New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 1660030 | 55 (0.840) | 5 (0.080) | 3/236 | NT | 8.6% | coding (1279/1464 nt) | yqgP | S54 family peptidase |
? | CP000730 | = 1660054 | 56 (0.940) | coding (1255/1464 nt) | yqgP | S54 family peptidase |
TATAATCTGTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGCATTATCATAATTACC > CP000730/1659895‑1660168 | tataATCTGTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCt > 2:74117/1‑141 (MQ=255) tataATCTGTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTAAATGCTTTTTCATTATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTACTCGCt > 2:74118/1‑141 (MQ=255) taATCTGTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTACTGCTTTTTCATCATCCTTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTcc < 1:393639/141‑1 (MQ=255) taATCTGTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTcc > 2:93730/1‑141 (MQ=255) aTCTGTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCa > 2:21328/1‑141 (MQ=255) cTGTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCGTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTAGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCAtt > 2:737844/1‑141 (MQ=255) gTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCt > 1:190014/1‑141 (MQ=255) gTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCt > 1:376117/1‑141 (MQ=255) tATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTg > 1:127177/1‑141 (MQ=255) aGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATAcc < 1:609574/141‑1 (MQ=255) gggTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCt > 1:370833/1‑141 (MQ=255) tGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCgga > 2:342890‑M2/1‑138 (MQ=255) cATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggact > 1:93730‑M2/1‑136 (MQ=255) aTTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggactt < 1:360709‑M1/141‑31 (MQ=255) aTTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggactt < 1:355765‑M1/141‑31 (MQ=255) tttAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggactta < 2:359416‑M1/141‑32 (MQ=255) tttAATGCTTTACGCACAGATTTTAATGCTTTTTCATCATCATGTAATGAACTACGTGCGATCTGGAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggactta < 1:781794‑M1/141‑32 (MQ=255) aTGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaat < 1:117325‑M1/141‑36 (MQ=255) aTGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaat > 2:497314‑M2/1‑130 (MQ=255) ttACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGAta > 2:62457/1‑141 (MQ=255) cGCACCTATGTTAATGCCTTTTCATCATCATTGAATGCACGATTTGCTATCGCCAGCTCAAAATTTAATAAACCTGGTTTAGGGCGCATTATAAGTCCTCTCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGAtagta < 2:697498/141‑1 (MQ=255) cGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGAtagta > 1:19838/1‑141 (MQ=255) cGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGAtagta > 1:413582/1‑141 (MQ=255) acaTATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGcc < 2:512072/141‑1 (MQ=255) acaTATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGcc < 1:406790/141‑1 (MQ=255) caTATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCa < 2:363686/141‑1 (MQ=255) tatTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATa < 2:351043/141‑1 (MQ=255) aaTGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATa > 2:34518/1‑141 (MQ=255) aaTGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATa > 2:154619/1‑141 (MQ=255) aaTGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATa > 2:511368/1‑141 (MQ=255) aaTGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATa > 2:477180/1‑141 (MQ=255) tGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATAct > 1:729231/1‑140 (MQ=255) tttAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGtt < 1:60498/141‑1 (MQ=255) gAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAAATGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGatca > 1:631028/1‑141 (MQ=255) gATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACTTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCgg < 1:461254/141‑1 (MQ=255) aTTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGc < 1:306793/141‑1 (MQ=255) tttGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCa < 2:736924/141‑1 (MQ=255) ttGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCAt < 2:212838/141‑1 (MQ=255) gCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCAtca > 1:363432/1‑139 (MQ=255) gCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATaa > 2:698225/1‑141 (MQ=255) gCTATCGCTAACTCAAAATTCAATAAACCTGAGTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAAGAATATGTTTGATCAGCTACATaa > 2:698244/1‑141 (MQ=255) cTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAAt < 1:97335/141‑1 (MQ=255) cTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAAt > 1:470836/1‑141 (MQ=255) cTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTtttat < 1:427577/141‑1 (MQ=255) aCTCAAANTTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTtttattta < 2:588256/141‑1 (MQ=255) cTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTttatttat < 1:213923/141‑1 (MQ=255) cTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGGAGTCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTttatttat < 1:214097/141‑1 (MQ=255) tCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTtatttatt > 2:648512/1‑141 (MQ=255) cAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTg < 2:57061/141‑1 (MQ=255) aaaTTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTc > 1:284701/1‑141 (MQ=255) aaaTTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTc < 1:471980/141‑1 (MQ=255) aataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTc > 2:707799/1‑141 (MQ=255) aataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTc > 1:374508/1‑141 (MQ=255) ataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTca > 1:290763/1‑141 (MQ=255) aaaCCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTcaca > 1:518352/1‑141 (MQ=255) gATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATAttt < 2:574225/141‑1 (MQ=255) tAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAg < 2:167203/141‑1 (MQ=255) tAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAg > 1:585590/1‑141 (MQ=255) aGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGc > 2:594458/1‑141 (MQ=255) gAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGCAt > 1:573733/1‑141 (MQ=255) aCATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGCATTAt < 2:45711/141‑1 (MQ=255) aCATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGCATTAt < 1:93598/141‑1 (MQ=255) aTTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaatcgttcattaaatgatgatgaaaaagcattaaaatatgtgcgtaaagcat > 2:497314‑M1/1‑11 (MQ=255) aTTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaatcgttcattaaatgatgatgaaaaagcattaaaatatgtgcgtaaagcat < 1:117325‑M2/141‑107 (MQ=255) tCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGCATTATCATa > 2:487186/1‑141 (MQ=255) cTAAGTCCTCGCTCCCATTATGTCATACCTCCCGAAATAGAATTGATAGTCGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCCTCGGAATAATTTATATTTATTGTCCGCTTAACAATGTTTTGAGCATTATCCTac < 2:783607/141‑2 (MQ=255) tAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttccagatcgcacgtagttcattacatgatgatgaaaaagcattaaaatctgtgcgtaaagcattaaa < 1:781794‑M2/141‑111 (MQ=255) tAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaatcgttcattaaatgatgatgaaaaagcattaaaatatgtgcgtaaagcattaaa < 2:359416‑M2/141‑111 (MQ=255) aaGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaatcgttcattaaatgatgatgaaaaagcattaaaatatgtgcgtaaagcattaaat < 1:360709‑M2/141‑112 (MQ=255) aaGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaatcgttcattaaatgatgatgaaaaagcattaaaatatgtgcgtaaagcattaaat < 1:355765‑M2/141‑112 (MQ=255) aaGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGCATTATCATAAtt < 1:498430/141‑1 (MQ=255) gggacTCGCTCACATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGCATTATCATAATTa < 2:200531/137‑1 (MQ=255) aGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaatcgttcattaaatgatgatgaaaaagcattaaaatatgtgcgtaaagcattaaatg > 1:93730‑M1/1‑5 (MQ=255) tCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaatcgttcattaaatgatgatgaaaaagcattaaaatatgtgcgtaaagcattaaatgca > 2:342890‑M1/1‑3 (MQ=255) | TATAATCTGTATTTTTAGGGTCTGCATTTAATGCTTTACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCATCGGCATAATTTTTATTTATTGTCTGCTTCACAATATTTTGAGCATTATCATAATTACC > CP000730/1659895‑1660168 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |