| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2679162 = | 111 (1.120) | 3 (0.030) | 3/246 | NT | 2.7% | intergenic (+34/‑355) | USA300HOU_2535/cbpD | hypothetical protein/possible secretory antigen |
| ? | CP000730 | 2679186 = | 107 (1.130) | intergenic (+58/‑331) | USA300HOU_2535/cbpD | hypothetical protein/possible secretory antigen | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCTGACATCCTTGTATCAC > CP000730/2679046‑2679324 | cAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTAt > 2:49143/1‑141 (MQ=255) aaTCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTAttt > 1:598164/1‑141 (MQ=255) aaTCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTAttt > 2:1058084/1‑141 (MQ=255) tCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGCGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTAttttt < 2:85094/141‑1 (MQ=255) ccATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTa < 1:271489/141‑1 (MQ=255) cATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCGTGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTaa > 2:667617/1‑141 (MQ=255) aTGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAAt > 2:1112219/1‑141 (MQ=255) tGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATg < 2:700761/141‑1 (MQ=255) gTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGt > 1:1041657/1‑141 (MQ=255) tCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGtt > 2:500950/1‑141 (MQ=255) ccTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGTAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTa > 2:948367/1‑141 (MQ=255) cTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTAt > 1:816503/1‑141 (MQ=255) tGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTAtt < 1:39507/141‑1 (MQ=255) gAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTg < 2:767060/141‑1 (MQ=255) gAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTg < 1:714560/141‑1 (MQ=255) gCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTAc < 2:44250/141‑1 (MQ=255) tctcAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACAtt < 2:656849/141‑1 (MQ=255) tctcAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACAtt > 2:217188/1‑141 (MQ=255) tctcAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACAtt > 1:778247/1‑141 (MQ=255) aGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGt > 1:645692/1‑141 (MQ=255) gTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGta < 1:146535/141‑1 (MQ=255) cTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATAtt > 1:1146688/1‑141 (MQ=255) aaatgatttaaaaaaaaggtacatggttctataactgaaagaaaatagcaatcacaatatactaaatgtagcaataacattaaaaatagcgctctgattgcagggcgctaTTTTTAATGTTATTg > 2:556557‑M2/111‑125 (MQ=255) gTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATtgt > 1:315219/1‑141 (MQ=255) tAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATCGCTACATTTAGTATATtgtg < 2:163799/141‑1 (MQ=255) tatAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGAt < 1:288938/139‑1 (MQ=255) gggCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTAtt < 1:632226/141‑1 (MQ=255) gCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTT‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTAtttt < 2:512716/141‑1 (MQ=255) gCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTAtttt < 1:340839/141‑1 (MQ=255) gCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTAtttt < 1:129298/141‑1 (MQ=255) cACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATtttc > 2:296728/1‑141 (MQ=255) cTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACAAGAATACATGGAGTCACATCATCGCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATtttctt > 2:1012850/1‑141 (MQ=255) tATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCGGCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATGGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATtttcttt < 1:1187475/141‑1 (MQ=255) aTCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATtttctttc < 1:75376/141‑1 (MQ=255) aTCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATtttctttc > 1:1023074/1‑141 (MQ=255) cAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAg < 1:372936/141‑1 (MQ=255) aGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGt < 1:1114256/141‑1 (MQ=255) ttCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTtata < 1:648753/141‑1 (MQ=255) aaCCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGaa > 2:7454/1‑141 (MQ=255) aaCCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGaa < 2:256435/141‑1 (MQ=255) aTTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCAGCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATg < 1:206389/141‑1 (MQ=255) tCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTa > 1:692/1‑141 (MQ=255) acaAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTAcc > 1:945/1‑141 (MQ=255) acaAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTAcc > 2:373621/1‑141 (MQ=255) acaAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTAcc > 1:202625/1‑141 (MQ=255) acaAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACAATGTAcc > 1:725113/1‑141 (MQ=255) caAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCt < 2:358068/141‑1 (MQ=255) aaTGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCttt < 2:602984/141‑1 (MQ=255) aaTGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCttt < 2:649298/141‑1 (MQ=255) aTGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCtttt > 1:825853/1‑141 (MQ=255) tGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCttttt > 1:910629/1‑141 (MQ=255) gTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCtttttt < 1:370809/141‑1 (MQ=255) gTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCtttttt > 2:88211/1‑141 (MQ=255) tACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCttttttt > 2:964837/1‑141 (MQ=255) cAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTa > 2:405070/1‑141 (MQ=255) cATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCAttt > 1:566390/1‑141 (MQ=255) tGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTta < 1:1092675/141‑1 (MQ=255) tGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCCATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTta > 1:1116517/1‑141 (MQ=255) gAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTGCCTTTTTTTTAAATCATTTtat < 2:268733/141‑1 (MQ=255) aaTACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTtata > 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gTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACt < 1:706560/141‑1 (MQ=255) tCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTa < 2:7652/141‑1 (MQ=255) tCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTa < 2:145123/141‑1 (MQ=255) caataacattaaaaaTAGCGCCCTGCAAT‑CAGAGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCAttt > 2:556557‑M1/16‑125 (MQ=255) caataacattaaaaaTAGCGCCCTGCAAT‑CAGAGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCAttt < 1:556557‑M1/110‑1 (MQ=255) acaTCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGTGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAat < 1:493352/141‑1 (MQ=255) catcatCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAata > 1:627940/1‑141 (MQ=255) atcatcTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAatat < 2:441789/141‑1 (MQ=255) tcatcTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGATCCATGTACCTCTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATc < 2:421653/141‑1 (MQ=255) tcatcTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATc > 1:998279/1‑141 (MQ=255) catcTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATcc < 1:287553/141‑1 (MQ=255) catcTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATcc < 1:51283/141‑1 (MQ=255) catcTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATcc < 1:497225/141‑1 (MQ=255) ctcATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCt < 2:717287/141‑1 (MQ=255) cATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGt > 2:1177745/1‑141 (MQ=255) tGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTa > 2:1152983/1‑141 (MQ=255) tGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTa > 2:902864/1‑141 (MQ=255) gTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaa < 2:1048602/141‑1 (MQ=255) ttAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaat < 1:760986/141‑1 (MQ=255) TAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaatc > 1:500950‑M1/1‑141 (MQ=255) AGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaatca < 1:108661‑M1/141‑1 (MQ=255) AGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaatca < 1:181093‑M1/141‑1 (MQ=255) gcgccctgcaatcagagcgctaTTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTACATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaatcaa > 1:987275‑M2/23‑141 (MQ=255) CGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaatcaat < 2:129347‑M1/141‑1 (MQ=255) CGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaatcaat < 2:213147‑M1/141‑1 (MQ=255) GCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAGCCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTaatcaatc < 1:711776‑M1/141‑1 (MQ=255) tctG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCt < 1:1079468/141‑1 (MQ=255) gg‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGAGGGCTTTTGTCTGCCGTTGAGGGTGTCAGGTACCTTTGGTGTAAGGCATGTTATATTTTCCCGCGAATAGCCGCGGTTAATCAATCCTGa > 1:1009604/2‑141 (MQ=255) aTTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCTGACa < 1:373621/141‑1 (MQ=255) gCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATTAATCCTGACATcc > 2:1144233/1‑141 (MQ=255) cAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAATTCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCTGAcctcct > 2:425999/1‑141 (MQ=255) gcgctaTTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCTGACATCCTTGTa < 2:1136527‑M2/135‑1 (MQ=255) cgctaTTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAGCCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCTGACATCCTTGTAt < 1:948367‑M2/136‑1 (MQ=255) ctaTTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCTGACATCCTTGTATCa < 2:1112674‑M2/138‑1 (MQ=255) taTTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCTGACATCCTTGTATCAc < 1:344313‑M2/139‑1 (MQ=255) | CAAATCCATGTCCTGAAAGCATCTCAGTACCTGTAATTAAACGGGCACTATCAGTTTTCAACCAATTCACAAATGTACAATGATACATGAATACATGGAGTCACATCATCTCATGTTAGCGCTCTG‑ATTGCAGGGCGCTATTTTTAATGTTATTGCTACATTTAGTATATTGTGATTGCTATTTTCTTTCAGTTATAGAACCATGTACCTTTTTTTTAAATCATTTTATATTTTCCCACTAATATCCGCTGTTAATCAATCCTGACATCCTTGTATCAC > CP000730/2679046‑2679324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |