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2:1015406/1‑140 (MQ=255) gtgGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCAc < 1:1015354/140‑1 (MQ=255) | CAATAGAACGAAACGAATATTGATAAATGTTCCAGGTATTTATAGTGACAGTTTTTGGGCGTCTATAATACGTGGAGAACTATCAGAGCTTTCACAGCCTACAGATGATGAATCGCTTCTGAATATGAGGGTTAGTAAATTAATTAAGAAAACGTTGAGTCAACCCGAGGGCTCCAGGAAACCAGTTGAGGTAGAAAGACTACAAAAAGTTTATGTCCGAGACCCGATGGTAAAAGCTTGGATTTTACAGCAAAGTAAAGGTATATGTGAAAACTGTGGTAAAAATGCTCCGTTTTATTTAAATGATGGAAACCCATATTTGGAAGTACATCATGTAATTCCCCTGTCTTCAGGTGGTGCTGATACAACAGATAACTGTGTTGCCCTTTGTCCGAATTGCCATAGAGAATTGCACTATAGTAAAAATGCAAAAGAACTAATCGAGATGCTTTACGTTAATATAAAC > NC_000913/1210699‑1211164 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |