| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2460586 | 89 (1.290) | 3 (0.050) | 3/278 | 2.2 | 3.5% | coding (689/900 nt) | natA | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| ? | CP000730 | = 2460640 | 85 (1.330) | coding (635/900 nt) | natA | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGG > CP000730/2460490‑2460789 | aCGTCTTCATTCTCGATCGTCCACTGCAGACCTTGCTTCAGGCTTTCACTATGAATGGTGCCTCTGATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACCACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACAAGATTGATATCAc < 2:995204/151‑1 (MQ=255)aCGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCAc < 2:995239/151‑1 (MQ=255) cGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTNGATGCACGTACATGATTGATATCAcn < 1:923028/151‑2 (MQ=255) cGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCGCGTACATGATTGATATCACc > 2:774868‑M2/1‑150 (MQ=255) cGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACc > 1:945356‑M2/1‑150 (MQ=255) cGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACc > 1:92193‑M2/1‑150 (MQ=255) tCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcag < 1:332585‑M2/151‑4 (MQ=255) cTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGACGCACGTACATGATTGATATCACcaga < 2:840497‑M2/151‑5 (MQ=255) tCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaa < 2:194023‑M2/151‑7 (MQ=255) cATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaac < 2:382627‑M2/151‑8 (MQ=255) cATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaac > 1:164985‑M2/1‑144 (MQ=255) cATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaac > 1:705176‑M2/1‑144 (MQ=255) cATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCAGGTTTGCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACGTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaac > 1:309533‑M2/1‑144 (MQ=255) aTTCTCAATCGTCAACTGAAGATCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaaca > 2:39728‑M2/1‑143 (MQ=255) aTTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaaca < 1:175487‑M2/151‑9 (MQ=255) tctcAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACcagaaacaac < 2:882960‑M2/151‑11 (MQ=255) tcAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAAcaacaa > 2:784864/1‑151 (MQ=255) cAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAg > 2:77603/1‑151 (MQ=255) 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tGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATAc < 2:122268/151‑1 (MQ=255) cTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCGTTATCTAAAATACaa > 1:882398/1‑151 (MQ=255) tCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAAc > 2:222801/1‑151 (MQ=255) tCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAAc > 2:822625/1‑151 (MQ=255) tCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAAc < 1:1027449/151‑1 (MQ=255) 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cGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTtaata < 2:128283/151‑1 (MQ=255) tgattgatATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCaa > 2:204153/1‑151 (MQ=255) gattgatATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAAc < 2:823953/151‑1 (MQ=255) gattgatATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAAc < 2:693834/151‑1 (MQ=255) attgatATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACa < 2:462394/151‑1 (MQ=255) 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aCCAGAAACAACAGGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCAGCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAAAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAACCATTTAATACTTTAACTGATTCTTTTAATAACTCAACATTAACTgcg > 2:520337/1‑149 (MQ=255) aCCAGAAACAACACGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTGTAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTggg < 1:76592/151‑1 (MQ=255) | ACGTCTTCATTCTCAATCGTCAACTGAAGACCTTGCTTCATGTTTTCACTATGAATGATGCCTCTAATGTTTGTTAAATCTGGTAGTGTTGTTTCTGATTCAATGACAACTTTCTTGTTACCATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGG > CP000730/2460490‑2460789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |