| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 2,709,677 | Δ12 bp | 94.7% | coding (1239‑1250/1812 nt) | oatA ← | possible acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2709676 | 4 (0.050) | 81 (1.090) | 61/260 | NT | 94.7% | coding (1251/1812 nt) | oatA | possible acetyltransferase |
| ? | CP000730 | 2709689 = | 5 (0.070) | coding (1238/1812 nt) | oatA | possible acetyltransferase | |||||
AGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/2709538‑2709676‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCAAAAG > CP000730/2709689‑2709827 AGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATT > 1:642801/1‑141 AAGACATTACCAATCTCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTGGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGAC‑TTTTTCTTCGTTGTTTTTTTCTCT‑T > 2:592673/1‑141 AGATATTACCTATATCCACCATGTCCGAGTCACCAATGAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTGAACGCCTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCCCT‑T < 2:18292/141‑1 AGACCTTACCAATATCCACCATGCCCGAGTCACCTATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑T < 2:29561/141‑1 AGACATTATCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTACTAGTGGTGATGACTTTTTAATTTCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑T < 2:574324/141‑1 GACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TT > 2:202783/1‑141 GACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TT < 1:72472/141‑1 CATTACCAATATCCCCCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCT < 1:533383/141‑1 ATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTTTTTTATTCTCT‑TTCTT > 1:99306/1‑141 ATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTT > 2:862375/1‑141 ATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTCTTTTATTCTCT‑TTCTT > 2:499356/1‑141 CAATATCCACCCTGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTACTATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTACCGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGG < 1:282892/141‑1 CAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGG < 1:543985/141‑1 AATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCGTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGC > 1:561554/1‑141 AATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGC > 1:90318/1‑141 AATATCCACCATGACCGAGTCACAACTTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTTCTATTCCCTGTCTGCTTATCATCTTGCTTATCTTTTTTGACGACTTTTTTCTTTCTTGGTTTATTCTCT‑TTTTTtttgct > 1:165545/1‑135 ATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTC < 1:720998/141‑1 TCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCt > 1:96584/1‑140 cctCCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCAT < 2:287350/138‑1 ACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGAGGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGT > 1:858581/1‑141 CCATGACTGAGTCACCAATTTCTGGTTGTGATGACTTTTTAATCTCCTCTTTGCTATTCACTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTT < 2:517153/141‑1 CCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTT > 1:789169/1‑141 ATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGT < 1:305965/141‑1 ATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGT < 2:379905/141‑1 CGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGTCTTTTTTCTTCTTTGTTTTATTATCT‑TTATTCTCGGCATCATGTCGTTTGaa > 2:590753/1‑139 GAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCA > 1:173439/1‑141 ACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGC > 2:664403/1‑141 CCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCc > 1:122858/1‑140 CCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCA > 1:179592/1‑141 CCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCACTGTCTGATTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTATCGGCTTCATATTGTTTGCCAAGTGCA > 2:713245/1‑141 TTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAA > 1:498662/1‑141 AATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATACTATGGCTTATATTTTGTATTGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TGCTTCTCGGCTTCATGTTTTTTGCCAAGTGCATCAAAC > 1:855127/1‑141 ATAGTGGTTATGACTTTTTATTATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACT < 2:488144/141‑1 ATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACT < 1:37650/141‑1 AGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGT < 1:251818/141‑1 GTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTTTTCTCGGCTTCATGTTGTTTTCCAAGTGCGTCttcctgtc > 2:491902/1‑133 GGTGATGCCTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCCTTGTTTCTTTCTCT‑CTCAAATCTCGTTCATGTTGATTGCCAAGTGCATTTAACTGTCCA < 1:633899/141‑1 TGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACT > 1:538374/1‑141 TGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAG > 1:857319/1‑141 TGACTTTTTAAGATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAG < 1:4254/141‑1 TGACTTTGTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCACACTGTCCACTTAG > 1:542753/1‑141 GACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTATTCAAGCTACGTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGC < 1:630017/141‑1 tCTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCA < 2:745355/140‑1 ACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTGTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCA < 2:640268/141‑1 CTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTACACTGAGCAC > 2:465876/1‑141 TTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAA < 2:687768/141‑1 TTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACG > 2:784551/1‑141 TAATTTCCTCCTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGA < 1:276163/141‑1 TAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGA < 1:614249/141‑1 TAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGA < 1:494934/141‑1 ATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATA < 2:702261/141‑1 TATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAG < 2:173439/141‑1 tTCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGA < 2:552713/140‑1 TCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGAC < 2:642801/141‑1 TCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGAC > 1:445027/1‑141 cttTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGCCTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGG < 2:247139/138‑1 CTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAAT > 1:678980/1‑141 tTTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAA < 1:653590/140‑1 ATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAA > 1:683138/1‑141 TTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCCTCAAACTGTCCACTGCGCACAACGATAGACGGAACCAATAAT > 1:31414/1‑141 TCGCTGTTTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATA < 1:420086/141‑1 CGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTT‑TACGATGGTCTGCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAG < 1:199496/141‑1 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TCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAAT > 1:747849/1‑141 TTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATCGCC < 1:119849/141‑1 TTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCCTCATGGTGGTTGCAAAGTAAATCAGCCTTTGCACTGAGATCATCGATATACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCC < 1:202783/141‑1 TAACGACTTTTTACTTCCTTGTTTTATTCCCT‑TTCTTCTCGGCTACCAGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCT < 2:216933/141‑1 AACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTATTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTCGCAAATTGCCCCTT > 1:512026/1‑141 TTTTCTCTTCGTTGTTTTATTCTCG‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGTCGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTT < 1:334345/141‑1 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CP000730/2709538‑2709676‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCTCT‑TTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCAAAAG > CP000730/2709689‑2709827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |