| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 3,152,792 | Δ3 bp | 2.5% | coding (557‑559/1188 nt) | metC → | cystathionine beta‑lyase, PLP‑dependent |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3152791 | 119 (1.030) | 3 (0.030) | 3/544 | NT | 2.5% | coding (556/1188 nt) | metC | cystathionine beta‑lyase, PLP‑dependent |
| ? | NC_000913 | 3152795 = | 119 (1.040) | coding (560/1188 nt) | metC | cystathionine beta‑lyase, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GGGCGGCAGCGGTTGCTAATTCCATTCTTGCTTTTATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGCTGTTTAAGGCGCTGGATTTTGGCATCGATGTTTCTATTCAAGCCGCCACCAAATATCTGGTTGGGCATTCAGATGCGATGATTGGCACTGCCGTGTGCAATGCCCGTTGCTGGGAGCAGCTACGGGAAAATGCCTATCTGATGGGCCAGATGGTCGATGCCGATACCGCCTATATAACCAGCCGTGGCCTGCGCACATTAGGTGTGCGTTTGCGTCAACATCATGAAAGCAGTCTGAAAGTGGCTGAATGGCTGGCAGAACATCCGCAAGTTGCGCGA > NC_000913/3152492‑3153090 | gggCGGCAGCGGTTGCTAATTCCATTCTTGCTTTTATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTCACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTTCCGGATTCCATCATTTTGATCTacaa > 1:720459/1‑301 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cgtgttcTAATTCCATTCTGTCTTTTTTCAACCGTGGCGAGCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGGGTCAGGATTTCTGGAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATAACGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTGCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGc < 2:938883/295‑1 (MQ=255) cGGTTGCTAATTCCATTCTTGCTTTTATCAAACAGTGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCTAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGc < 2:889127/301‑1 (MQ=255) cccATTCTTGCTTTTAACGAACAGGGGGGTCATGTGTTTATGAACAACACCGACTATGAACCGAGGCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCTTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGc < 1:662536/300‑1 (MQ=255) 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cacctgggcagccggtgtgctgtttaaggcgctggattttggcatcgatgtttctattcaagccgccaccaaatatctggttgggcattcagatgcgatgattggcactgccgtgtgcaatgcccgttgctgggagcagctacgggaaaatgcctatctgatgggccagatggtcgatgccgataccgcctatataaccagccgtggcctgcgcacattaggtgtgcgtttgcgtcaacatcatgaaagcagtctgaaagtggctgaatggctggcagaacatccgcaagttgcgcgagtt > 2:266626‑M1/1‑2 (MQ=255) | GGGCGGCAGCGGTTGCTAATTCCATTCTTGCTTTTATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGCTGTTTAAGGCGCTGGATTTTGGCATCGATGTTTCTATTCAAGCCGCCACCAAATATCTGGTTGGGCATTCAGATGCGATGATTGGCACTGCCGTGTGCAATGCCCGTTGCTGGGAGCAGCTACGGGAAAATGCCTATCTGATGGGCCAGATGGTCGATGCCGATACCGCCTATATAACCAGCCGTGGCCTGCGCACATTAGGTGTGCGTTTGCGTCAACATCATGAAAGCAGTCTGAAAGTGGCTGAATGGCTGGCAGAACATCCGCAAGTTGCGCGA > NC_000913/3152492‑3153090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |