| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 782409 = | 60 (0.920) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 4.9% | intergenic (‑204/+138) | USA300HOU_0730/USA300HOU_0731 | hypothetical membrane protein/hypothetical lipoprotein |
| ? | CP000730 | 782460 = | 59 (0.950) | intergenic (‑255/+87) | USA300HOU_0730/USA300HOU_0731 | hypothetical membrane protein/hypothetical lipoprotein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGA > CP000730/782270‑782546 | gCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAgg > 2:709364/1‑141 (MQ=255)aatctattgtaaaaaagctcacgtcatcttcggcggcgctaaattaaaataatcaatttctgagttaaacttttatgttcaacatactattactatacattacaaatttttaaaatatacattacactcattactcaatgg < 1:374289‑M1/2‑1 (MQ=255) tctattgtaaaaaagctcacgtcatcttcggcggcgctaaattaaaataatcaatttctgagttaaacttttatttaaaacatactattactatacattacaaatttttaaaatatacattacactcattactcaatGGaa > 2:106809‑M1/138‑141 (MQ=255) ctattgtaaaaaagctcacgtcatcttcggcggcgctaaattaaaataatcaatttctgagttaaacttttatttacaacatactattactatacattacaaatttttaaaatatacattacactcattactcaatGGaaa < 1:214502‑M1/5‑1 (MQ=255) ctattgtaaaaaagctcacgtcatcttcggcggcgctaaattaaaataatcaatttctgagttaaacttttatttacaacatactattactatacattacaaatttttaaaatatacattacactcattactcaatGGaaa < 2:159645‑M1/5‑1 (MQ=255) gTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TAt > 1:78819/1‑141 (MQ=255) gTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TAt < 1:285647/141‑1 (MQ=255) tAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATg > 2:158823/1‑141 (MQ=255) tgtTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGAtt > 2:484029/1‑141 (MQ=255) tgtTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGAtt > 1:205679/1‑141 (MQ=255) tgtTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGAtt > 2:374289/1‑141 (MQ=255) ttATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTc > 1:715893/1‑141 (MQ=255) aTGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTa < 1:70361/141‑1 (MQ=255) gtgAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACa < 2:701376/141‑1 (MQ=255) aaCAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGc > 1:549685/1‑141 (MQ=255) gAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAggg > 2:316077/1‑141 (MQ=255) gAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAggg < 1:135478/141‑1 (MQ=255) ttGAGCGCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAATCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATATAGTAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCAAGCGGGGCtat > 2:29852/1‑139 (MQ=255) tGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCtgtg > 2:70500/1‑141 (MQ=255) gAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGa > 2:683792/1‑141 (MQ=255) aattaaaataatcaatttctgagttaaacttttatttacaacatactattactatacattacaaatttttaaaatatacattacactcattactcaatGGAAAGCGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCa > 1:116075‑M1/99‑141 (MQ=255) gggTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATAc > 2:554761/1‑141 (MQ=255) ggTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACg < 1:149407/141‑1 (MQ=255) gTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGc > 2:238014/1‑141 (MQ=255) aaaataatcaatttctgagttaaacttttatttacaacatactattactatacattacaaatttttaaaatatacagtacactcattactcaatGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCt > 2:270634‑M1/95‑141 (MQ=255) gCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCttt > 1:564935/1‑141 (MQ=255) ttAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTcc > 1:339792/1‑141 (MQ=255) tAAGCTAAACAATCCTCAAGCTCTAAAAAAAGTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCa < 2:434532/141‑1 (MQ=255) tAAGCTAAAAAAAACAAAAGAAATAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCa < 2:256773/141‑1 (MQ=255) aGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCAtt > 2:14554/1‑141 (MQ=255) tAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAg < 1:579646/141‑1 (MQ=255) aaacaaacCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGt < 1:556778/141‑1 (MQ=255) acaaacCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTaa > 1:298999/1‑141 (MQ=255) acaaacCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTaa > 1:467469/1‑141 (MQ=255) ctgagttaaacttttatttacaacatactattactatacattacaaatttttaaaatatacattacactcattactcaatGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAAt > 1:607714‑M1/81‑141 (MQ=255) ccTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTTTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAgg > 1:92727/1‑140 (MQ=255) cTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAgtg > 2:441115/1‑141 (MQ=255) cTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAgtg > 1:390371/1‑141 (MQ=255) cTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCAGTGAGTAATGAgtg < 1:384734/141‑1 (MQ=255) tCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAgtgt < 2:512469/141‑1 (MQ=255) cAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGCGTGTa > 2:603858/1‑141 (MQ=255) aaGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TACGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTaa < 2:488936/141‑1 (MQ=255) gCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATg > 2:104765/1‑141 (MQ=255) gCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATg > 2:214502/1‑141 (MQ=255) tAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGtata > 2:217313/1‑141 (MQ=255) aaaaTTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATAtttt < 1:661801/141‑1 (MQ=255) aaaTTTACTTATGTGCTCTGAAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATAAAAAGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTa < 2:726250/141‑1 (MQ=255) aTTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTaaa > 2:516443/1‑141 (MQ=255) aTTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTaaa > 1:678/1‑141 (MQ=255) ttACTTATGTGCTCTGCAATCTTATNGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGNTAGGGGNGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTaaaaa > 1:248529/1‑141 (MQ=255) tACTTATGTGATCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTTTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCGGTGAGATCATACGCTTTCCATTGAGGAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAAt < 1:477627/141‑1 (MQ=255) cAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagta > 1:195980/1‑141 (MQ=255) aaTCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaa < 2:205679/141‑1 (MQ=255) cTTATGGGATTTAAGAGTTGTATATATATGGAAAAAAGGAAAG‑‑TATCATTTGTTGAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACTCTTTCTATTGAGTAATGAGTGTAGTGTATATTTTTAAAATTTGTATTGTatagtaatag < 2:530166/141‑1 (MQ=255) ttATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaatagt < 1:473723/141‑1 (MQ=255) ttATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGCGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTatagtaatagt < 1:749371/141‑1 (MQ=255) gATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTAtgttg < 1:518095/141‑1 (MQ=255) tAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGtaaataa > 2:32500/1‑141 (MQ=255) aGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGGAATGAGTGGAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGGAATTGTATGTTGtaaaataa > 1:243259/1‑137 (MQ=255) gTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATaaaa > 2:279930/1‑141 (MQ=255) tggatagatatTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAGTCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTCATAGTATGTTGTAAATAAAAGt < 2:600679/138‑1 (MQ=255) tGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGt < 1:238014/141‑1 (MQ=255) tGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACCATTTCCAAAGCGCAATGCGTCTACCGTATATTTTACAACATTGTAATATATAGTCACAGTATGTTGTACATAAAAGt > 1:194709/1‑141 (MQ=255) atatatatTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTa > 2:164431/1‑141 (MQ=255) atatatatTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTa > 2:654420/1‑141 (MQ=255) atatatTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAAc < 1:684043/141‑1 (MQ=255) atatatTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAAc > 1:392733/1‑141 (MQ=255) tatTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCa > 1:428889/1‑141 (MQ=255) aaaGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGa < 1:163140/141‑1 (MQ=255) aaaGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGa < 2:603188/141‑1 (MQ=255) | GCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAG‑‑TATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGA > CP000730/782270‑782546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |