New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 1283492 | 42 (0.640) | 3 (0.050) | 3/236 | NT | 6.8% | coding (51/4311 nt) | dnaE1 | DNA‑directed DNA polymerase III alpha subunit |
? | CP000730 | = 1283506 | 44 (0.740) | coding (65/4311 nt) | dnaE1 | DNA‑directed DNA polymerase III alpha subunit |
AAAGCATTTAATTTTCTATCATTACTATGCTCACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/1283344‑1283492 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaaatttcaGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGAGCATAGT < CP000730/1283506‑1283367 AAAGCATTTAATTTTCTATCATTACTATGCTCACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTA > 2:337655/1‑141 GCATTTAATTTTCTATCATTACTATGCTCACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAA > 2:159473/1‑141 ATTTAATTTTCTATCATTACTATGCTCACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATT < 2:749673/141‑1 TTAATTTTCTATCATTACTATGCTCACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTC < 1:205473/141‑1 TTAATTTTCTATCATCACTATGCTCACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTC < 1:651447/141‑1 CATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAATTTAAAATTTCAGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAA < 1:40626/141‑1 GCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAGCATCTAATTGATTTGAAATTT > 1:586225/1‑65 GCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAGCATCTAATTGATTTGAAATTT < 2:586225/65‑1 TAAAATTTCAGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGT > 1:583665/1‑141 AAATTTCAGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGA > 1:245290/1‑141 AATTTCAGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGAG < 2:322058/141‑1 ATTTCAGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGAGC > 2:32003/1‑141 TTTCAGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGAGCA < 1:131277/141‑1 TTTCAGCATCGAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGACAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGAGCA < 1:714736/141‑1 TCAGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGAGCATA > 1:320940/1‑141 AGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGAGCATAGT > 2:107001/1‑141 AAAGCATTTAATTTTCTATCATTACTATGCTCACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/1283344‑1283492 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaaatttcaGCATCTAATTGATTTGAAATTTTAATTTGATCAGCAAGCACTTTAAATTTTTGTTGCTCTGTCATTGCCAAGACAATTACCACCTTAAATAGAAATTACTTTTACGTGTTCGAACAATATTTAGATTATGTGAGCATAGT < CP000730/1283506‑1283367 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |