| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2679162 = | 111 (1.120) | 3 (0.030) | 3/246 | NT | 2.7% | intergenic (+34/‑355) | USA300HOU_2535/cbpD | hypothetical protein/possible secretory antigen |
| ? | CP000730 | 2679186 = | 107 (1.130) | intergenic (+58/‑331) | USA300HOU_2535/cbpD | hypothetical protein/possible secretory antigen | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GTGAAATATTGTCATATTTTCGAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATC > CP000730/2679022‑2679302 | gTGAAATATTGTCATATTTTCGAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGAACAAACACAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGtt > 1:709718/1‑141 (MQ=255) gtgatacaaggatgtcaggattgattaacagcggatattagtgggaaaatataaaatgatttaaaaaaaaggtacatggttctataactgaaagaaaatagcaatcacaatatactaaatgtagcaataacattaaaaaTa < 1:344313‑M1/2‑1 (MQ=255) tgatacaaggatgtcaggattgattaacagcggatattagtgggaaaatataaaatgatttaaaaaaaaggtacatggttctataactgaaagaaaatagcaatcacaatatactaaatgtagcaataacattaaaaaTAg < 2:1112674‑M1/3‑1 (MQ=255) atacaaggatgtcaggattgattaacagcggatattagtgggaaaatataaaatgatttaaaaaaaaggtacatggctctataactgaaagaaaatagcaatcacaatatactaaatgtagcaataacattaaaaaTAgcg < 1:948367‑M1/5‑1 (MQ=255) tacaaggatgtcaggattgattaacagcggatattagtgggaaaatataaaatgatttaaaaaaaaggtacatggttctataactgaaagaaaatagcaatcacaatatactaaatgtagcaataacattaaaaaTAgcgc < 2:181093‑M1/6‑1 (MQ=255) tacaaggatgtcaggattgattaacagcggatattagtgggaaaatataaaatgatttaaaaaaaaggtacatggttctataactgaaagaaaatagcaatcacaatatactaaatgtagcaataacattaaaaaTAgcgc < 2:1136527‑M1/6‑1 (MQ=255) atatTGTCATATTTTCGAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAgcgc > 2:372936/1‑141 (MQ=255) tGTCATATTTTCGAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCCCTg < 2:211978/141‑1 (MQ=255) atTTTCGAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCa > 1:921690/1‑141 (MQ=255) tCGAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGgc < 2:18202/141‑1 (MQ=255) ttgattaacagcggatattagtgggaaaatgtaaaatgatttaaaaaaaaggtacatggttctataactgaaagaaaatagcaatcacaatatactaaatgtagcaataacattaaaaaTAGCGCTCTGATTGCAGGgcgc > 1:987275‑M1/120‑141 (MQ=255) gAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGgcgc < 2:288233/141‑1 (MQ=255) gAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGgcgc < 2:803592/141‑1 (MQ=255) aaCAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCt < 1:226649/141‑1 (MQ=255) aaTCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTAttt > 2:1058084/1‑141 (MQ=255) aaTCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTAttt > 1:598164/1‑141 (MQ=255) cATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCGTGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTaa > 2:667617/1‑141 (MQ=255) cATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTaa > 2:90873/1‑141 (MQ=255) aTGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAAt > 2:1112219/1‑141 (MQ=255) tGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATg < 2:700761/141‑1 (MQ=255) gTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGt > 1:1041657/1‑141 (MQ=255) tCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGtt > 2:500950/1‑141 (MQ=255) ccTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGTAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTa > 2:948367/1‑141 (MQ=255) cTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTAt > 1:816503/1‑141 (MQ=255) tGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTAtt < 1:39507/141‑1 (MQ=255) gAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTg < 1:714560/141‑1 (MQ=255) gAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTg < 2:767060/141‑1 (MQ=255) gCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTAc < 2:974655/141‑1 (MQ=255) gCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTAc < 2:44250/141‑1 (MQ=255) tctcAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACAtt > 2:217188/1‑141 (MQ=255) tctcAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACAtt < 2:656849/141‑1 (MQ=255) tctcAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACAtt > 1:778247/1‑141 (MQ=255) aGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGt > 1:645692/1‑141 (MQ=255) gTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGta < 1:146535/141‑1 (MQ=255) gTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGta > 2:671245/1‑141 (MQ=255) ccTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTatat > 1:309284/1‑141 (MQ=255) cTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATAtt > 1:1146688/1‑141 (MQ=255) tatAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGAt < 1:288938/139‑1 (MQ=255) ttAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGAtt > 2:62958/1‑141 (MQ=255) aaCGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCt > 1:72902/1‑141 (MQ=255) aaCGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCt > 1:358068/1‑141 (MQ=255) aCGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGTTTGCTa > 1:806935/1‑141 (MQ=255) gggCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTAtt < 1:632226/141‑1 (MQ=255) gCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTTATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTAtttt < 2:512716/141‑1 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1:1187475/141‑1 (MQ=255) aTCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATtttctttc > 1:1023074/1‑141 (MQ=255) aTCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATtttctttc < 1:75376/141‑1 (MQ=255) cAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAg < 1:372936/141‑1 (MQ=255) aGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGt < 1:1114256/141‑1 (MQ=255) ttCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTtata < 1:648753/141‑1 (MQ=255) cAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGa > 2:223857/1‑141 (MQ=255) aaCCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGaa < 2:256435/141‑1 (MQ=255) aaCCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGaa > 2:7454/1‑141 (MQ=255) aTTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCAGCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATg < 1:206389/141‑1 (MQ=255) ttCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGt < 2:80847/141‑1 (MQ=255) acaAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTAcc > 1:202625/1‑141 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1:910629/1‑141 (MQ=255) gTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCtttt‑tt > 2:88211/1‑141 (MQ=255) tACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCtttt‑ttt < 2:309284/141‑1 (MQ=255) tACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCtttt‑ttt > 2:964837/1‑141 (MQ=255) cAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTa < 2:450614/141‑1 (MQ=255) cAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTa > 2:405070/1‑141 (MQ=255) aTGATACATGAATACATGGAGTCACATCATAACATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTaaa > 1:929649/1‑141 (MQ=255) cATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCAttt > 1:566390/1‑141 (MQ=255) tGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTta < 1:1092675/141‑1 (MQ=255) tGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCCATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTta > 1:1116517/1‑141 (MQ=255) gAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTGCCTTTT‑TTTTAAATCATTTtat < 2:268733/141‑1 (MQ=255) aaTACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTtata > 2:1067948/1‑141 (MQ=255) tACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATAtt > 1:1085772/1‑141 (MQ=255) tGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTcc > 2:121224/1‑141 (MQ=255) aGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATCGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCACGTACCTTTTCTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCa > 2:413803/1‑141 (MQ=255) gTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACt < 1:515991/141‑1 (MQ=255) gTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACt < 1:706560/141‑1 (MQ=255) tCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTa < 2:7652/141‑1 (MQ=255) tCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTa < 2:145123/141‑1 (MQ=255) acaTCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGTGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAat < 1:493352/141‑1 (MQ=255) catcatCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAata > 1:627940/1‑141 (MQ=255) atcatcTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAatat < 2:441789/141‑1 (MQ=255) tcatcTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATc > 1:998279/1‑141 (MQ=255) catcTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATcc < 2:759397/141‑1 (MQ=255) catcTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATcc < 1:287553/141‑1 (MQ=255) catcTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATcc < 1:51283/141‑1 (MQ=255) catcTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATcc < 1:497225/141‑1 (MQ=255) tctcATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGc > 1:251175/1‑141 (MQ=255) ctcATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCt < 2:717287/141‑1 (MQ=255) cATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGt > 2:1177745/1‑141 (MQ=255) tGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTa > 2:902864/1‑141 (MQ=255) gTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaa < 2:514996/141‑1 (MQ=255) gTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaa < 2:1048602/141‑1 (MQ=255) ttAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaat < 1:760986/141‑1 (MQ=255) | GTGAAATATTGTCATATTTTCGAACAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTGATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTT‑TTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATC > CP000730/2679022‑2679302 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |