New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CAAGCGTTGCTTGCTAAAAGAATGGGCAAGAAGAAGCTTGTTGCTGAAACTGGTGCGGGTCAACATGGTGTAGCTAGTGCTACGGTTGCTGCATTATTTGATATGGAACTTGTTGTCTTTATGGGAAGTGAAGATATTAAAAGACAACAACTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAGGTTCTGCATTAGGT > CP000730/1409036‑1409335 | cAAGCGTTGCTTGCTAAAAGAATGGGCAAGAAGAAGCTTGTTGCTGAAACTGGTGCGGGTCAACATGGTGTAGCTAGTGCTACGGTTGCTGCATTATTTGATATGGAACTTGTTGTCTTTATGGGAAGTGAAGATATTAAAAGACaacaac > 1:4066/1‑151 (MQ=255) cAAGCGTTGCTTGCTAAAAGAATGGGCAAGAAGAAGCTTGTTGCTGAAACTGGTGCGGGTCAACATGGTGTAGCTAGTGCTACGGTTGCTGCATTATTTGATATGGAACTTGTTGTCTTTATGGGAAGTGAAGATATTAAAAGACaacaac > 1:4041/1‑151 (MQ=255) aaGCGTTGCTTGCTAAAAGAATGGGCAAGAAGAAGCTTGTTGCTGAAACTGGTGCGGGTCAACATGGTGTAGCTAGTGCTACGGTTGCTGCATTATTTGATATGGAACTTGTTGTCTTTATGGGAAGTGAAGATATTAAAAGACAACAACt < 1:297/151‑1 (MQ=255) 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aGATATTAAAAGACAACAACTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACAttattta < 2:278271/151‑1 (MQ=255) gATATTAAAAGACAACAACTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTg > 2:680006/1‑119 (MQ=255) gATATTAAAAGACAACAACTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTg < 1:680006/119‑1 (MQ=255) tatTAAAAGACAACAACTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATttatta > 1:403133/1‑151 (MQ=255) tatTAAAAGACAACAACTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATttatta < 2:784368/151‑1 (MQ=255) atTAAAAGACAACAACTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAg < 1:983142/151‑1 (MQ=255) gacaacaaCTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAGGTTATGc > 2:1045521‑M2/9‑151 (MQ=255) caacaaCTTAATGTATTTATAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAGGTTCTGCAt > 1:932224‑M2/7‑151 (MQ=255) caacaaCTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAGGTTCTGCAt > 1:396621‑M2/7‑151 (MQ=255) acaaCTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAGGTTCTGCATTa > 1:450725‑M2/5‑151 (MQ=255) aaCTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAGGTTCTGCATTAgg < 2:706104‑M2/149‑1 (MQ=255) aCTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAGGTTCTGCATTAGGt < 1:792708‑M2/150‑1 (MQ=255) | CAAGCGTTGCTTGCTAAAAGAATGGGCAAGAAGAAGCTTGTTGCTGAAACTGGTGCGGGTCAACATGGTGTAGCTAGTGCTACGGTTGCTGCATTATTTGATATGGAACTTGTTGTCTTTATGGGAAGTGAAGATATTAAAAGACAACAACTTAATGTATTTAGAATGGAATTACTTGGTGCAAAGGTTGTGGCAGTTGAAGATGGTCAAGGGACTTTATCGGATGCAGTTAATAAAGCATTGCAATATTGGGTAAGTCATGTAGATGATACACATTATTTATTAGGTTCTGCATTAGGT > CP000730/1409036‑1409335 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |