| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | CP000730 | 2,709,677 | Δ12 bp | coding (1239‑1250/1812 nt) | oatA ← | possible acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP000730 | 2709689 = | 16 (0.180) | coding (1238/1812 nt) | oatA | possible acetyltransferase | |||||
GTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTA > CP000730/2709539‑2709815 | gTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttc > 2:809022‑M1/1‑138 (MQ=255) aaGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctct < 1:324064‑M1/141‑7 (MQ=255) aGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctt < 1:669505‑M1/141‑8 (MQ=255) ttACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGtcttc < 1:150142/141‑1 (MQ=255) tACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttct < 2:172788‑M1/141‑14 (MQ=255) aCCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctc > 2:651455‑M1/1‑127 (MQ=255) aaTATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggc > 1:384542‑M1/1‑124 (MQ=255) tatCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggctt < 1:730404‑M1/141‑20 (MQ=255) ttcCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttc < 1:41535‑M1/140‑21 (MQ=255) atCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAttctctttcttctcggcttc < 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1:621326‑M1/141‑138 (MQ=255) ttAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGGCCACTGGGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGt > 1:93161/1‑141 (MQ=255) tAtcctctttcttataggcttcatgttgttgtcctagtgcatcgaactgtccactgagcacaacgatagacggaaccaataataggataactaacactgttctagcaaattgccccttctttttaggtaaaaatgcaaaag > 2:774887‑M1/1‑2 (MQ=255) | GTAAAGACATTACCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTA > CP000730/2709539‑2709815 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |