New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 2464733 | 70 (1.190) | 3 (0.060) | 3/258 | 6.9 | 4.5% | intergenic (+29/+19) | gltS/fni | ESS family glutamate:sodium (Na+) symporter/isopentenyl‑diphosphate delta‑isomerase |
? | CP000730 | = 2464737 | 66 (1.280) | intergenic (+33/+15) | gltS/fni | ESS family glutamate:sodium (Na+) symporter/isopentenyl‑diphosphate delta‑isomerase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACTAAAAAATATGGAAACTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCAT > CP000730/2464588‑2464877 | aCTAAAAAATATGGAAACTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCt > 1:373785/1‑148 (MQ=255) cTAAAAAATATGGAAACTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGCTTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCtt > 2:230081/1‑148 (MQ=255) cTAAAAAATATGGAAACTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCtt > 2:125742/1‑148 (MQ=255) aaaaTATGGAAACTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGcc > 2:458674/1‑148 (MQ=255) acatGGCAACTCCCCTAAAGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGcctcc < 1:76875/146‑1 (MQ=255) tatGGAAACTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTGCCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGcctcct > 1:404972/1‑148 (MQ=255) gAAATTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTACTGATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCttt < 2:294450/148‑1 (MQ=255) aaaCTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCGAAGGCCTCCTCtttt < 1:353469/148‑1 (MQ=255) cTAACGCATATTTAGTAGGACCTATTGTGGGTGCATTCTTAATCGATTTCATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGATGAGGCCCTCGCCTCCTCTTTTATTTATcc < 2:431831/148‑1 (MQ=255) aaGCCTATTTAGTTGGACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCCTACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCg < 2:150037/148‑1 (MQ=255) aaGCAGATTTAGTTGTACCTATTGTTGGGGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACCCCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCg < 1:433175/148‑1 (MQ=255) aGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTCTCCTAGa > 1:263092/1‑148 (MQ=255) aGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCg < 1:12834/147‑1 (MQ=255) aGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCg > 2:12834/1‑147 (MQ=255) cATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTGATTATGGGATTAATACAATGGTTTAGTTAAACACTAAACTCATAAGTATAAGAGGGGGCCTTCGCATCCTCTTTTGTTTATCGTCGTTg > 2:211370/1‑148 (MQ=255) cATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATg < 2:142781/148‑1 (MQ=255) cATATTTAGTTGTACCGTTTGTTGGTGCATTCTTACTCGATTACATAGGAACGGCGACGGTTATGGGTTTCTTACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATg < 1:273221/148‑1 (MQ=255) tatTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGta < 1:185312/148‑1 (MQ=255) aCCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTa < 2:290622/148‑1 (MQ=255) aCCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTa < 2:290597/148‑1 (MQ=255) cccaTTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTAc < 1:233386/145‑1 (MQ=255) cTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACg > 2:440684/1‑148 (MQ=255) tATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACgt < 1:75250/148‑1 (MQ=255) tgttgGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCCCGATGTATATTCAAGTTACgttgt < 1:314171/148‑1 (MQ=255) tgttgGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATAAATACATTCGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACgttgt < 1:429394/148‑1 (MQ=255) tgttgGTGCATTCTTAATCGATTGAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACgttgt < 1:343872/148‑1 (MQ=255) gtttGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACgttgtt < 2:140593/148‑1 (MQ=255) ttgGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTc > 1:593714/1‑148 (MQ=255) ttgGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGATGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTc < 2:451494/148‑1 (MQ=255) tgGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCt < 1:125742/148‑1 (MQ=255) tgGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCt > 1:92100/1‑148 (MQ=255) tGCATTCTTAATCGATTTGATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATc > 1:461599/1‑148 (MQ=255) gCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATg < 1:273707/122‑1 (MQ=255) gCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATg > 2:273707/1‑122 (MQ=255) gCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATcc > 2:579672/1‑148 (MQ=255) aTTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGCCGACAAGTCCACCGCCTCTTTTATTTATCCTCGATGAATATTCAAGTTACGTTATTCTATCCAt > 1:299023/1‑148 (MQ=255) aTTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGAc < 1:359430/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCACGACAATATTTCCGGAc > 2:420986/1‑148 (MQ=255) aTTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATACTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGAc > 1:524211/1‑148 (MQ=255) gtTATAGTCATTTTGGTATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATa < 1:136677/148‑1 (MQ=255) tataGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACg < 1:392814/148‑1 (MQ=255) aGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGAtt > 1:80775/1‑148 (MQ=255) tCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTAACCATGACACTTCTCCCGGACTAAATACGATTTg > 1:113046/1‑148 (MQ=255) gggATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTtgt > 1:5507/1‑148 (MQ=255) aTACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGTGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAgt > 2:160343/1‑148 (MQ=255) cAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGACGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAgtcgt < 2:318096/148‑1 (MQ=255) aTGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCa > 2:547879/1‑148 (MQ=255) aTGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTGGTTTTTGTGTTAAGTCGTCa > 2:547858/1‑148 (MQ=255) ttAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATCCGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGGCAATAtt > 2:325097/1‑148 (MQ=255) tAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATAttt < 1:604605/148‑1 (MQ=255) aGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATAtttt < 2:466147/148‑1 (MQ=255) ttAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATGTTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATCCGATTTGTTTTTGTGTTAAGTGGTCAATGTTTTTa > 2:60642/1‑148 (MQ=255) ttAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTa > 2:283694/1‑148 (MQ=255) tAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAg > 2:602504/1‑148 (MQ=255) acacCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCAt > 2:224145/1‑148 (MQ=255) acacCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCAt > 1:509650/1‑148 (MQ=255) caaataaaAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCa < 2:584226/147‑1 (MQ=255) ataaaAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAGGTTACGTTGTGCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCatta > 1:27783/1‑148 (MQ=255) ataaaAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCatta > 1:514110/1‑148 (MQ=255) taaaAGAGGAGGCGAAGGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATAGTCattat > 2:424754/1‑148 (MQ=39) taaaAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCattat > 2:358383/1‑148 (MQ=255) taaaAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCattat > 2:345206/1‑148 (MQ=255) taaaAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCattat > 2:583525/1‑148 (MQ=255) aaaGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTGGTGTTAGGTCGTCAATATTTTTAGCATATAACATCGTCATTATTg > 2:479747/1‑148 (MQ=255) aagagggctccTTCGCCTTCTTTTTTATTTACCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTGAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGa < 2:237831/139‑1 (MQ=255) aaGAGGAGGGTTTTGCCTCCTCTTATATTTATCCCCGATGTGTATTCGAGTGACGTAGTTCTCTCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGTTTTGTTTGTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTCAAAACTAACATCGTCATTATTGa > 2:186686/1‑148 (MQ=255) aaGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGa > 1:564723/1‑148 (MQ=255) agagGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCCTCATTATTGAt > 1:239896/1‑148 (MQ=255) agagGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGGTCGATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGAt > 1:121342/1‑148 (MQ=255) aggaggCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTCTTCTATCCATGCCACTATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGAttt > 2:193584/1‑148 (MQ=255) aggCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCAt > 1:226182/1‑148 (MQ=255) | ACTAAAAAATATGGAAACTCACCTAAAGCATATTTAGTTGTACCTATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCAT > CP000730/2464588‑2464877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |