| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP000730 | 512991 = | NA (NA) | noncoding (199/1540 nt) | rrs1 | 16S ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
CTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTGAGAGGGTGA > CP000730/512821‑513098 | cTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTACTACCGGATAatat > 2:470312/1‑149 (MQ=17)cTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAatat > 1:1144185/1‑149 (MQ=32) ggcgTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTCCCCATAAGACTGGGATAACTTCGGGGAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGa > 1:701512/1‑149 (MQ=12) ggcgTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGa > 1:1338804/1‑149 (MQ=32) ggCCTAATACATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCg < 2:1131897/148‑1 (MQ=17) aCATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGAGGGGTGGGTAACACGTGGATAACATACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGGTAATACCGAATAATATTTTAAAGCACATGGtta > 2:834035/1‑148 (MQ=11) aCATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAAATTTTTGGACGGCAGGGGTc > 1:502214/1‑149 (MQ=11) aTGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGGTAATATTTTGAACCGCATGGTTCaa > 1:1084411/1‑149 (MQ=17) aTGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAAccatgcggttcaa < 1:1072521/149‑12 (MQ=255) aTGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCaa > 1:668070/1‑149 (MQ=32) tGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGCAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCaaa > 1:998852/1‑149 (MQ=17) tGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGATGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCaaa > 1:667195/1‑149 (MQ=17) gCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTCATACCGGATAATATTTTGGACCGCCTGGGTCaaaa > 2:573205/1‑149 (MQ=255) gCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCacaa > 1:413382/1‑149 (MQ=17) gCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGAAAATATTTTGAACCGCATGGTCCaaaa > 2:89104/1‑149 (MQ=17) gCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACAGGATAATAGTTTTAACCGCAgggcctaaaa > 2:533614/1‑142 (MQ=11) cAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGGTAATACCGGGTAATATTTTCAACCGCATGGTTCAAAAg > 2:70133/1‑149 (MQ=12) tCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGaa > 2:232807/1‑149 (MQ=32) ccGAGCGAACGGGCGAGAAGCTTGCTTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTCTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGaa < 1:689967/148‑1 (MQ=12) 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gaggcctgcttCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGGGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGTCTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTCATACCGGATGATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTc < 2:551876/143‑1 (MQ=11) gaGCTTGCTTCTCGGATGTGAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCa < 2:553643/148‑1 (MQ=17) aaGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCa > 1:1146107/1‑149 (MQ=32) cgcctgcgtCTCTGATCTTAGCGGCGGACGGGTGAGGAACACGTGGATAACCGACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAACCCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCAc < 1:778547/145‑1 (MQ=11) ttCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGAATCGGGCAGACTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGa < 1:1322027/149‑1 (MQ=11) tctcGGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGAt < 2:972425/149‑1 (MQ=17) ttAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGTATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATATATGGATCcgcg < 1:856979/149‑1 (MQ=17) ttAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCcgcg < 1:13624/149‑1 (MQ=32) ttAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCcgcg < 1:1160291/149‑1 (MQ=32) aGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCt < 2:1254718/149‑1 (MQ=32) 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aCTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCAAATTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGAt > 1:1265676/1‑149 (MQ=12) tGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTGACGGCTTACCAAGGCAACGATGc > 1:218419/1‑149 (MQ=17) aTAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGCTCCGCGCTGCCTTAGCTAGTGGGTAAGGTCACGGCCTCCCAAGGCAACGATGCTTAg > 2:41528/1‑149 (MQ=11) aTAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTCGTTGGTAAGGTAACGGCTTACAAAGGCAACGATGCCTAg > 1:343847/1‑149 (MQ=12) aTAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAg < 2:1146107/149‑1 (MQ=32) aTAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCACGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAAGGATGCATAg > 1:1160715/1‑149 (MQ=17) ttCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAATGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGAc < 2:1089740/149‑1 (MQ=17) ctCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGAc < 2:461048/148‑1 (MQ=17) tCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAAAGATGAATAGCCGAcc > 2:1059294/1‑149 (MQ=17) gggAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTCGCTAGTTGGTAAGGTGACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTg > 2:663991/1‑149 (MQ=17) gggAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTg > 1:635137/1‑149 (MQ=32) gggAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTg > 1:527827/1‑149 (MQ=32) gggAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTg < 1:70133/149‑1 (MQ=32) gggAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGGCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTg > 2:107516/1‑149 (MQ=17) ggAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTc < 1:25598/70‑1 (MQ=35) tAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTGAGAGGGTGa > 1:80059/1‑149 (MQ=11) | CTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGAACGGACGAGAAGCTTGCTTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGATAACCTACCTATAAGACTGGGATAACTTCGGGAAACCGTAGCTAATACCGGATAATATTTTGAACCGCATGGTTCAAAAGTGAAAGACGGTCTTGCTGTCACTTATAGATGGATCCGCGCTGCATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTGAGAGGGTGA > CP000730/512821‑513098 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |