New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 961264 | 50 (0.770) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 6.0% | coding (84/525 nt) | spsA | Sec family Type I general secretory pathway S26 family signal peptidase I |
? | CP000730 | = 961290 | 47 (0.760) | coding (110/525 nt) | spsA | Sec family Type I general secretory pathway S26 family signal peptidase I |
CATTTTATGGGATCGAAAAAGGAGTGACATCGTGAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTGCCAAACCTGGTCAAT > CP000730/961150‑961430 | cATTTTATGGGATCGAAAAAGGAGTGACATCGTGAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTc > 1:395001/1‑141 (MQ=255) tATGGGATCGAAAAAGGAGTGACATCGTGAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCaccaa < 1:349447‑M2/141‑6 (MQ=255) aTCGAAAAAGGAGTGACATCGTGAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTa > 2:392892/1‑141 (MQ=255) ggTGACATCGTGAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTGGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGAt < 2:81898/140‑1 (MQ=255) gTGACATCGTGAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATc < 2:735282/141‑1 (MQ=255) tGACATAGTGAAAAAAGTTGTAATATATTTGTTTTTTTCGAGACGTGCTAGTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCg < 1:350580/141‑1 (MQ=255) aaacaaaaagAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCg < 2:414761/132‑1 (MQ=255) aCATCGTGAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCgtg < 2:311765/141‑1 (MQ=255) aCATCGTAAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTTATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATTATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCgtg < 2:28189/141‑1 (MQ=255) gAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGt > 2:289981/1‑141 (MQ=255) aaaGTTGTAGAATATTTGATTTCATTGATACTTGATATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGGCATGTCATTCAGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGtaaat < 2:430059/141‑1 (MQ=255) aaaGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGtaaat > 1:460178/1‑141 (MQ=255) gTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAAtt > 1:262327/1‑141 (MQ=255) tAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTa < 1:186456/141‑1 (MQ=255) tAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTa > 2:102087/1‑141 (MQ=255) aaaaTATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTaa > 1:382492/1‑141 (MQ=255) atatTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGt < 2:23728/141‑1 (MQ=255) atTGGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAAATAAAGTTa > 1:363234/1‑141 (MQ=255) tGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACAt < 2:108884/141‑1 (MQ=255) tGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACAt < 2:108763/141‑1 (MQ=255) tGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTATGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACAt > 2:136014/1‑141 (MQ=255) aTTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACAttt < 1:88022/141‑1 (MQ=255) aTTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACAttt > 2:727921/1‑141 (MQ=255) aTTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACAttt > 1:400242/1‑141 (MQ=255) aTTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACAttt > 2:727515/1‑141 (MQ=255) aTTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACAtta > 2:745831/1‑140 (MQ=255) aTTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCa > 2:174448/1‑141 (MQ=255) tGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAAt > 2:107456/1‑141 (MQ=255) aTACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTg < 2:215241/141‑1 (MQ=255) aTACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTg > 2:154415/1‑141 (MQ=255) gCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGaataat < 1:56906/141‑1 (MQ=255) gCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGCCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGaataat > 2:500770/1‑141 (MQ=255) attatCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGt < 2:436557/141‑1 (MQ=255) tACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTa < 1:784573/141‑1 (MQ=255) cgaacagtccAAACTCTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTCACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTCATATCATTACa > 2:101021/10‑141 (MQ=255) tGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACat > 2:261200/1‑141 (MQ=255) ttCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACatat > 2:585338/1‑141 (MQ=255) tACAAACTTTTGTAATNGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCaccaactattacaaaagtttgtacgaacagtacaatgataatagcaagtatcaatgaaatcaaatattttacaacttttttcacgatgtcac < 1:739292‑M2/141‑93 (MQ=255) ttGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACg < 2:419905/141‑1 (MQ=255) ttGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACg > 2:140278/1‑141 (MQ=255) tGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACga < 1:31176/141‑1 (MQ=255) tAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACgaga < 1:174581/141‑1 (MQ=255) tAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACgaga > 2:440584/1‑141 (MQ=255) tAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGatat < 1:614631/141‑1 (MQ=255) ttGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCaccaactattacaaaagtttgtacgaacagtacaatgataatagcaagtatcaatgaaatcaaatattttacaacttttttcacgatgtcactcctttttcgatcccata < 1:676506‑M2/141‑111 (MQ=255) ttGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGAtatata < 1:300219/141‑1 (MQ=255) tGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCAATACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATAc < 2:706963/141‑1 (MQ=255) atTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAatt > 2:5961/1‑141 (MQ=255) tCCGAATAATGATATG‑ccaactattacaaaagtttgtacgaacagtacaatgataatagcaagtatcaatgaaatcaaatattttacaacttttttcacgatgtcactcctttttcgatcccataaaatgctgttctaac < 2:637579‑M2/141‑125 (MQ=255) cGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTg < 1:387619/141‑1 (MQ=255) cGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTg < 1:693352/141‑1 (MQ=255) tGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTGCCAAAcc > 1:78862/1‑141 (MQ=255) atatGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTGCCAAACCTg < 1:693303/141‑1 (MQ=255) atGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTGCCAAACCTGGt > 1:181856/1‑141 (MQ=255) atGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTGCCAAACCTGGt < 2:40021/141‑1 (MQ=255) gTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTGCCAAACCTGGtca < 2:435824/141‑1 (MQ=255) cACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTGCCAAACCTGGtcaat > 2:592778/1‑141 (MQ=255) | CATTTTATGGGATCGAAAAAGGAGTGACATCGTGAAAAAAGTTGTAAAATATTTGATTTCATTGATACTTGCTATTATCATTGTACTGTTCGTACAAACTTTTGTAATAGTTGGTCATGTCATTCCGAATAATGATATGTCACCAACCCTTAACAAAGGGGATCGTGTTATTGTAAATAAAATTAAAGTTACATTTAATCAATTGAATAATGGTGATATCATTACATATAGGCGTGGTAACGAGATATATACTAGTCGAATTATTGCCAAACCTGGTCAAT > CP000730/961150‑961430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |