| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 2,709,677 | Δ12 bp | 94.7% | coding (1239‑1250/1812 nt) | oatA ← | possible acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2709676 | 4 (0.050) | 81 (1.090) | 61/260 | NT | 94.7% | coding (1251/1812 nt) | oatA | possible acetyltransferase |
| ? | CP000730 | 2709689 = | 5 (0.070) | coding (1238/1812 nt) | oatA | possible acetyltransferase | |||||
AGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTA > CP000730/2709538‑2709815 | aGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAtt > 1:642801‑M1/1‑139 (MQ=255) aaGACATTACCAATCTCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTGGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGAC‑TTTTTCTTCGTTGTTTTTttctctt > 2:592673‑M1/1‑134 (MQ=255) aGATATTACCTATATCCACCATGTCCGAGTCACCAATGAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTGAACGCCTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttccctt < 2:18292‑M1/141‑8 (MQ=255) aGACCTTACCAATATCCACCATGCCCGAGTCACCTATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctt < 2:29561‑M1/141‑8 (MQ=255) aGACATTATCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTACTAGTGGTGATGACTTTTTAATTTCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctt < 2:574324‑M1/141‑8 (MQ=255) gACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctcttt > 2:202783‑M1/1‑133 (MQ=255) gACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctcttt < 1:72472‑M1/141‑9 (MQ=255) cATTACCAATATCCCCCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttct < 1:533383‑M1/141‑11 (MQ=255) aTTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTTTTTTAttctctttctt > 1:99306‑M1/1‑130 (MQ=255) aTTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttctt > 2:862375‑M1/1‑130 (MQ=255) aTTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTCTTTTAttctctttctt > 2:499356‑M1/1‑130 (MQ=255) cAATATCCACCCTGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTACTATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTACCGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcgg < 1:282892‑M1/141‑17 (MQ=255) cAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcgg < 1:543985‑M1/141‑17 (MQ=255) aaTATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCGTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggc > 1:561554‑M1/1‑124 (MQ=255) aaTATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggc > 1:90318‑M1/1‑124 (MQ=255) aaTATCCACCATGACCGAGTCACAACTTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTTCTATTCCCTGTCTGCTTATCATCTTGCTTATCTTTTTTGACGACTTTTTTCTTTCTTGGTTTAttctctttttttttgct > 1:165545‑M1/1‑124 (MQ=255) atCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttc < 1:720998‑M1/141‑21 (MQ=255) tCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttct > 1:96584‑M1/1‑120 (MQ=255) cctccatgaCCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcat < 2:287350‑M1/138‑23 (MQ=255) accaTGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGAGGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgt > 1:858581‑M1/1‑117 (MQ=255) ccaTGACTGAGTCACCAATTTCTGGTTGTGATGACTTTTTAATCTCCTCTTTGCTATTCACTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgtt < 2:517153‑M1/141‑26 (MQ=255) ccaTGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgtt > 1:789169‑M1/1‑116 (MQ=255) aTGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgt < 1:305965‑M1/141‑28 (MQ=255) aTGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgt < 2:379905‑M1/141‑28 (MQ=255) cGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGTCTTTTTTCTTCTTTGTTTTAttatctttattctcggcatcatgtcgtttgaa > 2:590753‑M1/1‑109 (MQ=255) gAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgcca > 1:173439‑M1/1‑108 (MQ=255) aCCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgc > 2:664403‑M1/1‑103 (MQ=255) ccAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcc > 1:122858‑M1/1‑102 (MQ=255) ccAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgca > 1:179592‑M1/1‑102 (MQ=255) ccAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCACTGTCTGATTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttatcggcttcatattgtttgccaagtgca > 2:713245‑M1/1‑102 (MQ=255) ttAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaa > 1:498662‑M1/1‑98 (MQ=255) aaTAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATACTATGGCTTATATTTTGTATTGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctcttgcttctcggcttcatgttttttgccaagtgcatcaaac > 1:855127‑M1/1‑96 (MQ=255) aTAGTGGTTATGACTTTTTATTATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaact < 2:488144‑M1/141‑47 (MQ=255) aTAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaact < 1:37650‑M1/141‑47 (MQ=255) aGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgt < 1:251818‑M1/141‑49 (MQ=255) gtggtgATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctcttttttctcggcttcatgttgttttccaagtgcgtcttcctgtc > 2:491902‑M1/1‑92 (MQ=255) ggtgATGCCTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCCTTGTTTCTttctctctcaaatctcgttcatgttgattgccaagtgcatttaactgtcca < 1:633899‑M1/141‑52 (MQ=255) tgatgaCTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccact > 1:538374‑M1/1‑88 (MQ=255) tgaCTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgag > 1:857319‑M1/1‑85 (MQ=255) tgaCTTTTTAAGATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgag < 1:4254‑M1/141‑57 (MQ=255) tgaCTTTGTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcacactgtccacttag > 1:542753‑M1/1‑85 (MQ=255) gaCTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTATTCAAGCTACGTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagc < 1:630017‑M1/141‑58 (MQ=255) tctTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagca < 2:745355‑M1/140‑59 (MQ=255) aCTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTGTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagca < 2:640268‑M1/141‑59 (MQ=255) cTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtacactgagcac > 2:465876‑M1/1‑82 (MQ=255) ttttAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaa < 2:687768‑M1/141‑62 (MQ=255) ttAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacg > 2:784551‑M1/1‑78 (MQ=255) tAATTTCCTCCTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacga < 1:276163‑M1/141‑65 (MQ=255) tAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacga < 1:494934‑M1/141‑65 (MQ=255) tAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacga < 1:614249‑M1/141‑65 (MQ=255) tAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCAc < 1:582725/141‑1 (MQ=255) atatCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgata < 2:702261‑M1/141‑67 (MQ=255) tatCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatag < 2:173439‑M1/141‑68 (MQ=255) ttcCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgataga < 2:552713‑M1/140‑69 (MQ=255) tCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagac > 1:445027‑M1/1‑72 (MQ=255) tCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagac < 2:642801‑M1/141‑70 (MQ=255) ctttttgctATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGCCTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacgg < 2:247139‑M1/138‑72 (MQ=255) cTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaat > 1:678980‑M1/1‑63 (MQ=255) tttcGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataa < 1:653590‑M1/140‑81 (MQ=255) aTTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataa > 1:683138‑M1/1‑61 (MQ=255) aTTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCAATGTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCTCTTTCTTCTCCGCTTCCTCTTATTTGACAAGTACATCCAACTGTCCACTGATCACAACGATAgtaggccacaataa > 2:451656/1‑128 (MQ=255) ttCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcctcaaactgtccactgcgcacaacgatagacggaaccaataat > 1:31414‑M1/1‑60 (MQ=255) tCGCTGTTTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataata < 1:420086‑M1/141‑83 (MQ=255) cGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTacgatggtctgctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataatag < 1:199496‑M1/141‑84 (MQ=255) cGCTGTCTGCTTACCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACgg < 2:10774/141‑1 (MQ=255) gCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccactaatagg > 2:330925‑M1/1‑57 (MQ=255) gTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggata < 1:81247‑M1/141‑88 (MQ=255) gTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTGTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggata > 1:553441‑M1/1‑54 (MQ=255) tCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGATGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataa > 1:166403‑M1/1‑53 (MQ=255) tGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCaat > 1:552632/1‑141 (MQ=255) cTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaa > 1:769981‑M1/1‑49 (MQ=255) ttATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcttcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaac < 2:431503‑M1/141‑94 (MQ=255) ttATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaac < 2:526827‑M1/141‑94 (MQ=255) ctTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttc < 2:722583‑M1/141‑101 (MQ=255) aTCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactacaactgttctagcaaa > 2:2545‑M1/1‑34 (MQ=255) aTCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaa > 1:674457‑M1/1‑34 (MQ=255) tCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaat > 1:747849‑M1/1‑33 (MQ=255) tCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaat > 1:315364‑M1/1‑33 (MQ=255) tCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaat > 1:671831‑M1/1‑33 (MQ=255) ttttAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaatcgcc < 1:119849‑M1/141‑113 (MQ=255) ttttAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcctcatggtggttgcaaagtaaatcagcctttgcactgagatcatcgatatacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaattgcc < 1:202783‑M1/141‑113 (MQ=255) tAACGACTTTTTACTTCCTTGTTTTAttccctttcttctcggctaccagttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaattgcccct < 2:216933‑M1/141‑116 (MQ=255) aaCGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctcgcaaattgcccctt > 1:512026‑M1/1‑25 (MQ=255) ttttctCTTCGTTGTTTTAttctcgttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagtcggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaattgccccttcttttt < 1:334345‑M1/141‑123 (MQ=255) tttCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaattgccccttctttttagg > 1:849624‑M1/1‑16 (MQ=255) ttcttcGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaattgccccttctttttaggt < 2:23509‑M1/141‑127 (MQ=255) ttAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaattgccccttctttttaggtaaaaatgcaaaa > 1:861364‑M1/1‑3 (MQ=255) ttAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGt > 2:45777/1‑141 (MQ=255) tAttctctttcttctcggcttcatgttgtttgccaagtgcatcaaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaattgccccttctttttaggtaaaaatgcaaaag < 1:664403‑M1/141‑140 (MQ=255) | AGTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTA > CP000730/2709538‑2709815 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |