New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 1619594 = | 62 (0.950) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.0% | coding (813/816 nt) | proC | pyrroline‑5‑carboxylate reductase |
? | CP000730 | 1619661 = | 55 (0.890) | intergenic (+64/+41) | proC/rnz | pyrroline‑5‑carboxylate reductase/ribonuclease Z |
TAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCTTCATTTTGTATCAATGTTTGATAAATTTCATTTATATCTTCTGTATTA > CP000730/1619521‑1619801 | tAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTtata > 2:413323/1‑141 (MQ=255) aaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAAttt > 1:696127‑M1/70‑141 (MQ=255) aTCTATTTTCGAATATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAAttt < 1:115990/141‑1 (MQ=255) aTCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAAttt < 2:762506/141‑1 (MQ=255) aTCTATTTTCGAAGAAATTCCAGGCGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAAttt < 1:6857/141‑1 (MQ=255) tCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAACAACAAACACGACACCACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTa > 1:392004/1‑141 (MQ=255) tATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTAtt < 1:523109/141‑1 (MQ=255) tATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTAtt > 1:492433/1‑141 (MQ=255) tttCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGtt > 2:758683/1‑141 (MQ=255) tCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTAt > 1:128975/1‑141 (MQ=255) gAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTAttt > 2:691344/1‑141 (MQ=255) gATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGc > 2:574363/1‑141 (MQ=255) tGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAg > 1:430218/1‑141 (MQ=255) gTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGc > 1:476864/1‑141 (MQ=255) tCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCa > 2:533487/1‑141 (MQ=255) 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2:334239/1‑141 (MQ=255) gTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACtt > 2:173351/1‑141 (MQ=255) cGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTg < 1:454120/141‑1 (MQ=255) gtagtaTTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCAtt < 2:373389/141‑1 (MQ=255) tagtaTTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACAAGTAAGCCTCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTCTAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCAttt > 2:209021/1‑140 (MQ=255) gtaTTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAGACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGCTA‑TTTTTATAATTTTTTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGa > 2:179681/1‑141 (MQ=255) ttGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAttt < 1:45899/141‑1 (MQ=255) ttGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAttt < 1:321321/141‑1 (MQ=255) tGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAtttt < 1:502568/141‑1 (MQ=255) aCTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTaaa < 1:237401/141‑1 (MQ=255) cTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTAt < 1:267150/141‑1 (MQ=255) tAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTAt > 1:423112/1‑141 (MQ=255) tAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATc < 2:762017/141‑1 (MQ=255) tataGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaaa < 2:140695/141‑1 (MQ=255) ataGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaaaa > 2:278962/1‑141 (MQ=255) taGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTCACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAATACTATCaaact > 2:130366/1‑139 (MQ=255) aagtaacacAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAAt < 2:167336/133‑1 (MQ=255) 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1:524733‑M1/141‑1 (MQ=255) AAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAAt > 2:5682‑M1/1‑141 (MQ=255) AAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAAt > 1:220718‑M1/1‑141 (MQ=255) AAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTa < 1:141427‑M1/141‑1 (MQ=255) AAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTa < 1:735960‑M1/141‑1 (MQ=255) AAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTa < 1:82051‑M1/141‑1 (MQ=255) caaacCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaattaaaa > 1:31504/1‑141 (MQ=255) caaacCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaattaaaa > 1:366265/1‑141 (MQ=255) ataacccgtcaaacacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggtttgtttttatAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaaaattaaa > 1:557281‑M2/62‑141 (MQ=255) cccGCCAACACATGTATGCATCATCACATACA‑T‑AGTTGGACGGGTTA‑TTTTTATAAATTATTACTATTTGGCAAGCATTGTTTATAACTTTGTCATTAGACTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGgt > 1:730123/1‑141 (MQ=255) ccGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAgg < 2:477156/141‑1 (MQ=255) aaCACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTAt > 1:515372/1‑141 (MQ=255) acacATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATc < 2:260226/141‑1 (MQ=255) cacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttggcgggtttgtttttatAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCt < 2:557281‑M2/93‑1 (MQ=255) acaTGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCtt > 2:444811/1‑141 (MQ=255) caTGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCTTc > 2:573981/1‑141 (MQ=255) gTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCTTCAtt < 1:179317/141‑1 (MQ=255) 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1:103381/1‑141 (MQ=255) gtgtTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCTTCATTTTGTATCAATGTTTGATAAAt < 1:413323/141‑1 (MQ=255) tgtTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCTTCATTTTGTATCAATGTTTGATAAAtt < 1:345933/141‑1 (MQ=255) tttGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCTTCATTTTGTATCAATGTTTGATAAATTTc < 1:167391/141‑1 (MQ=255) tGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTATGTGTATCTTCATTTTGTATCAATGTTTGATAAATTTCAt < 1:180912/141‑1 (MQ=255) aCGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCTTCATTTTGTATCAATGTTTGATAAATTTCAttt < 1:475903/141‑1 (MQ=255) 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2:479878/141‑1 (MQ=255) | TAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTA‑TTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAAATTAAAATTAGGTGTATCTTCATTTTGTATCAATGTTTGATAAATTTCATTTATATCTTCTGTATTA > CP000730/1619521‑1619801 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |