| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 2,709,677 | Δ12 bp | coding (1239‑1250/1812 nt) | oatA ← | possible acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP000730 | 2709689 = | 16 (0.180) | coding (1238/1812 nt) | oatA | possible acetyltransferase | |||||
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CCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCAAAAGCT > CP000730/2709551‑2709829 | gtaaagacattaccaatatccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTtc > 2:809022‑M2/139‑141 (MQ=255) aagacattaccaatatccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTctct < 1:324064‑M2/6‑1 (MQ=255) agacattaccaatatccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCtctt < 1:669505‑M2/7‑1 (MQ=255) taccaatatccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTtcttct < 2:172788‑M2/13‑1 (MQ=255) accaatatccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTtctc > 2:651455‑M2/128‑141 (MQ=255) tGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCgg < 2:420492/141‑1 (MQ=255) tGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCGTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGGCGGCTGCTCTTTCTTCTCgg < 1:188617/141‑1 (MQ=255) aatatccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGc > 1:384542‑M2/125‑141 (MQ=255) tatccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCtt < 1:730404‑M2/19‑1 (MQ=255) ttccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTc < 1:41535‑M2/20‑1 (MQ=255) atccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTc < 1:534133‑M2/20‑1 (MQ=255) atccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTc < 2:825952‑M2/20‑1 (MQ=255) ccaccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCAt < 1:608545‑M2/22‑1 (MQ=255) ccatgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCAtgtt < 2:93487‑M2/25‑1 (MQ=255) catgaccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctatgcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgtcttttttcttcgttgttttaTTTTCTTTCTTCTCTGCTTCAtcttg > 2:92840‑M2/116‑141 (MQ=255) atgaccgagtcatcaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCAtgttgt < 2:285946‑M2/27‑1 (MQ=255) aaTTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGttt < 2:431315/141‑1 (MQ=255) ccgagtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGc > 1:975283‑M2/111‑141 (MQ=255) gtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTTTCGACTTCATTTTGTTTGCcaat > 2:306240‑M2/107‑140 (MQ=255) gtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAg < 1:857496‑M2/35‑1 (MQ=255) gtcaccaattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAg > 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caattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCAt > 1:673918‑M2/102‑141 (MQ=255) aattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgactttttttttctttgttttaTTCTCTTTCTTTTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCatt > 2:191997‑M2/101‑140 (MQ=255) aattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATc > 2:685090‑M2/101‑141 (MQ=255) aattaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgcctgcctctcctcttgctcatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCCCTTTTTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCACGTGCATc > 1:324797‑M2/101‑141 (MQ=255) attaatagtggtgatgactttttaatatcctctttgctattcgctgtctgcttatcctcttgcttatcttttttaacgacttttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCa < 2:762991‑M2/42‑1 (MQ=255) 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2:342149‑M2/24‑141 (MQ=255) ttgttTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCtttt < 2:392827/141‑1 (MQ=255) tttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTa > 1:698350‑M2/19‑141 (MQ=255) ttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAg > 1:218834‑M2/18‑141 (MQ=255) ttttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTATAg < 2:60027‑M2/124‑1 (MQ=255) tttcttcgttgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAgg < 2:246029‑M2/125‑1 (MQ=255) 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2:170462‑M2/134‑1 (MQ=255) tgttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGc > 1:811272‑M2/8‑141 (MQ=255) ttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCACACTGTCCCCTGAGCCCACCGCTAGCCGCAACCCATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCaa < 1:92840‑M2/136‑1 (MQ=255) ttttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCaa < 1:89851‑M2/136‑1 (MQ=255) tttaTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTCTAGGTAAAAATGCaaa < 1:621326‑M2/137‑1 (MQ=255) tcttctCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCAAAAg > 2:838406/1‑141 (MQ=255) taTCCTCTTTCTTATAGGCTTCATGTTGTTGTCCTAGTGCATCGAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCAAAAg > 2:774887‑M2/3‑141 (MQ=255) cttctCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCAAAAGc > 1:264802/1‑141 (MQ=255) ttctCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCCAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGAAAAAGCt > 2:93451/1‑141 (MQ=255) | CCAATATCCACCATGACCGAGTCACCAATTAATAGTGGTGATGACTTTTTAATATCCTCTTTGCTATTCGCTGTCTGCTTATCCTCTTGCTTATCTTTTTTAACGACTTTTTTCTTCGTTGTTTTAAATTCCGTCTTCTTCTCTTTCTTCTCGGCTTCATGTTGTTTGCCAAGTGCATCAAACTGTCCACTGAGCACAACGATAGACGGAACCAATAATAGGATAACTAACACTGTTCTAGCAAATTGCCCCTTCTTTTTAGGTAAAAATGCAAAAGCT > CP000730/2709551‑2709829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |