New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 1203821 = | 61 (0.940) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 5.3% | intergenic (+44/‑246) | ileS/yfiE | isoleucine‑‑tRNA ligase/possible lactoylglutathione lyase |
? | CP000730 | 1203868 = | 51 (0.850) | intergenic (+91/‑199) | ileS/yfiE | isoleucine‑‑tRNA ligase/possible lactoylglutathione lyase |
GAAAGATGTTGGAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAATTATTCAGGAATGGTACAAA > CP000730/1203682‑1203961 | gAAAGATGTTGGAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATTATATAAATTAAAGct > 2:352593/1‑141 (MQ=255) aaaGATGATGGAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATAACTTATATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGctc > 2:434839/1‑141 (MQ=255) aTGTTGGAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCtt < 2:97360/141‑1 (MQ=255) tGTTGGAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTc < 1:758042/141‑1 (MQ=255) agaatagcaactataacgcatttatatgcctcagagaatttgtaccattcctgaataatttttattttagtaaatcgcacattttttacatatatgaccggtaacttggtcatttttttattcacaaaaaaaCTCTCTTCa > 1:783144‑M1/133‑141 (MQ=255) ttGGAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCAt < 2:188508/141‑1 (MQ=255) ttGGAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCAt > 1:268169/1‑141 (MQ=255) aaatagcaactataacacatttatatgcctcagagaatttgtaccattcctgaataatttttattttagtaaatcgcacattttttacatatatgaccggtaacttggtcatttttatattaaaaaaaaaaCTCTCTTCAt > 2:597461‑M1/132‑141 (MQ=255) ggAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATaa > 1:533793/1‑141 (MQ=255) cTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCAt > 2:33319/1‑141 (MQ=255) tCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCAtgttg < 1:44653/141‑1 (MQ=255) gagGATCTTGGTGCTGTTCATGAATTGACGCATCTATGTACACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCCTACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAg > 2:594660/1‑141 (MQ=255) gATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGttt > 1:514100/1‑141 (MQ=255) aTCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGtttt > 2:762297/1‑141 (MQ=255) aTCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGtttt > 1:285464/1‑141 (MQ=255) cTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTttg < 1:540312/141‑1 (MQ=255) ttatatgcctcagagaatttgtaccattcctgaataatttttattttagtaaatcgcacattttttacatatatgaccggtaacttggtcatttttttattcacaaaaaaaCTCTCTTCAT‑‑‑CATGTTGTAGTTTTTGTTGa > 1:35965‑M1/112‑141 (MQ=255) ttGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTttgt < 2:91693/141‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTttgttg < 2:427172/141‑1 (MQ=255) gTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGa < 2:635246/141‑1 (MQ=255) gCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACa < 2:409792/141‑1 (MQ=255) ttGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACatgat > 1:114962/1‑141 (MQ=255) atagACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCCCTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAagaga < 1:253658/138‑1 (MQ=255) ttGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAagagag < 1:779372/141‑1 (MQ=255) ttGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAagagag < 2:553528/141‑1 (MQ=255) gtaccattcctgaataatttttattttagtaaatcgcacattttttacatatatgaccggtaacttggtcatttttttattcacaaaaaaaCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGttt > 2:290493‑M1/92‑141 (MQ=255) aCGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGttt > 2:54600/1‑141 (MQ=255) cGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGtttt > 2:442237/1‑141 (MQ=255) cGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGtttt > 2:710249/1‑141 (MQ=255) accattcctgaataatttttattttagtaaatcgcacattttttacatatatgaccggtaacttggtcatttttttattcacaaaaaaaCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGttttt > 1:215056‑M1/90‑141 (MQ=255) aTCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGttttttt < 1:600428/141‑1 (MQ=255) tCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTtg < 1:677570/141‑1 (MQ=255) tCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTtg > 1:19557/1‑141 (MQ=255) tCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTtg > 1:19543/1‑141 (MQ=255) gccACGATGACAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATa < 1:412450/140‑1 (MQ=255) cACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATaaa > 1:460678/1‑141 (MQ=255) aCGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATaaaa < 1:147659/141‑1 (MQ=255) cGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATaaaaa < 1:29269/141‑1 (MQ=255) gATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATaaaaaa < 1:771218/141‑1 (MQ=255) caacaaGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGAc > 1:544909/1‑141 (MQ=255) aacaaGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGAcc > 2:727773/1‑141 (MQ=255) acaaGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCa > 1:327983/1‑141 (MQ=255) aGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGt < 1:338457/141‑1 (MQ=255) gTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGtt > 1:174038/1‑141 (MQ=255) ttGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACTGATGATATAGATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTa < 1:370811/141‑1 (MQ=255) tGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTAc < 2:715107/141‑1 (MQ=255) gTAAAATCACTTGTATNATTGAAATTGTANAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTAcc > 1:457230/1‑141 (MQ=255) tAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCg > 2:57567/1‑141 (MQ=255) tAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCg > 2:370499/1‑141 (MQ=255) aaaaTCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGAccggtaacttgg < 2:254936/141‑11 (MQ=255) aaTCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGACCAAGTTACCGGTc > 2:366867/1‑141 (MQ=255) ttGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTTTTTATATTATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCatatat > 2:778638/1‑141 (MQ=255) gTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGt < 1:203759/141‑1 (MQ=255) gTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGt < 1:760672/141‑1 (MQ=255) gTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGt > 1:276464/1‑141 (MQ=255) tataATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTa < 2:230461/141‑1 (MQ=255) ataATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTaa > 2:336376/1‑141 (MQ=255) taATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTaaa > 2:185023/1‑141 (MQ=255) ttGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTaaaaaa < 1:733863/141‑1 (MQ=255) tGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAAt > 1:294864/1‑141 (MQ=255) aaTTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAAtgtg > 2:510198/1‑141 (MQ=255) ttGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATGAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCg < 1:760642/141‑1 (MQ=255) aaaGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTAc > 1:78852/1‑141 (MQ=255) ctaaTACAGAAGATAGAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGAAATGATGAAGAGAGTTTAAATAAAAAAAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACtaaaat < 2:230749/138‑1 (MQ=255) tACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAG‑TTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATaaaaa > 1:313914/1‑141 (MQ=255) aGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAatt < 2:305249/141‑1 (MQ=255) tgatATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAattatt > 1:644071/1‑141 (MQ=255) atatAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATATAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAATTATTCa > 2:276575/1‑141 (MQ=255) tAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAATTATTCAGGAATGGt < 2:174038/141‑1 (MQ=255) aaGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAATTATTCAGGAATGGTAc < 1:647634/141‑1 (MQ=255) aGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAATTATTCAGGAATGGTACa > 1:102989/1‑141 (MQ=255) CTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAATTATTCAGGAATGGTACaaa > 2:457230‑M1/1‑141 (MQ=255) CTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAATTATTCAGGAATGGTACaaa < 1:541894‑M1/141‑1 (MQ=255) | GAAAGATGTTGGAACTATTCAGAGGATCTTGGTGCTGTTGATGAATTGACGCATCTATGTCCACGATGCCAACAAGTTGTAAAATCACTTGTATAATTGAAATTGTATAAAGTACTCATACAGATGATATAAATTAAAGCTCTCTTCATAATCATGTTGTAGTTTTTGTTGACATGATGAAGAGAGTTTTTTTGTGAATAAAAAAATGACCAAGTTACCGGTCATATATGTAAAAAATGTGCGATTTACTAAAATAAAAATTATTCAGGAATGGTACAAA > CP000730/1203682‑1203961 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |