| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | = 2460586 | 89 (1.290) | 3 (0.050) | 3/278 | 2.2 | 3.5% | coding (689/900 nt) | natA | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| ? | CP000730 | = 2460640 | 85 (1.330) | coding (635/900 nt) | natA | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TGGAATCGTTTAACATAACCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGC > CP000730/2460436‑2460736 | gTTTAACATAACCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAAt > 2:233854/1‑151 (MQ=255) gTTTAACATAACCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAAt > 1:703468/1‑151 (MQ=255) gTTTAACATAACCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAAt < 1:463925/151‑1 (MQ=255) gTTTAACATAACCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAAt < 1:413279/151‑1 (MQ=255) tttAACATAACCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTTCGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTCTTGTTTCTGATTCAATg < 1:841758/151‑1 (MQ=255) tttAACATAACCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATg < 2:110347/151‑1 (MQ=255) aCCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTc > 2:952074/1‑151 (MQ=255) ccTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCt > 1:365845/1‑151 (MQ=255) ccTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCt > 1:959524/1‑151 (MQ=255) ttGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTg < 2:493321/151‑1 (MQ=255) tgtgCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTAc < 1:902693/151‑1 (MQ=255) gtgCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTAcc < 2:896916/151‑1 (MQ=255) tgCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCa > 1:22325/1‑151 (MQ=255) 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ggtgatatcaatcatgtacgtgcatctaatggtaacaagaaagttgtcattgaatcagaaacaacactaccagatttaacaaacattagaggcatcattcatagtgaaaacatgaagcaaggtcttcagttgacgattgagaatgaagacg > 1:92193‑M1/1‑1 (MQ=255) gATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaacaacactaccagatttaacaaacattagaggcatcattcatagtgaaaaacatgaagcaaggtcttcagttgacgattgagaatgaagac < 1:378768‑M2/151‑97 (MQ=255) | TGGAATCGTTTAACATAACCTTGATGTGCCACAACTTGATAAATATCTTTGGCTACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGC > CP000730/2460436‑2460736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |