New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 2460721 = | 74 (1.130) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 4.0% | coding (554/900 nt) | natA | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
? | CP000730 | 2460749 = | 71 (1.120) | coding (526/900 nt) | natA | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTGATAGACTAT > CP000730/2460611‑2460889 | cATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGt > 2:459935/1‑141 (MQ=255) cATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGt > 1:715150/1‑141 (MQ=255) cATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGt > 1:715088/1‑141 (MQ=255) aGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCttt > 2:516952/1‑141 (MQ=255) tGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAAc < 2:609319/141‑1 (MQ=255) tGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAAc > 1:220169/1‑141 (MQ=255) tGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAAc < 1:292949/141‑1 (MQ=255) tGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAAc < 1:226261/141‑1 (MQ=255) cACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTg < 2:615669/141‑1 (MQ=255) aCGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGc > 2:784909/1‑141 (MQ=255) aCGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGc < 2:446009/141‑1 (MQ=255) aCGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGc < 1:68209/141‑1 (MQ=255) cGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGct < 2:492598/141‑1 (MQ=255) cGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGct < 1:288271/141‑1 (MQ=255) aCATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGcttct > 1:479397/1‑141 (MQ=255) cATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGcttctt < 1:44711/141‑1 (MQ=255) aTGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCttt > 1:714041/1‑141 (MQ=255) tgattgatATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCtttt < 2:770836/141‑1 (MQ=255) attgatATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACAACATCACATAATTCTTCAACATGCCCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACGGCGCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTGtaa < 2:303176/141‑1 (MQ=255) atatCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAAc > 1:184372/1‑141 (MQ=255) atCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTc < 1:176751/141‑1 (MQ=255) tCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTAACTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCACCATGCTCCAGACGGTTAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATGTAAGTCTTGAACCGATTCTTTTAATACCTCa < 2:283089/141‑1 (MQ=255) cACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCaa > 1:674997/1‑141 (MQ=255) cACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCaa < 1:591734/141‑1 (MQ=255) cACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGCCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCaa > 2:567491/1‑141 (MQ=255) aCCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAAc < 1:129282/141‑1 (MQ=255) aCCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAAc < 2:360567/141‑1 (MQ=255) gaattactaatattagatgagcctttcagtggtctagacccagttaatgttgagttattaaaagaagcagttaaagactTAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTaa < 2:303103‑M1/37‑1 (MQ=255) gaattactaatattagatgagcctttcagtggtctagacccagttaatgttgagttattaaaagaagcagttaaagactTAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTaa > 1:303103‑M1/80‑116 (MQ=255) aacaacAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAAc < 2:145034/141‑1 (MQ=255) acaacaAGTTGACCTATATCTAAAATACAATCATAATCACATAATTCTTCAACATGCCCCATACGGTTAGAACTATAAACGATTGTACTACCCCAATCAGTTCAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACt > 2:24889/1‑141 (MQ=255) caacaaGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTg < 1:47991/141‑1 (MQ=255) aacaaGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTgg > 1:530294/1‑141 (MQ=255) aacaaGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTgg > 1:406834/1‑141 (MQ=255) caaGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGt > 2:152793/1‑141 (MQ=255) ttGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAg < 1:147419/141‑1 (MQ=255) tGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGa > 1:10602/1‑141 (MQ=255) tGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGa < 1:420436/141‑1 (MQ=255) aCCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGAcc > 1:456636/1‑141 (MQ=255) aCCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGAcc > 1:47994/1‑141 (MQ=255) ccTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCa < 1:481298/141‑1 (MQ=255) ccTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCa > 1:30119/1‑141 (MQ=255) aaTACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTc > 1:680760/1‑141 (MQ=255) aaTACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTc < 2:785281/141‑1 (MQ=255) catcaCATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTa < 1:430185/141‑1 (MQ=255) acaTAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTATCTGGGCCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTaa < 1:433730/141‑1 (MQ=255) caTAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAAt > 1:650511/1‑141 (MQ=255) aTAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACCTTAACTGGGTCTCGACAACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAAtt < 2:234173/141‑1 (MQ=255) aTAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAAtt > 2:372814/1‑141 (MQ=255) aaTTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCt < 1:461290/141‑1 (MQ=255) ttcttcAACGTGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACGCGACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAGTATTAGTAATTCTgg < 2:93690/141‑1 (MQ=255) ttcAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGttt > 2:531186/1‑141 (MQ=255) tcAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTa > 2:131526/1‑141 (MQ=255) tcAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTa > 1:717353/1‑141 (MQ=255) aCATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGt > 2:279213/1‑141 (MQ=255) tGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCACAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAAc < 2:123431/141‑1 (MQ=255) cTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTACGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACAt > 1:377757/1‑141 (MQ=255) tCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATa > 2:385345/1‑141 (MQ=255) tCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATa < 2:30119/141‑1 (MQ=255) ccATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATAc < 2:781326/141‑1 (MQ=255) ccATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATAc < 2:781259/141‑1 (MQ=255) ttaaagacttaaatgattggggcagtacaatcgtttaAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTc < 2:303103‑M2/79‑1 (MQ=255) ttaaagacttaaatgattggggcagtacaatcgtttaAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTc > 1:303103‑M2/38‑116 (MQ=255) gaACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGc > 2:274327/1‑141 (MQ=255) gcTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTg < 2:475526/140‑1 (MQ=255) cTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTATCTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGa < 2:367929/141‑1 (MQ=255) cTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGa < 1:716200/141‑1 (MQ=255) tataAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTAGCTAACAGCTGaa < 2:313587/141‑1 (MQ=255) AACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAAtttt < 1:751675‑M1/141‑1 (MQ=255) tgattggggcagtacaatcgtttaAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGGCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTATTTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAAtttttt > 2:286883‑M2/25‑141 (MQ=255) ctaTTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAAtttttt < 2:596660/139‑1 (MQ=255) tGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCGCTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTttgttt > 2:545912/1‑140 (MQ=255) tGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTttgttg < 1:281179/141‑1 (MQ=255) tGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTttgttg < 1:281129/141‑1 (MQ=255) gTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGa < 1:63357/141‑1 (MQ=255) aCTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGAtt > 1:335704/1‑141 (MQ=255) cTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTTCTAACAGCTGAATTTTttgttttttt > 1:131942/1‑136 (MQ=255) cTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTc > 2:123087/1‑141 (MQ=255) gCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTccc < 1:352179/141‑1 (MQ=255) ccccAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCt > 1:224677/1‑141 (MQ=255) aaTCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAGCTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTg > 2:728156/1‑141 (MQ=255) aaTCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTg < 2:647618/141‑1 (MQ=255) aTCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTGa < 2:10602/141‑1 (MQ=255) ttaAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTGATAGAc < 1:348981‑M2/138‑1 (MQ=255) ttaAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTGATAGAc < 1:680929‑M2/138‑1 (MQ=255) aAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTGATAGACTa < 2:657950‑M2/140‑1 (MQ=255) aAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTGATAGACTa < 1:463946‑M2/140‑1 (MQ=255) aGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTGATAGACTAt > 1:386609/1‑141 (MQ=255) | CATTAGATGCACGTACATGATTGATATCACCAGAAACAACAAGTTGACCTTTATCTAAAATACAAACATCATCACATAATTCTTCAACATGCTCCATACGGTGAGAACTATAAACGATTGTACTGCCCCAATCATTTAAGTCTTTAACTGCTTCTTTTAATAACTCAACATTAACTGGGTCTAGACCACTGAAAGGCTCATCTAATATTAGTAATTCTGGTTTATGTAACATACTTGCTAACAGCTGAATTTTTTGTTGATTCCCTTTTGATAGACTAT > CP000730/2460611‑2460889 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |