| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2333009 = | 70 (1.070) | 3 (0.050) | 3/234 | NT | 5.1% | intergenic (‑119/+249) | lacA/lacR | galactose‑6‑phosphate isomerase LacA subunit/lactose phosphotransferase system repressor |
| ? | CP000730 | 2333060 = | 48 (0.810) | intergenic (‑170/+198) | lacA/lacR | galactose‑6‑phosphate isomerase LacA subunit/lactose phosphotransferase system repressor | |||||
ATACCTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGCCCATAAATGAATGCAAATT > CP000730/2332921‑2333200 | aTACCTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTAGTTTATGAc > 2:47805/1‑141 (MQ=255) tACCTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACg < 1:326322/141‑1 (MQ=255) aCCTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGt > 1:480374/1‑141 (MQ=255) aCCTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGt < 2:498452/141‑1 (MQ=255) aCCTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGt < 2:448238/141‑1 (MQ=255) aCCTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGt > 1:480308/1‑141 (MQ=255) ccTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTa > 1:291870/1‑141 (MQ=255) cTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTc < 2:555910/141‑1 (MQ=255) aaaaTGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCaaa > 1:563297/1‑141 (MQ=255) aaaTGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAAc < 2:479357/141‑1 (MQ=255) gtgACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATa < 1:415288/141‑1 (MQ=255) aCATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAGTCGACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGt > 1:248633/1‑141 (MQ=255) cATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTg > 1:731535/1‑141 (MQ=255) tttttctttgtgaTGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATCTGTTTGTTTATGACATATTTTCAAACAATAAGTG‑AACAtt < 2:385628/129‑1 (MQ=255) tatttGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACAtt < 1:325700/141‑1 (MQ=255) tatttGTAGCTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATCTGTTTGTTTATGACATATTTTCAAACAATAAGTG‑AACAtt < 1:220088/141‑1 (MQ=255) tGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTCATTTCAAACATTAAGTG‑AACATTCata > 2:623032/1‑141 (MQ=255) tGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCata > 1:211376/1‑141 (MQ=255) ggTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATtgt < 1:433271/141‑1 (MQ=255) aTGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACTTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTgtggtg < 2:766550/141‑1 (MQ=255) tGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGgtgt < 2:317514/141‑1 (MQ=255) gAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGtgtt < 1:467815/141‑1 (MQ=255) gAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGtgtt < 1:574724/141‑1 (MQ=255) aaaaTCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGtgttg > 1:86530/1‑141 (MQ=255) aaaTCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGtgttgt < 2:643717/141‑1 (MQ=255) ttGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTaa < 1:21413/141‑1 (MQ=255) agaAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTa > 1:189850/1‑141 (MQ=255) agaAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTa > 2:4470/1‑141 (MQ=255) gaAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAg < 1:494166/141‑1 (MQ=255) gaAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAg < 2:532544/141‑1 (MQ=255) aaaaaGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACACTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAg > 1:745349/2‑141 (MQ=255) aGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGTTAt > 2:235089/1‑141 (MQ=255) ttCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTc > 1:444728/1‑141 (MQ=255) ttCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTc > 1:444816/1‑141 (MQ=255) tCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATACATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCt < 2:748913/141‑1 (MQ=255) cAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTg < 1:15485/141‑1 (MQ=255) cAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTg < 2:69680/141‑1 (MQ=255) gATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTg > 2:96357/1‑141 (MQ=255) aTTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTgt > 1:348200/1‑141 (MQ=255) aTTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTgt > 1:461840/1‑141 (MQ=255) gTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTaa < 2:226687/141‑1 (MQ=255) tAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAAc < 1:666799/141‑1 (MQ=255) ataaacataaacAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTc > 1:223923/1‑141 (MQ=255) 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1:658492‑M2/49‑141 (MQ=255) aacaaacatattataaacatattatgttgatttattgtttgtttatgACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCGTATTGGGGTGTTGTTTTAGTTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTccc > 1:664090‑M2/48‑141 (MQ=255) AACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTccc < 1:698088‑M1/141‑1 (MQ=255) CAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGt < 1:169397‑M1/141‑1 (MQ=255) CAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGt < 2:572298‑M1/141‑1 (MQ=255) aacatattataaacatattatgttgatttattgtttgtttatgACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTg > 2:517928‑M2/44‑141 (MQ=255) tAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATa > 2:122936/1‑141 (MQ=255) aaaTCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATaa > 2:423794/1‑141 (MQ=255) aaaTCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATaa > 2:47029/1‑141 (MQ=255) aaCATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTg < 1:5077/141‑1 (MQ=255) aCATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGc > 2:411566/1‑141 (MQ=255) ataatatgtttataatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCAt > 2:78498/1‑141 (MQ=255) taatatgtttataatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTCAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATa < 1:416188/141‑1 (MQ=255) taatatgtttataatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATa < 1:720479/141‑1 (MQ=255) tatgtttataatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGATGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATaaaa > 1:768001/1‑141 (MQ=255) ataatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGcc > 2:315421/1‑141 (MQ=255) ataatatatttGTATATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTTATATTGTGGTGTTGTTTTAATTATGTATTCGTATGAAATTGTAGTAAAACTTTGTGGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAATAAGAGcc < 2:494545/141‑1 (MQ=255) taatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGccc < 2:684102/141‑1 (MQ=255) taatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGccc < 1:775991/141‑1 (MQ=255) taatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGccc < 2:156287/141‑1 (MQ=255) taatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGccc < 2:515087/141‑1 (MQ=255) aatatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGCCCa < 1:552952/141‑1 (MQ=255) atatgtttGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGCCCAt > 2:351010/1‑141 (MQ=255) 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> 1:712517/1‑141 (MQ=255) aCGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTAGAGGCCACCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGCCCATAAATGAATGCAAatt > 1:508841/1‑141 (MQ=255) | ATACCTTTCTTAAAATGTGACATATTTATTTGTAGGTTATGAAAATCTTGAGAAAAGGCTTTCAATTTGATTACGTTTAAATTATAAACATAAACAAACAATAAATCAACATAATATGTTTATAATATGTTTGTTTATGACGTATTTTCAAACAATAAGTG‑AACATTCATATTGTGGTGTTGTTTTAATTAGGTATTCGTCTGAAATTGTAGTAAAACTTTGTCGAGGTTCCCGTTGACATAAATTTGCATAAAAAATAGCCCATAAATGAATGCAAATT > CP000730/2332921‑2333200 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |