| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | 82395 = | 137 (1.980) | 8 (0.120) | 4/292 | 2.1 | 5.7% | coding (500/957 nt) | nikA | nickel (Ni2+)/peptide ABC superfamily ATP binding cassette transporter, membrane protein |
| ? | CP000730 | 82432 = | 132 (1.960) | coding (537/957 nt) | nikA | nickel (Ni2+)/peptide ABC superfamily ATP binding cassette transporter, membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GTTACTTCGTTGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCAATCTTCACAATTGTTGTTATAGAAGGGTGTCATATCTTATTGATGACAGCACATCTGATTACACAAACGTTAGATCAAGATGCGTATCAACTGGCGCAGTTAAGACATTTTTCGTTAAAAGC > CP000730/82245‑82545 | ggtgcaaatatctctttaatttgtacgatgatacgcgcttttaacgaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattg < 2:831895‑M1/1‑1 (MQ=255)ggtgcaaatatctctttaatttgtacgatgatacgcgcttttaacgaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattg < 1:494648‑M1/1‑1 (MQ=255)ggtgcaaatatctctttaatttgtacgatgatacgcgcttttaacgaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattg > 2:746991‑M1/151‑151 (MQ=255)ggtgcaaatatctctttaatttgtacgatgatacgcgcttttaacgaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattg < 1:243584‑M1/1‑1 (MQ=255)gTTACTTCGTTGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTgtaggtag < 2:323413/151‑1 (MQ=255) tgcaaatatctctttaatttgtacgatgatacgcgcttttaacgaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattgtg > 2:94851‑M1/149‑151 (MQ=255) tgcaaatatctctttaatttgtacgatgatacgcgcttttaacgaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattgtg > 2:606078‑M1/149‑151 (MQ=255) tACTTCGTTGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTg < 1:339098/151‑1 (MQ=255) tACTTCGTTGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTg < 1:391778/151‑1 (MQ=255) gcaaatatctctttaatttgtacgatgatacgcgcttttaacgaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattGTGa < 2:401695‑M1/4‑1 (MQ=255) cTTCGTTGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGGACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGAt > 1:72762/1‑151 (MQ=255) ttCGTTGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGGTACCATTTGTAGGTAGTGAtt < 2:239231/151‑1 (MQ=255) cGTTGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCa < 1:1017188/151‑1 (MQ=255) gTTGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCAt > 2:714516/1‑151 (MQ=255) tGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATgg < 1:998032/151‑1 (MQ=255) tGGGACGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATgg < 1:385846/151‑1 (MQ=255) aCGCGTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAac > 2:186518/1‑151 (MQ=255) gTCCGCATACACGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAGTACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACtt < 2:52310/151‑1 (MQ=255) 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cGTTACGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCaa < 1:461195/151‑1 (MQ=255) atacgcgaaaaaaaagaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattGTGAAGATTGGCAACACTTTGTGCTGCCAAt > 2:356657‑M1/121‑151 (MQ=255) cGCTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCAATCTTc > 2:254611/1‑151 (MQ=255) cTAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGcctggctttaa > 2:625072/1‑142 (MQ=255) tAATGGAATTCGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCAATCTTcaca < 1:497457/151‑1 (MQ=255) 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gaaaaatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCAATCTTCACAATtgttgt > 2:984756‑M1/106‑151 (MQ=255) cGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCAATCTTCACAATTGTTGTta > 2:832803/1‑151 (MQ=255) cGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCAATCTTCACAATTGTTGTta < 2:685120/151‑1 (MQ=255) cGTGGATTCGCCCAAGTGATGACCTCAATGCCAGAATACTGGTTAGCTATTTTATTCATTTATTATTTAGGCGTACGTTGGCAATTGTTACCATTTGTAGGTAGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCAATCTTCACAATTGTTGTta > 1:373250/1‑151 (MQ=255) aatgtcttaactgcgccagttgatacgcatcttgatctaacgtttgtgtaatcagatgtgctgtcatcaataagatatgacacccttctataacaacaattGTGATTCATGGCAACACTTTGTGCTGCCAATCTTCACAATTGTTGTtata > 2:896068‑M1/102‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |