New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | CP000730 | = 2533585 | 79 (1.300) | intergenic (+81/+16) | murN/tcyC | FemAB family peptidoglycan biosynthesis protein/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
AGCCTATCAAACCATTACTATATAAGGTACAAACGTACTTAAATCATAAACGTCGTTAAAATATCGCTCCAAGATTATGACAACATAACAAAGAACCACGCATCATGTATATGGCTTCATCGCCATACTAAAACATGATACGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAG‑CCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGTTATTAGAT > CP000730/2533446‑2533724 | aGCCTATCAAACCATTACTATATAAGGTACAAACGTACTTAAATCATAAACGTCGTTAAAATATCGCTCCAAGATTATGACAACATAACAAAGAACCACGCATCATGTATATGGCTTCATCGCCATACTAAAACATGATAc < 2:44246‑M2/141‑2 (MQ=255) aTCAAACCATTACTATATAAGGTACAAACGTACTTAAATCATAAACGTCGTTAAAATATCGCTCCAAGATTATGACAACATAACAAAGAACCACGCATCATGTATATGGCTTCATCGCCATACTAAAACATGATAcgtggt > 1:72158‑M2/1‑135 (MQ=255) aTCAAACCATTACTATATAAGGTACAAACGTACTTAAATCATAAACGTCGTTAAAATATCGCTCCAAGATTATGACAACATAACAAAGAACCACGCATCATGTATATGGCTTCATCGCCATACTAAAACATGATAcgtggt > 1:527310‑M2/1‑135 (MQ=255) cAAACCATTACTATATAAGGTACAAACGTACTTAAATCATAAACGTCGTTAAAATATCGCTCCAAGATTATGACAACATAACAAAGAACCACGCATCATGTATATGGCTTCATCGCCATACTAAAACATGATAcgtggttc > 1:53638‑M2/1‑133 (MQ=255) 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2:704687/141‑1 (MQ=255) atgatgCGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAG‑CCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGttatt > 1:764667/1‑141 (MQ=255) aTGATACGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAG‑CCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGttatt > 2:201818/1‑141 (MQ=255) aTACGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAGCCCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGTTATTAg > 2:438383/1‑141 (MQ=255) aTACGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAG‑CCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGTTATTAGa > 2:580441/1‑141 (MQ=255) tACGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAG‑CCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGTTATTAGAt < 1:690134/141‑1 (MQ=255) tACGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAG‑CCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGTTATTAGAt < 1:660104/141‑1 (MQ=255) tACGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAG‑CCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGTTATTAGAt < 2:639574/141‑1 (MQ=255) | AGCCTATCAAACCATTACTATATAAGGTACAAACGTACTTAAATCATAAACGTCGTTAAAATATCGCTCCAAGATTATGACAACATAACAAAGAACCACGCATCATGTATATGGCTTCATCGCCATACTAAAACATGATACGTGGTTCTATTTGATTATTCTTCATTTATAACATTTAAGAAACGTCTTAATTCTTCTGTTTTCGGACGATTGAACATCTCTTCTGGAG‑CCCCTTGTTCTCCGATCATGCCTTCATGAATAAATACAATGTTATTAGAT > CP000730/2533446‑2533724 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |