Predicted mutation | |||||||
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JC | NC_000913 | 3,152,792 | Δ3 bp | 2.5% | coding (557‑559/1188 nt) | metC → | cystathionine beta‑lyase, PLP‑dependent |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3152791 | 119 (1.030) | 3 (0.030) | 3/544 | NT | 2.5% | coding (556/1188 nt) | metC | cystathionine beta‑lyase, PLP‑dependent |
? | NC_000913 | 3152795 = | 119 (1.040) | coding (560/1188 nt) | metC | cystathionine beta‑lyase, PLP‑dependent |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GGCAGCGGTTGCTAATTCCATTCTTGCTTTTATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGCTGTTTAAGGCGCTGGATTTTGGCATCGATGTTTCTATTCAAGCCGCCACCAAATATCTGGTTGGGCATTCAGATGCGATGATTGGCACTGCCGTGTGCAATGCCCGTTGCTGGGAGCAGCTACGGGAAAATGCCTATCTGATGGGCCAGATGGTCGATGCCGATACCGCCTATATAACCAGCCGTGGCCTGCGCACATTAGGTGTGCGTTTGCGTCAACATCATGAAAGCAGTCTGAAAGTGGCTGAATGGCTGGCAGAACATCCGCAAGTTGCGCGAGTT > NC_000913/3152496‑3153093 | ggaaGCGGTTGCTAATTCCATTCTTGCTTTTATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAacac < 1:723250/297‑1 (MQ=255) 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tCCATTCTTGCTTTTATCGAAAAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTAAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGc < 1:270402/301‑1 (MQ=255) tCTTTCTTTTATCTACCAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGCTGttt < 1:816943/301‑1 (MQ=255) tttttATCGAACAGGGCGATCATGTTTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGATTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGCTGTTTAAGgc < 1:633252/300‑1 (MQ=255) cTTTTATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGCTGTTTAAGgc < 2:66670/301‑1 (MQ=255) ttATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACAcc < 2:618700/272‑1 (MQ=255) ttATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACAATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACAcc > 1:618686/1‑272 (MQ=255) 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1:797165/147‑1 (MQ=255) acaacaCCTCGGCAGCCGGTGTGCTGTTTAAGGCGCTGGATTTTGGCATCGATGTTTCTATTCAAGCCGCCACCAAATATCCGGTTGGGCATTCAGATGCGATGATTGGCACTGCCGTGTGCAATGCCCGTTGCTGGGAGCAGCTACGGGAAAATGCCTATCTGATGGGCCAGATGGTCGATGCCGATACCGCCTATATCACCAGCCGTGGCCTGCGCACATTTGGTTTGCCTGTGCGTCAATATCATGAAAGCAGTCTGAAAGTGTCTGaaagccacgcaatacctacgcagagtgcgcg > 1:682144/1‑272 (MQ=255) | GGCAGCGGTTGCTAATTCCATTCTTGCTTTTATCGAACAGGGCGATCATGTGTTGATGACCAACACCGCCTATGAACCGAGTCAGGATTTCTGTAGCAAAATCCTCAGCAAACTGGGCGTAACGACATCATGGTTTGATCCGCTGATTGGTGCCGATATCGTTAAGCATCTGCAGCCAAACACTAAAATCGTGTTTCTGGAATCGCCAGGCTCCATCACCATGGAAGTCCACGACGTTCCGGCGATTGTTGCCGCCGTACGCAGTGTGGTGCCGGATGCCATCATTATGATCGACAACACCTGGGCAGCCGGTGTGCTGTTTAAGGCGCTGGATTTTGGCATCGATGTTTCTATTCAAGCCGCCACCAAATATCTGGTTGGGCATTCAGATGCGATGATTGGCACTGCCGTGTGCAATGCCCGTTGCTGGGAGCAGCTACGGGAAAATGCCTATCTGATGGGCCAGATGGTCGATGCCGATACCGCCTATATAACCAGCCGTGGCCTGCGCACATTAGGTGTGCGTTTGCGTCAACATCATGAAAGCAGTCTGAAAGTGGCTGAATGGCTGGCAGAACATCCGCAAGTTGCGCGAGTT > NC_000913/3152496‑3153093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |