New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP000730 | 633406 = | 117 (0.890) | 6 (0.050) | 6/282 | 8.3 | 4.7% | intergenic (+130/‑414) | proP/vraA | MFS family major facilitator transporter, proline/betaine:cation symporter/long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
? | CP000730 | 633436 = | 129 (1.020) | intergenic (+160/‑384) | proP/vraA | MFS family major facilitator transporter, proline/betaine:cation symporter/long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTGCAATGATTATCGCAATGGGGGAAAGAGGGGACTTAAAGCATATGTTTAGCTTTGAATACTTAAAATTCTCTTGCTATTGAAATGTTAGGATGTAAATATGTCTTAGAGTATTTTGTCCAACGCAATTAATATTGAGACT > CP000730/633266‑633553 | gTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACt < 2:1096471/148‑1 (MQ=255) tAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTg > 1:1134603/1‑148 (MQ=255) tAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTg > 1:545184/1‑148 (MQ=255) tAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTg > 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agaTTTTAATAAAAATGATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTGCAATGATTAt < 2:1044305/148‑1 (MQ=255) agaTTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTGCAATGATTAt > 2:1138530/1‑148 (MQ=255) agaTTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTGTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTGCAATGATTAt < 2:1205137/148‑1 (MQ=255) agaTTGTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGCGAACTGTAATTAGCCGTAATAACGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTGCAATGATTAt < 2:859088/148‑1 (MQ=255) ataaAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTGTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTGCAATGATTATTGCAATgg > 1:522050/1‑148 (MQ=255) 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cccccACTGCAATGATTATCGCAATGGGGGAAAGAGGGGACTTAAAGCATATGTTTAGCTTTGAATACTTAGAATTCTCTGGCTATTGAAATGTTAGGATGTAAATTTGTCTTCGAGTATTTTGTCGAACGCAATTAGTATTGAGAct > 2:289283/1‑148 (MQ=255) | GTAAGAATTAGAGATTTTAATAAAAAGTATAAATCAATCGTATATAAGCACTTTAAAGCTAGTAGGTTCTGCTAACTTTAAAGTGCTTTTTAAATTGAGAACTGTAATTAGCCGTAATAAAGTTTTTGTATATACATAAACCCCCACTGCAATGATTATCGCAATGGGGGAAAGAGGGGACTTAAAGCATATGTTTAGCTTTGAATACTTAAAATTCTCTTGCTATTGAAATGTTAGGATGTAAATATGTCTTAGAGTATTTTGTCCAACGCAATTAATATTGAGACT > CP000730/633266‑633553 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |