New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 614109 | 142 (1.490) | 9 (0.090) | 4/286 | 10.9 | 7.2% | coding (2421/2844 nt) | sdrC | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrC |
? | CP000730 | 618412 = | 91 (0.960) | coding (3514/4146 nt) | sdrD | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrD | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AACATCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGAT > CP000730/618264‑618555 | aaCATCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATa > 2:784920/1‑149 (MQ=255) aTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATGCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCGGACAGAGACTCAGATAGTg > 2:272402/1‑149 (MQ=255) cAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTTAGAGTCAGATAGCAATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGAt < 2:600207/149‑1 (MQ=255) aGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGAtt < 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gcTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGAtt < 1:614988/140‑1 (MQ=255) cTCAGGTTCGGACAGCGACGCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTc < 1:553011/141‑1 (MQ=255) tCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGGTAGCGATTGAGATTGAGAAAGCGATTCAGATGGAGATAGCGATTCAGATTGAGACAGGGAGTAAGATTGTGGttaa > 1:581326/1‑139 (MQ=17) cAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGAt > 2:668644/1‑149 (MQ=255) gactCGGTCCGCGACTCATATTCAAACAGTGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGTCAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGAc < 1:975095/138‑1 (MQ=18) aTTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATagc > 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agacaggAACGCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATagcgactcagattcaga < 1:664280/141‑1 (MQ=255) agacagaGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATagcgactcagattcagacagcgact < 2:812543/149‑1 (MQ=255) agacagaGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATagcgactcagattcagacagcgact < 2:790895/149‑1 (MQ=255) ggactcagactcaGATAGTGATGCCGACTCGGATAGCGATTCAGATACAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATGCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATagcgactcagattcagacagcgactcagatt < 2:147258/148‑1 (MQ=255) agactcagactcAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATagcgactcagattcagacagcga < 1:1036815/141‑1 (MQ=255) gacgcagactcaGATAGTGACTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTAAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATagcgactcagattcagacagcgactcagattc < 2:324697/149‑1 (MQ=255) cagactcagaTAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATACAGATTCAGACTCAGATaccgacccagattcagacagcgacgcag > 1:160232/1‑141 (MQ=21) aaactcaggTGGTGATTCAGACTCGGAGAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGTGACTCCGATAGTGATTCAGACTCAGATagcgactcagattcagacagcgactcaga < 1:666475/139‑1 (MQ=21) actcagaTAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATGGTGATACAGACTCAGATagcgactgagattcagacagcgactcaaatt > 1:762325/1‑141 (MQ=255) actcagaTAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTAAGACAGAGACTCAGATAGTGAGTCAGACCCAGGTagcgactcagatgcagccggcgacgcagatt > 1:454869/1‑141 (MQ=18) actcagaTAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGAGACTCAGATACAGATCCAGACTCAGATagcgacgcagactcagacagcgacaccgatc > 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gattcagattcaGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTc > 2:898033/1‑149 (MQ=255) attcagattcagACGGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATCCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCAACTCAGATCCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGAtt < 1:307173/141‑1 (MQ=255) agcgcaaacccgaCCGCGCTTAAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGAGACTCAGATAGCGATGCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGCCTCAGATAGTGAtt < 1:1191977/130‑1 (MQ=17) ttcagattcagaCAGAAATTCAGAGGCAGATAGTGATTCAAAATCAGACAAAGGCTCAGACAGTGATGCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTc < 1:428933/141‑1 (MQ=18) ttcagaaccagaCGGCGATTCAGCTTCAGATAGCGATTCAGAATCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGAGAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTc < 1:619018/141‑1 (MQ=18) gtcacagacagaGATTCAAACTCAGATAGCGATTCAGATACAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCATACAGCGACTCAGATCCAGACTGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGAc < 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |