Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	1040830	1040993	164	3 [1]	[0] 2	USA300HOU_0983/USA300HOU_0984	competence protein/glycosyltransferase

ATACATTATACAATAAAATTAAATTGTGCGGTAGAAGAATTTGAAATTAAATTGAATTGTTTTTGGTAGTTGGTATATTTATAACACTCTGCAAAAGAATGTAGCAAAATTAGATAAATTAGATTATTTAAAATTATGCGTGAT  >  CP000730/1040727‑1040870                                                                                                       |                                          aTACATTATACAATAAAATTAAATTGTGCGGTAGAAGAATTTGAAATTAAATTGAATTGTTTTTGGTAGTTGGTATATTTATAACACTCTGCAAAAGAATGTa                                           >  1:9005/1‑103 (MQ=255) aTACATTATACAATAAAATTAAATTGTGCGGTAGAAGAATTTGAAATTAAATTGAATTGTTTTTGGTAGTTGGTATATTTATAACACTCTGCAAAAGAATGTa                                           <  2:9005/103‑1 (MQ=255)    cATTATACAATAAAATTAAATTGTGCGGTAGAAGAATTTGAAATTAAATTGAATTGTTTTTGGTAGTTGGTATATTTATAACACTCTGCAAAAGAATGTAGCAAAATTAGATAAATTAGATTATTTAAAATTATGCGTGat  <  2:76337/141‑1 (MQ=255)                                                                                                       |                                          ATACATTATACAATAAAATTAAATTGTGCGGTAGAAGAATTTGAAATTAAATTGAATTGTTTTTGGTAGTTGGTATATTTATAACACTCTGCAAAAGAATGTAGCAAAATTAGATAAATTAGATTATTTAAAATTATGCGTGAT  >  CP000730/1040727‑1040870

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑