MQ=2) ctcCGATTTAAAACTGCCTGGCCACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGGGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTACTATAGTCACCAGACATATGAATGt > 2:626859/1‑141 (MQ=255) gATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAtt > 2:243889/1‑141 (MQ=38) tAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTtata > 1:51330/1‑141 (MQ=34) tAAAACCGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTtata < 1:324749/141‑1 (MQ=17) aaaaCTGCCTGGCCACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTAGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTCGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATAc < 1:32519/141‑1 (MQ=16) aaaaCTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATAc < 2:420402/141‑1 (MQ=33) aaaaCTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATAc < 2:594208/141‑1 (MQ=33) | CTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGA‑CCCTCTGCT‑TGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCGATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATAC > CP000730/1998139‑1998418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |