| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | = 2850830 | 103 (1.040) | 4 (0.050) | 4/230 | NT | 3.9% | intergenic (+29/+90) | pcp/USA300HOU_2693 | C15 family pyroglutamyl‑peptidase I/hypothetical protein |
| ? | CP000730 | = 2850851 | 104 (1.180) | intergenic (+50/+69) | pcp/USA300HOU_2693 | C15 family pyroglutamyl‑peptidase I/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
CCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATGTATAAATAATAAA > CP000730/2850691‑2850970 | cccGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAt > 2:105411/1‑141 (MQ=255)cccGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAACCTAAt > 2:641596/1‑141 (MQ=255) tACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGtt > 2:927425/1‑141 (MQ=255) acacCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTa > 1:440150/1‑141 (MQ=255) acacCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTa < 1:1185987/141‑1 (MQ=255) cacCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAg > 2:830000/1‑141 (MQ=255) ccATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGtt > 2:1085717/1‑141 (MQ=255) ccATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGAAACGATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGtt < 1:611829/141‑1 (MQ=255) tCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTaa > 2:535873/1‑141 (MQ=255) tATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGt < 1:479411/141‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |