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cGGCCTCTTTTATTTTTGCAGGGTTTGTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTTGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTGTGCACGATCGGTTTTACCACTTCAATCt < 1:797888/300‑1 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATAc < 1:391793/135‑1 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATAc > 2:391800/1‑135 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTc > 1:529989/1‑151 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTc < 2:529999/151‑1 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTGTGCAc > 2:183752/1‑271 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTGTGCACGATCGGTTTTACCACTTCAATCTGGTCttt > 2:651633/1‑299 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTATTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGt < 2:836873/249‑1 (MQ=255) ctTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACAAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTATTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGt > 1:836840/1‑249 (MQ=255) | GTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCATTATGCTAATGCCTTACTGAATTATGAAGCATTTCTTAAGTATCCAACTTTAGCTAGATTAATGGTTTATTATTTTCTACATCTTCAATATATAAAAGCGTATTATCAATGGCGTAGTAACTGCGTTTGTTATGATTAACATCAGTAACCCACCGGAAAACGCCCGCGCCTGCCAGTGTTGAACAGTATTCCCGAAATGTAGATTTTCCGCAAATATGAAGCAATGCGGCCTCTTTTATTTTAGCAGGGTTCTTGGTCGTACTAACTTTTAACAGGTTCCTGGTTCCTCTTAATAACAAAACCGTATCATCGTGAGTAATAATTCTGATGTTATCCGTAGCCAGATAATAAATGTAATGTGCAATACGGTGATGTTTTAATTCTGAATAAAACCAGGAGAAGTTTTGCTCTTTTCTCACTTGCTCAAACATCTTTTGAAAAACAACGACCTGATCCATCAGGATAATAACCTCTTGTTAGTTGTGAGACTGCGTAGTGTGCACGATCGGTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGT > NC_000913/1212607‑1213182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |