| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP000730 | 618412 = | 91 (0.960) | coding (3514/4146 nt) | sdrD | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrD | |||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
AGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCGG > CP000730/613962‑614257 | agaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCGGACAGTGATTCAGATTCAGAcc > 2:770230/1‑148 (MQ=255) cAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGCCTCGGATAGCGCCTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAg < 2:19965/149‑1 (MQ=255) cAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAg > 2:372048/1‑149 (MQ=255) cAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGAATCAg > 2:712812/1‑149 (MQ=255) actcagactcagACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCGGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGAcg > 1:897530/1‑140 (MQ=255) ctcagactcagaCAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTc < 1:1063256/141‑1 (MQ=255) ctcagactcagaCAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATACCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGAGTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGAGGCAGATTCAGACTc > 1:881979/1‑141 (MQ=17) tcagacCGCGATCCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGc < 1:669841/141‑1 (MQ=255) cagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGTCGCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGAt > 2:771447/1‑149 (MQ=255) cagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGAGAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGGGATTCAGATTCAGAcagagaaagag > 1:864178/1‑131 (MQ=14) agacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGAtt < 2:700615/149‑1 (MQ=255) agacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGAtt < 2:845420/149‑1 (MQ=255) aGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGAGATTCAGATTCAGACGCAGATAGCGAcacc > 1:184064/1‑138 (MQ=255) cGATTCCGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGa < 1:473955/141‑1 (MQ=255) cGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACa > 2:501105/1‑149 (MQ=255) gATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGAGTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACACTGATCCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGActg > 2:47295/1‑147 (MQ=255) aTTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGCTAGCGATTCCGATTCAGAAAGCGACTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGGCTCAGGCAGCGACTCaagtc > 1:129848/1‑137 (MQ=18) cAGACTGGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACGCAGATAGCGATTCAGATGCAGAGAGCGATGCGGACTCAGACAGGGATTCAGAATCAGACTCAGATAACGACTCAGATtgtg > 1:661331/1‑141 (MQ=18) cTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtcgg > 2:180922/1‑147 (MQ=255) 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atgcGGACAGCGACTTAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATTGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACa < 1:383002/138‑1 (MQ=255) agtCGGGTAGCGAGTAAGATTCAGATGGCGATGCAGATTCAGATAGCGATTCGGACGAAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACa < 1:16346/139‑1 (MQ=21) ggATAGCGGCTCAATCTCAGATCGCGAGTCAGATTCAGAGAGCGATACGGACTCAGACACTGATTCAGAGTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTga < 1:220703/141‑1 (MQ=21) gATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattcagattc < 2:61555/149‑1 (MQ=255) gtAGCGACTCAGACGCAGATAGCGAATCAGATTCAGATAGCGATTCGGACACAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgatt < 1:511769/140‑1 (MQ=255) aTAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattcagattca > 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attcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGACtcagattgagaag > 1:281367/1‑139 (MQ=255) tcagctAGCGATCCCGACTCAGACTGCGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcaga < 2:340414/149‑1 (MQ=17) tcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcaga < 2:847461/149‑1 (MQ=255) gcagatGCCGATTCGGACTCAGACACTGATTCCGATGCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGTCAGCGACTCAGATtcagatagc < 1:258143/140‑1 (MQ=17) gatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCCGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactc > 2:72071/1‑149 (MQ=255) 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ttcagattacgaCTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcagatagcg < 2:458948/149‑1 (MQ=255) ttcagactcagaCTCAGACAGCGACTCAGACTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactc < 1:965862/141‑1 (MQ=255) tcagattcagaCTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagcaagcaactcagactca > 1:981802/1‑141 (MQ=255) agattcagaCTCAGATACCTACTCAGATTCCTACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcaga < 1:764439/141‑1 (MQ=14) gattcagaCTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcagatagcgactc > 2:67713/1‑149 (MQ=255) cagaCTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcggctcagactcagataccgactcagactcagctagcg > 1:401001/1‑141 (MQ=255) cagaCTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcagatagcgactcagac > 2:503641/1‑149 (MQ=255) cagaCTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactaagacagcgacccaaactcacagaacg > 1:538002/1‑134 (MQ=14) agtcTCAGATCGCGACTCAGATTCCGACTGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGAGTCAGACAGCGACTCAGATTcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcagatagcgactcagact < 2:102686/146‑1 (MQ=14) gaCTCAGATAGCCACTCAGAATCTGACAGCCATTCAGCCACAGACTGCGACTCAGCCAGAGACGGTCATTCAGCTTCAGACAGCGGCtcagactcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcagatagcgac < 1:367943/141‑1 (MQ=14) cTCAGATAGCGATTCAGATCCTGACACAGATCAAAACTCAGACAGCGCTTCAGACTCCGACAGTGATTCAGATTCATACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCgg < 2:175226/149‑1 (MQ=17) cTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcagatagcgactc < 1:698280/141‑1 (MQ=255) | AGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCGG > CP000730/613962‑614257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |