New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 1417767 = | 92 (1.010) | 3 (0.040) | 3/254 | 13.2 | 3.5% | coding (152/831 nt) | oppD | oligopeptide ABC superfamily ATP binding cassette transporter, membrane protein |
? | CP000730 | 1417824 = | 83 (1.000) | coding (95/831 nt) | oppD | oligopeptide ABC superfamily ATP binding cassette transporter, membrane protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTGTATCCGGCAAATAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAATATCAGGTTATTCTTTGAAAAT > CP000730/1417629‑1417907 | ttGTATCCGGCACATATACCCAGTCTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATaaa < 1:321650/141‑1 (MQ=255) tGTATCCGGCAAATAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAAt < 2:449763/141‑1 (MQ=255) tGTATCCGGCAAATAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAAt < 2:370480/141‑1 (MQ=255) gTATCCGGCAAATAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATg > 1:348472/1‑141 (MQ=255) aTCCGGCAAATAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGca < 1:505412/141‑1 (MQ=255) ttttttaaaTAGAACTAGTGTAACACCTATGTTAACTATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTTCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTAT‑CTCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGcaa > 2:949317/7‑141 (MQ=255) cGGCAAATAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGcaacc > 1:242853/1‑141 (MQ=255) cAAATAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGcaaccaac < 1:393917/141‑1 (MQ=255) aaTAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTa < 2:154811/141‑1 (MQ=255) tAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAAt > 2:358686/1‑141 (MQ=255) aGTGTAACACCGATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCa < 1:564849/141‑1 (MQ=255) tAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGTACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAg < 2:832169/141‑1 (MQ=255) tAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAg < 2:448158/141‑1 (MQ=255) aaCACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGt > 1:726782/1‑141 (MQ=255) aaCACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGt < 2:844199/141‑1 (MQ=255) acacCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCTCCCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGt > 1:93245/1‑141 (MQ=255) cacCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGttt > 1:318960/1‑141 (MQ=255) acCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTtg < 2:1035838/141‑1 (MQ=255) cTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTtgtg > 2:818116/1‑141 (MQ=255) aCGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTg < 2:321353/141‑1 (MQ=255) tAGCTATCAATGTTAAAACAGTAACCAAACATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGAAAACAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATCCAACCAACTCATAGGTGCAAAAGTTTGTGATAAATAGACtt > 2:314132/1‑141 (MQ=255) aGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACttt > 1:153962/1‑141 (MQ=255) aGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAAATCGGGTAAATAAATCTCT‑ACCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACAAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACatt > 2:474874/1‑141 (MQ=255) cTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTgg < 1:21448/141‑1 (MQ=255) cTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTgg > 1:232079/1‑141 (MQ=255) cTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTgg < 1:550542/141‑1 (MQ=255) cTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTgg < 2:84166/141‑1 (MQ=255) tttAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCAACGATTATAATTCGGGTAAATAAATCGCC‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATTCAACCAACTCATAGGTTCACAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGtt < 2:514879/140‑1 (MQ=255) aTTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGtt < 1:553347/141‑1 (MQ=255) aaTGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCa < 2:211497/141‑1 (MQ=255) aTGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCAt < 1:424312/141‑1 (MQ=255) ttAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCAtttt < 1:794017/141‑1 (MQ=255) aaaaCAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCa > 2:390547/1‑141 (MQ=255) aGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAAt > 1:681338/1‑116 (MQ=255) aGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAAt < 2:681338/116‑1 (MQ=255) aGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCactact > 1:37109/1‑141 (MQ=255) gTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTg < 2:810659/141‑1 (MQ=255) tAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGa > 2:225756/1‑141 (MQ=255) tAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGATAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATGAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTTACTTTTGTTGCATTTTCACTACTGa < 2:80803/141‑1 (MQ=255) aacaaacaATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGAc < 2:455881/141‑1 (MQ=255) acaaacaaTGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAGGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACa > 1:538908/1‑141 (MQ=255) acaaacaaTGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACa < 2:249968/141‑1 (MQ=255) acaaacaaTGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACa > 1:611003/1‑141 (MQ=255) acaaacaaTGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTCCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGCTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACCTTGGTTGCATTTTCACTACTgtcc > 2:718241/1‑138 (MQ=255) caaacaaTGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACaa > 2:97316/1‑141 (MQ=255) acaaTGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATTAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGa > 2:361876/1‑141 (MQ=255) acaaTGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGa < 2:170141/141‑1 (MQ=255) ttGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCa > 1:278064/1‑141 (MQ=255) ttGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCa > 2:362285/1‑141 (MQ=255) 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1:302386/141‑1 (MQ=255) gCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGATCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAAtt > 2:155064/1‑141 (MQ=255) cACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTa < 1:395683/141‑1 (MQ=255) aCCGATAATAATTCGGGTAAATAAACATCT‑CCAATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTAAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTATCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATAAc < 2:182363/141‑1 (MQ=255) gATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACcac < 1:967023/141‑1 (MQ=255) taataaTTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGCTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACaa > 1:171471/1‑141 (MQ=255) 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1:847814/1‑141 (MQ=255) atCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATAc < 2:329352/141‑1 (MQ=255) tct‑cCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACaaa > 2:205053/1‑141 (MQ=255) tct‑cCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACaaa > 2:327830/1‑141 (MQ=255) ct‑cCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCGACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACaaaa < 2:124833/141‑1 (MQ=255) ct‑cCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGATTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGAAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACaaaa < 2:845043/141‑1 (MQ=255) ccATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAat < 1:499486/141‑1 (MQ=255) ccATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATAAAAAAAat < 2:140080/141‑1 (MQ=255) ccATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACAACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAat > 1:527141/1‑141 (MQ=255) ccATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACCTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAat > 2:737981/1‑141 (MQ=255) catcaGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAATATCAGGt > 2:780212/1‑141 (MQ=255) catcaGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAATATCAGGt > 1:739887/1‑141 (MQ=255) aGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAATATCAGGTTAtt > 2:747643/1‑141 (MQ=255) aataaATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAATATCAGGTTATTCTTTGaa < 2:726979/141‑1 (MQ=255) ataaATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAATATCAGGTTATTCTTTGaaa > 1:875008/1‑141 (MQ=255) aaaTGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGACTTGCAGTACAATTACCACAAAAATTAATGCAACGAATACAAAAAATATCAGGTTATTCTTTGAAAat < 1:122017/141‑1 (MQ=255) | TTGTATCCGGCAAATAGACCTAGTGTAACACCTATGACAACGATAGCTATTAATGTTAAAACAGTAACAAACAATGTTGAACGTGCACCGATAATAATTCGGGTAAATAAATCTCT‑CCCATAATCATCAGTTCCTAATAAATGCAACCAACTAATAGGTTCAAAAGTTTGTGATAAATTGACTTTGGTTGCATTTTCACTACTGACAAAGAATTGCAGTACAATTACCACAAAAATAAATGCAACGAATACAAAAAATATCAGGTTATTCTTTGAAAAT > CP000730/1417629‑1417907 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |