| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1961511 = | 130 (1.410) | 101 (1.150) +TATTTT |
4/268 | 9.2 | 47.3% | intergenic (‑54/+1) | USA300HOU_t0017/USA300HOU_t0018 | tRNA‑Ser/tRNA‑Glu |
| ? | CP000730 | = 1998272 | 105 (1.140) | noncoding (1/76 nt) | USA300HOU_t0050 | tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/1961647‑1961511‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCATTTAT < CP000730/1998272‑1998192 |||||| CAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGTGGCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATT > 1:984018/1‑141CAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATT > 1:125686/1‑141CAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTCAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGCCATGATT > 2:727459/1‑141 GTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGGTCTGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTACTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGA < 1:668562/141‑1 taagGCTATGGGATGTTAACCGATGGGTCGTAGGTTCGAGTCTTACCTGTGGGGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACCCCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAG < 2:760351/137‑1 gAGAGCTGTCGGCTGTTACCCGATCGGCCGTAGGTTCGAGCCCTACCGGGGGGGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAG < 2:62263/140‑1 AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGA > 2:689395/1‑141 AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGA > 2:738950/1‑141 AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGA < 2:653857/141‑1 AGAGATATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGA > 2:689194/1‑141 GCTATCGGCTGTTCACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCCCCGTGGTCCAGCGGTTCAGACACCGCCCTGTCACGGCGGTAACACGGGGTCGGGTCCCGTAGGGGTCATTAGTTGGGAGAcat > 2:137939/1‑138 GCTATCGGCTGTTAACCTGTCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATT < 1:619153/141‑1 GCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTTGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATT > 1:436600/1‑141 GCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGGTGCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTAGCGGCGGTAACACGGGTTCGGGTGGAGTTGGTGGCATTATTTTGGAGAATT > 2:949807/1‑141 GCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGTGAATT > 1:507252/1‑141 GCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATT < 1:41140/141‑1 GCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATT > 1:378982/1‑141 GCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATAGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGGGTCATTATTTTGGAGAATT > 1:662641/1‑141 ATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTACTTATTTTGGAGAATTAGC > 2:148434/1‑141 TCGGCTGTTAACCGATCGGTCATAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCc > 1:206982/1‑140 TAACCGTTCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGG < 2:879321/141‑1 AACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGGAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGA > 1:172840/1‑141 CCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCGTATCGAATGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGGGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGg > 2:456259/1‑140 CGATCGGTCGTAGGTTCGGGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAG < 2:800920/141‑1 CGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGtacag < 2:862447/141‑6 gagCGGCCGGAGGTGCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCGCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGGCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGC < 1:92474/138‑1 cATCGGTCGCTGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGC < 2:681859/140‑1 GATCGGTCGTAGGTTCGCGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGC < 1:114332/141‑1 GATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGATTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGC < 1:876843/141‑1 ATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCTTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCA < 1:232720/141‑1 TCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCATGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGACCCGTAGGAGTCATTATTTTGGCGAATTAGCTCAGCTCGGAGAGCAT < 2:638628/141‑1 TCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACTGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAAGTAGCTCAGCCGGGAGAGCAT > 2:972881/1‑141 GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCGGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTG < 2:394047/141‑1 GTCGAAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTG > 1:248741/1‑141 CGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCGTTGGACACGCGGGTATGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGAAAGAGGCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCAACTGCC > 2:652946/1‑141 CGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAGGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGCGAGCATCTGCC > 2:652987/1‑141 CGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGGCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCGGGGAGAGCATCTGCC > 2:289222/1‑141 CGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGCCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCC > 2:73521/1‑141 CGTAGGTTCGAGTCCTACCTGGGGAGCCCTGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCC > 2:9202/1‑141 GTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGGCCCGTGGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCT > 2:517089/1‑141 CGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGGGAGCATCTGCCTTACAAGC > 2:623622/1‑141 CGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGC > 2:840709/1‑141 CGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGC > 2:331973/1‑141 AGTCCTACCTATGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAG > 1:721266/1‑141 GTCCTACCTTTCGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCttgtaaggcaga < 1:178288/141‑13 ggCTACCTTTTGAGCTATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCCCGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCTCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAG < 1:302059/139‑1 TCCTACCTGTGGAGCCAGCGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAG < 1:623997/141‑1 CTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGACTTACAAGCAGAGGG < 1:738436/141‑1 TACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAATCGGAGGGg > 1:125951/1‑140 TACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 2:581276/1‑141 TACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGT > 2:279131/1‑141 ggggGCCAAGGCTTCTGCGTCAAGCGCCTAAGACCCCGACCCTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTGCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCGTACAAGCAGAGGGTCGGCGG < 1:603115/137‑1 TGGAGCCATGGCTCCTTGGTCCCGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGACACACGTAGGAGTCATTATGCGTGGTAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCAGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGG < 1:727459/141‑1 TGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGG < 1:689395/141‑1 TGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGG < 1:738950/141‑1 TGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCGGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGG < 1:689194/141‑1 AGCCATGGCTCCTTGGGCAAGCGGTTAAGCCACCGCCCTTCCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTC < 1:400336/141‑1 GCCATTGCTCCGTGGTCAAGCGGTTAAGGCACCGCCCTTTCACGGCGGTACCTCGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGTATGAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGTGTCGGCGGTTCG < 2:2320/141‑1 GCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACCCCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGTGTCCTAGTCCCGTAGGAGTCTGTATTTTTGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCG < 2:2257/141‑1 GCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAATCATTATTTTGTAGAATTAGCTCAGCTTGGAGAGACACTGCCTTACAAGCATGAGTTCGTCGGTTCG > 2:4673/1‑141 CATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCATTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTGCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCCTCGGCCTCACAAGCAGAGGGGCGGCGGCTCGAc > 2:653684/1‑140 ATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAAC > 2:305768/1‑141 GGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCC > 2:528685/1‑141 GCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCG < 1:400733/141‑1 GCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGGCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCCGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTAGAACCCG > 2:920194/1‑141 CTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCagg > 1:371796/1‑138 cCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCCCAGCTGCGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTC < 2:163148/140‑1 TCCTTGGTCAAGCGGTTAAGCCACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTC < 2:681030/141‑1 TCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGGGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTC > 1:679266/1‑141 TCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTC > 1:679332/1‑141 cttgGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGGAACACGGGTGCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCA < 2:469120/137‑1 CCTTGGTCAAGCGGTTAAGACCCCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCA < 1:64070/141‑1 CCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAGCCCGTCA < 2:191444/141‑1 CCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAATCCGTCA < 2:510916/141‑1 CTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCAT > 2:253441/1‑141 TGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGGGGTTAGTAACCGTCATTC > 2:379149/1‑141 TGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTC > 1:688476/1‑141 TCAAGCGGTTAAGACACCGGCCTCTCACGGCGGTAACGCGGGTTCGAGTCCCGGAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTGGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCC < 2:135079/141‑1 CAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCA < 1:809114/141‑1 CAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCA < 1:814016/141‑1 CAACCGGTTAAGACGCCGCCCTCCCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGGCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCA < 1:26815/141‑1 cagtggttcacgCACCGCCCTTGCACGTCGCTAACCCGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTCGCTCAGCTGTGAGAGCATCTCCTTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCAt < 2:444654/129‑2 agttGGTTAAGACCCCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCAC < 2:489008/137‑1 aacCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTATGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTGGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCAC < 2:411911/138‑1 AAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCAC < 1:103190/141‑1 AAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCAC < 1:367645/141‑1 AAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCAC < 2:171557/141‑1 gGCGGGTACGACCCCGCCCTTTCGCGGCGGTAACGCGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGTAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACC < 1:386347/140‑1 AGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACCCGGGTTCGCGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACC < 1:929581/141‑1 GCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCc > 1:813826/1‑140 GCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCA > 1:360821/1‑141 GCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCGGGGAGAGCAACTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACaa > 1:305390/1‑139 CGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACCCGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAAAGCCTCTGCCGTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCAT < 1:385986/141‑1 CGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCAT > 1:613569/1‑141 CGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCAT > 1:172049/1‑141 gggTAAGACCCCGCCGTTTCACGGCGGGAACACGCGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGTAGAGCTCCTGCCTCACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGCACCCGTCATTCTCCACCATT < 1:604303/138‑1 GGTTAAGGCCCCGCCCTTTCCCGGCGGTAACCCGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCATT < 1:232402/141‑1 GGTTAAGACACCGCCCTTTCCCGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCATT < 1:424465/141‑1 GGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCATT < 2:895393/141‑1 tcAGACCCCGCCCTTTCACGCCGGCAACACGGGTTCGAGCCCCGTAGGAGTCATTATTTTGGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGTGTCGGCGGTTCGAACCCGGCATTCTCCACCATTctg < 2:258944/139‑4 |||||| CAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCATGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/1961647‑1961511‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAGAATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCATTTAT < CP000730/1998272‑1998192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |